| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 891,587 | C→A | 5.5% | intergenic (+40/+40) | yiaD → / ← pta | OmpA/MotB domain‑containing protein/phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 891,587 | 0 | C | A | 5.5% | 243.1 / 3.3 | 73 | intergenic (+40/+40) | yiaD/pta | OmpA/MotB domain‑containing protein/phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/39); new base A (2/2); total (32/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
CCAATGGTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTGCGCAAACCCTGC > NC_002947/891450‑891732 | ccAATGGTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTcc < 6:163422/149‑1 (MQ=255)ccAATGGTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTcc > 8:354443/1‑149 (MQ=255)ccAATGGTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTcc < 1:47355/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTGAGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCACGATCCcac > 8:343905/1‑148 (MQ=255) gTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACaa < 3:252026/148‑1 (MQ=255) tCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAgg < 4:350389/149‑1 (MQ=255) tCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAgg < 2:199736/149‑1 (MQ=255) tCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAgg < 2:193385/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCtt < 7:311060/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCtt < 2:343158/149‑1 (MQ=255) gcAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGc > 8:126383/1‑148 (MQ=255) aaCCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCtt > 7:239986/1‑142 (MQ=255) aaCCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCtt < 8:239986/142‑1 (MQ=255) gccgTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTc < 2:1936/127‑1 (MQ=255) gccgTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTc > 1:1936/1‑127 (MQ=255) gtgtGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGCCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCctct > 6:350786/1‑149 (MQ=255) tgGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGc < 4:219977/142‑1 (MQ=255) tgGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGc > 3:219977/1‑142 (MQ=255) gAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCttt < 8:267609/149‑1 (MQ=255) aGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCca < 7:40948/120‑1 (MQ=255) aGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCca > 8:40948/1‑120 (MQ=255) gCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAaagaa < 2:308841/124‑1 (MQ=255) gCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAaagaa > 1:308841/1‑124 (MQ=255) gCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCt > 3:276729/1‑149 (MQ=255) gCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCt > 2:10224/1‑149 (MQ=255) cGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGaa < 5:113854/149‑1 (MQ=255) gggTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAAt < 8:347843/149‑1 (MQ=255) agcagTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGaa > 5:359878/1‑143 (MQ=255) agcagTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGaa < 6:359878/143‑1 (MQ=255) agTATGAGCAGCAAGGTGAGGTTCAGCAGTATCTCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GTTGGCTGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCa < 3:51027/149‑1 (MQ=255) gTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAaagaa > 6:15089/1‑106 (MQ=255) gTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAaagaa < 5:15089/106‑1 (MQ=255) gTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAg > 2:150366/1‑149 (MQ=255) tGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAggg < 1:22228/148‑1 (MQ=255) agcaAGGTGAGGTTCAGCAGTATCGCTGATTGACCTTAAGGGCCGGTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGGTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGGCTCTGCTTTTAGGGCGCCACGCTGGCCTTAATCTCCGTCAGGGCTATgg < 3:29540/149‑1 (MQ=255) aaGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTAt < 7:27057/149‑1 (MQ=255) aGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATg > 4:365312/1‑149 (MQ=255) aGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACg < 5:154487/148‑1 (MQ=255) aGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGa < 7:354443/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCt > 8:67754/1‑117 (MQ=255) gTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCt < 7:67754/117‑1 (MQ=255) ttCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGatat < 4:276729/149‑1 (MQ=255) cagcagTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATc < 7:126383/148‑1 (MQ=255) cagcagTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATc < 2:251580/148‑1 (MQ=255) agcagTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCg < 5:350786/148‑1 (MQ=255) cTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGt < 1:62925/139‑1 (MQ=255) cTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGt > 2:62925/1‑139 (MQ=255) cTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTgcgc < 1:10224/149‑1 (MQ=255) gATTGACCTTAAGGGGCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGcc < 2:60309/109‑1 (MQ=255) gATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGTGGGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGcc > 1:60309/1‑110 (MQ=255) aTTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCACGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGccc < 7:343905/148‑1 (MQ=255) ccTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTcgcg > 4:210679/1‑149 (MQ=255) ccTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTcgcg > 3:291225/1‑149 (MQ=255) cTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCgg > 6:178453/1‑149 (MQ=255) ttAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCgg > 3:82337/1‑148 (MQ=255) tAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGc > 3:385091/1‑148 (MQ=255) aaGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGc < 2:24140/147‑1 (MQ=255) aaGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGc < 1:150366/147‑1 (MQ=255) aGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCaa < 4:82337/148‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTgc < 1:103564/133‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTgc > 2:103564/1‑133 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGt > 8:286208/1‑149 (MQ=255) cGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCGGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCGATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGtt > 3:12285/1‑149 (MQ=255) ttGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCa > 7:292031/1‑138 (MQ=255) ttGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCa < 8:292031/138‑1 (MQ=255) cGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGc < 4:291225/149‑1 (MQ=255) aagccttgt‑gGGAGCGGGACTGCCCGCCCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTc < 6:421558/133‑1 (MQ=38) aagccttgt‑gGGAGCGGGACTGCCCGCCCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTc > 5:421558/7‑139 (MQ=38) ggCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCt > 8:141881/1‑149 (MQ=255) ccttgt‑gGGAGCGGGACTGCCCGCCCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCaa < 7:381602/130‑1 (MQ=255) ccttgt‑gGGAGCGGGACTGCCCGCCCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCaa > 8:381602/4‑133 (MQ=255) tctGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTgc > 3:377281/1‑149 (MQ=255) gggggCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTGCGCaaa > 6:170499/1‑149 (MQ=255) ggcgggcAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTGCGCAAAccc > 8:13356/1‑149 (MQ=255) gggcAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTGCGCAAACCCTgc < 4:385091/149‑1 (MQ=255) | CCAATGGTCGTGCGCAGAACCGCCGTGTGGAAGTGAACCTGAAGCCGATTCCGGGTCAGCAGTATGAGCAGCAAGGTCAGGTTCAGCAGTATCCCTGATTGACCTTAAGGGCCGCTTTGCGGCTCTGT‑GGGGGCGGGCAGTCCCGCTCCCACAAGGCTTGCAAAGAAGCCTCTGCTTTTAGCGCGCCACGCTGGCCTGAATCGCCGTCAGGGCTATGGTATGCACGATATCGTCAACCTGCGCCCCTCGCGGCAAGTCGTTCACCGGCTTGCGCAAACCCTGC > NC_002947/891450‑891732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |