| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 910,492 | C→T | 5.6% | L334L (CTG→TTG) | fruB → | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 910,492 | 0 | C | T | 5.6% | 276.8 / 3.5 | 89 | L334L (CTG→TTG) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/50); new base T (3/2); total (37/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
CGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTCGCGCCCAT > NC_002947/910344‑910640 | cgcACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAgc < 5:82134/149‑1 (MQ=255) ggTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAgctgct > 3:235851/1‑147 (MQ=255) ggTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCa < 3:389858/149‑1 (MQ=255) gTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAg > 1:288349/1‑149 (MQ=255) gTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAg > 7:151073/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTc < 3:57681/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTc > 1:268214/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTc > 3:247512/1‑149 (MQ=255) gCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGc > 5:173004/1‑141 (MQ=255) gCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGc < 6:173004/141‑1 (MQ=255) cAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCAc > 3:241519/1‑149 (MQ=255) cAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCAc > 6:345871/1‑149 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGTCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTg < 5:227948/149‑1 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTc < 6:25154/136‑1 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTc > 5:25154/1‑136 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTg < 8:227708/149‑1 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTg > 1:225697/1‑149 (MQ=255) acaTGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTg > 5:295877/1‑149 (MQ=255) acaTGCCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTg < 8:285897/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCGGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGt > 4:35667/1‑147 (MQ=255) gCTTGCATGTGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAg < 3:167122/149‑1 (MQ=255) cTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAgg < 5:345871/149‑1 (MQ=255) ttGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAgg > 1:394146/1‑148 (MQ=255) ttGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAgg > 8:313272/1‑148 (MQ=255) cATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCAc < 7:313272/148‑1 (MQ=255) cATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACt < 2:268214/149‑1 (MQ=255) cATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACt < 1:205178/149‑1 (MQ=255) cgcgACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGaa < 2:338695/149‑1 (MQ=255) cgACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACt < 7:118899/149‑1 (MQ=255) gACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTg < 3:35667/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTgg < 2:394146/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGc < 2:225697/149‑1 (MQ=255) gTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGt < 4:211203/123‑1 (MQ=255) gTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGt > 3:211203/1‑123 (MQ=255) gCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCa < 3:133801/101‑1 (MQ=255) gCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCa > 4:133801/1‑101 (MQ=255) 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aCTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTg < 4:37450/149‑1 (MQ=255) gCCAAAGGCTTTGAAGGGGTAATCCGTGGGCGCCTGTTCGATAGCGCGGAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCTGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGcc < 5:1817/147‑1 (MQ=255) ccAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGAt < 5:246487/149‑1 (MQ=255) ccAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGAt < 6:412291/149‑1 (MQ=255) cAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATg > 1:378930/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGc < 1:189219/149‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGc < 6:295877/149‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGc > 8:336226/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGc > 3:143299/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGcc > 5:239883/1‑149 (MQ=255) gAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTg < 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< 4:235851/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCTGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTTGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCTCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTa < 6:170550/149‑1 (MQ=255) tgCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTAt < 6:198620/148‑1 (MQ=255) tgCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATc < 6:274685/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCg < 3:16708/149‑1 (MQ=255) gcCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTc < 2:404440/56‑1 (MQ=255) gcCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCa < 5:118798/57‑1 (MQ=255) gcCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCa > 6:118798/1‑57 (MQ=255) 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gcgcAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTg > 4:386614/1‑148 (MQ=255) cgcAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGaa < 5:139928/149‑1 (MQ=255) gcAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAag < 5:11506/149‑1 (MQ=255) cagccagcCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAaga < 3:386614/149‑1 (MQ=255) agccagccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAagag < 3:122659/149‑1 (MQ=255) ccagccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGt < 3:334328/149‑1 (MQ=255) ccagccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGt < 2:279183/149‑1 (MQ=255) ccagccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGt < 8:320511/149‑1 (MQ=255) acagccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGt < 8:292377/148‑1 (MQ=255) agccGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTg > 5:214941/1‑148 (MQ=255) tCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGc > 1:19100/1‑148 (MQ=255) tGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCg < 6:214941/149‑1 (MQ=255) cgagGCTGAGCAGCTTGCTCAGGCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCg > 1:219962/2‑140 (MQ=255) cgagGCTGAGCAGCTTGCTCAGGCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCg < 2:219962/139‑1 (MQ=255) gagGCTGAGCAGCTTGCTCAGGCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCCGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGa < 1:119962/135‑1 (MQ=255) gagGCTGAGCAGCTTGCTCAGGCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCCGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGa > 2:119962/1‑135 (MQ=255) gagCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAAc > 6:266228/1‑113 (MQ=255) gcTGAGCAGCTTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCg > 4:356723/2‑149 (MQ=255) cTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAagag > 1:90763/1‑126 (MQ=255) cTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAagag < 2:90763/126‑1 (MQ=255) aGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTcgc < 4:143299/149‑1 (MQ=255) gctgctCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTc < 7:5784/142‑1 (MQ=255) gctgctCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTc > 8:5784/1‑142 (MQ=255) ctgctCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTCGCGCCCAt > 7:132705/1‑149 (MQ=255) | CGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGCGACCGGCCAAGGTGCTTGCACAACTGGCCAAAGGCTTTGAAGGGGAAATCCGTGTGCGCCTGGTCGATAGCGCGCAGCCAGCCGTATCGGTGAAGAGCCTGAGCAAGCTGCTCAGCCTCGGCGCACGCCGTGGTCAGGCACTGGAACTGGTCGCCGAACCGAGCATCGCTGCCGATGCCTTGCCGGTGCTGCTGGCTGCTATCGAACAAGGCTTGGGTGAAGAGGTGGAACCGCTACCGCAGAGCGTCGCGCCCAT > NC_002947/910344‑910640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |