Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 687,473 | C→T | 5.5% | S113L (TCG→TTG) | ydgK → | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 687,473 | 0 | C | T | 5.5% | 222.7 / 2.5 | 72 | S113L (TCG→TTG) | ydgK | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base T (2/2); total (36/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
GACCGCTTTGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCC > NC_002947/687325‑687619 | gACCGCTTTGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTc > 5:180131/1‑149 (MQ=255) gCTTTGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCgg < 4:336335/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCggg < 5:14090/149‑1 (MQ=255) tttGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCATTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGc > 5:7395/1‑149 (MQ=255) ccGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCg > 8:384336/1‑149 (MQ=255) cgtcGCACACCTATGATGTTCTGCGTTACGCTGTTCACCCTTGCATCACTGGCCTGTGCCTACTCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGt < 8:327814/146‑1 (MQ=255) cGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTTGCGGGCCATCGt > 5:28380/1‑149 (MQ=255) cGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTTGCGGGCCATCGt > 5:34412/1‑149 (MQ=255) cGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGt > 8:156708/1‑146 (MQ=255) cGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCa < 7:156708/148‑1 (MQ=255) gCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGc > 3:46036/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGa > 7:26706/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGa > 2:149960/1‑148 (MQ=255) gCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTTGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGt < 6:28380/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTTGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGt < 6:34412/149‑1 (MQ=255) gCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCATTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTa < 6:7395/149‑1 (MQ=255) ttACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCt < 1:149960/149‑1 (MQ=255) ttACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTAATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGAGACCCGGTAGCt > 5:349859/1‑149 (MQ=255) ttACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGAAACCATGGAGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTc > 7:354706/1‑112 (MQ=255) aCGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCtt < 4:184036/148‑1 (MQ=255) cGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCa < 4:19581/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGcc > 7:72007/1‑148 (MQ=255) cACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCaaa < 8:72007/148‑1 (MQ=255) aCCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCCAAgt > 2:409140/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAgt < 8:26706/149‑1 (MQ=255) ccTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCgg > 4:284793/1‑131 (MQ=255) ccTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCgg < 3:284793/131‑1 (MQ=255) tGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGAc > 3:5670/1‑125 (MQ=255) tGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGAc < 4:5670/125‑1 (MQ=255) aTCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGCTTTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCg > 1:106672/1‑149 (MQ=255) aTCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGc < 5:380224/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTa < 6:241649/122‑1 (MQ=255) tGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTa > 5:241649/1‑122 (MQ=255) gCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGAt > 5:13292/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGc < 2:49472/149‑1 (MQ=255) ccTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCaaa < 2:284873/125‑1 (MQ=255) ccTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCaaa > 1:284873/1‑125 (MQ=255) ccTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGt > 1:405320/1‑148 (MQ=255) aCGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATg > 4:389700/1‑149 (MQ=255) cccAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCgg > 1:263238/1‑103 (MQ=255) cccAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCgg < 2:263238/103‑1 (MQ=255) aaCCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTc > 6:63936/1‑122 (MQ=255) aaCCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTc < 5:63936/122‑1 (MQ=255) ccTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGgcgc < 6:180131/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTgg < 2:405320/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTgg > 3:84743/1‑149 (MQ=255) gtggtggCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCAcc < 4:84743/149‑1 (MQ=255) tggCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGACGATCCTGGCACCGATg > 5:189392/1‑149 (MQ=255) gcgc‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTtgg > 8:133999/1‑149 (MQ=255) gc‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTCGTCATGGGCTTGGCGCCGAACCTGGCACCGATGTtgggt > 7:63874/1‑149 (MQ=255) c‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCTAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTtgggtg < 1:409140/149‑1 (MQ=255) c‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTggggtg > 6:322393/1‑149 (MQ=255) ttCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGTACCGATGtt > 6:399596/1‑143 (MQ=255) ttCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGTACCGATGtt < 5:399596/143‑1 (MQ=255) ttCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTtgggtgg < 4:46036/149‑1 (MQ=255) aTCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATgg < 7:153589/112‑1 (MQ=255) aTCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATgg > 8:153589/1‑112 (MQ=255) tCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGAGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTgggtggggtg > 5:114311/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGc > 4:350002/1‑149 (MQ=255) cAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCt > 4:149544/1‑149 (MQ=255) gCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGt < 3:350002/149‑1 (MQ=255) gtggtTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTg > 4:389325/1‑149 (MQ=255) tggtTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTgg < 3:389325/149‑1 (MQ=255) gtTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGcc > 3:85475/1‑149 (MQ=255) tgCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGGGCTGGTGAACCTGGCCGGc < 3:220525/148‑1 (MQ=255) cATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTtg < 6:220631/115‑1 (MQ=255) cATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTtg > 5:220631/1‑115 (MQ=255) tGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCg < 3:149544/149‑1 (MQ=255) tGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATc < 7:133999/149‑1 (MQ=255) tttCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTc > 8:153689/1‑149 (MQ=255) tttCGCGGGACATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTc > 6:264928/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTcc < 2:106672/148‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTc < 6:13292/147‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTc < 3:389700/147‑1 (MQ=255) | GACCGCTTTGGCCGACGCAAACCGCTGATGTTCGGCGTTACGCTGTTCACCCTGGCATCACTGGCCTGTGCCTACGCCCCCAACCTCGATACCTTGGTGGTGGCGCGC‑TTCATCCAGGCACTGGGTGGTTGTGCCGGCATGGTGCTTTCGCGGGCCATCGTCAGCGACAAGTGCGACCCGGTAGCTTCAGCCAAAGTGTTTTCGCAACTGATGCTGGTCATGGGCTTGGCGCCGATCCTGGCACCGATGTTGGGTGGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCC > NC_002947/687325‑687619 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |