| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 886,083 | G→C | 5.3% | W665S (TGG→TCG) ‡ | PP_0767 → | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 886,083 | 0 | G | C | 5.3% | 245.4 / 3.9 | 75 | W665S (TGG→TCG) ‡ | PP_0767 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/34); new base C (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.05e-01 | |||||||||||
TGCGCGCGGGGCTGGGCGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCCGGCGGCGGC > NC_002947/885936‑886224 | tGCGCGCGGGGGTGGGCGAGGCGCGTGGGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCTTCGGTGATTGCGTGTTTGCCACGCTCGATGGCCGGGATGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGTGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTg < 7:60124/148‑1 (MQ=255) gcgcgcGGGGCTGGGCGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTgg < 3:283926/148‑1 (MQ=255) tGGGCGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCg < 5:142674/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGCGCGAGCGTGTCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGt > 5:269594/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGt < 7:146100/149‑1 (MQ=255) cGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGAAGCACATCTGGGATGTGCCCCCg > 6:409660/1‑145 (MQ=255) cGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGAAGCACATCTGGGATGTGCCCCCg < 5:409660/145‑1 (MQ=255) aGGCGCGAGCGTGTCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTctac < 6:269594/149‑1 (MQ=255) gcgAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCCCAGATGTGcatcaagc < 8:171439/141‑8 (MQ=255) gcgAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCCCAGATGTGcatcaagc > 7:171439/1‑134 (MQ=255) gAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTg > 7:290966/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTgg < 2:67555/149‑1 (MQ=255) gggACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGAt > 8:362649/1‑148 (MQ=255) ggACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTa < 3:205335/149‑1 (MQ=255) gACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTgg > 1:76531/1‑139 (MQ=255) gACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTgg < 2:76531/139‑1 (MQ=255) aCATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTAcc > 8:19499/1‑149 (MQ=255) aTCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCt > 5:374000/1‑149 (MQ=255) aGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTgg > 7:97413/1‑148 (MQ=255) gtgtGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGt > 5:279705/1‑148 (MQ=255) tgtgCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTc > 7:36651/1‑148 (MQ=255) tgCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCaaa > 8:60701/1‑149 (MQ=255) gCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGAtgt > 2:269473/1‑108 (MQ=255) gCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGAtgt < 1:269473/108‑1 (MQ=255) cTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAAt < 8:290966/148‑1 (MQ=255) cTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATg > 4:389557/1‑149 (MQ=255) tCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGc > 6:28069/1‑149 (MQ=255) aTCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGc < 7:362649/147‑1 (MQ=255) aTCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCg > 8:7827/1‑148 (MQ=255) tCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGAt > 8:50934/1‑101 (MQ=255) tCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGAt < 7:50934/101‑1 (MQ=255) tCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGaa < 6:279705/149‑1 (MQ=255) gTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCaaa < 6:235422/140‑1 (MQ=255) gTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCaaa > 5:235422/1‑140 (MQ=255) tCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATCACCCTGGTCAAATGCGAACtgt < 7:60701/149‑1 (MQ=255) cATTGCGTGATAGCCACGATCGATGGCCGCGAAGGTCACTTTGCCGAGCCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGACGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACATGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACtgtg > 4:270402/1‑149 (MQ=255) aTTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACtgtg < 6:381909/148‑1 (MQ=255) ttGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGtggc > 6:273836/1‑149 (MQ=255) gCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGtggctg > 6:278697/1‑149 (MQ=255) cGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGtggctgg > 1:105584/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAgggg > 8:220893/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAgggg > 6:44838/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAggg < 5:278697/148‑1 (MQ=255) aCGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCg > 5:315156/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACg < 8:36651/147‑1 (MQ=255) gATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGa > 1:228111/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGa < 2:228111/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGAc < 5:273836/149‑1 (MQ=255) gggAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTcgcg < 6:315156/149‑1 (MQ=255) gggAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTcgcg < 7:19499/149‑1 (MQ=255) gTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTcgcg > 1:89841/1‑143 (MQ=255) gTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTcgcg < 2:89841/143‑1 (MQ=255) gTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGAACGGACCTCGCGGAGTcc > 3:205788/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGCGGCCTTTGCGGCGGGGCCCGTGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGc < 1:206528/149‑1 (MQ=255) cGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAgc > 5:386547/1‑149 (MQ=255) gAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAgcg > 6:188867/1‑149 (MQ=255) tttGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGa < 6:338612/119‑1 (MQ=255) tttGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGa > 5:338612/1‑119 (MQ=255) cGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGAACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCa < 4:205788/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTgg < 6:327492/141‑1 (MQ=255) aGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTgg > 5:327492/1‑141 (MQ=255) gccgaggccgagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATg < 7:7827/148‑1 (MQ=255) gaggccgagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATggcgg > 5:338260/1‑149 (MQ=255) aggccgagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATggcggc > 3:78340/1‑149 (MQ=255) gccgagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGa < 8:97413/149‑1 (MQ=255) gccgagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGa < 6:374000/149‑1 (MQ=255) gagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGagca < 3:226896/149‑1 (MQ=255) gagCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGagca < 2:105584/149‑1 (MQ=255) ggggCACATCCCAGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCCGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTgg > 6:390117/4‑119 (MQ=255) ggggCACATCCCAGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCCGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTgg < 5:390117/116‑1 (MQ=255) gATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcgg > 8:62466/1‑149 (MQ=255) tGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcggcg > 1:170421/1‑149 (MQ=255) gCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcggcgg > 8:296021/1‑149 (MQ=255) cacaTCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcggcgg < 4:78340/148‑1 (MQ=255) cacaTCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCCggcggcggc < 3:389557/149‑1 (MQ=255) acaTCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcgg > 2:407020/1‑144 (MQ=255) acaTCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCcggcgg < 1:407020/144‑1 (MQ=255) | TGCGCGCGGGGCTGGGCGAGGCGCGAGCGTGCCGGGACATCAGTGTGCTCATCGGTCATTGCGTGATTGCCACGCTCGATGGCCGGGAAGGTCACTTTGCCGAGGCCTTTGCGGAGCTGGCCGAGGCCGAGCGCTTGATGCACATCTGGGATGTGCCCCCGGTCTACTACCTGGCCATGATTACCCTGGTCAAATGCGAACTGTGGCTGGCCCAGGGGCGTACGGACCTCGCGGAGTCCTGGCTGCAGCGCCTGGGCCAGACCTATGGCGGCGAGCAGCCGGCGGCGGC > NC_002947/885936‑886224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |