| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 938,833 | A→G | 5.5% | G2263G (GGT→GGC) | PP_0806 ← | surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 938,833 | 0 | A | G | 5.5% | 222.7 / 2.1 | 73 | G2263G (GGT→GGC) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/42); new base G (2/2); total (29/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 | |||||||||||
CTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGA > NC_002947/938688‑938981 | cTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCg < 8:282569/149‑1 (MQ=255) tAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCgg > 5:264422/1‑149 (MQ=255) gctcgctcGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCa < 4:303155/149‑1 (MQ=255) tcgctcgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCAcc > 4:330373/1‑149 (MQ=255) ctcgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTac < 3:311607/149‑1 (MQ=255) ggggTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTacc < 1:189179/147‑1 (MQ=255) gTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTCGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACcaccac < 3:122703/149‑1 (MQ=255) tGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACcaca > 7:172620/1‑149 (MQ=255) tGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGATCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACcaca < 1:211870/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGGGTGATGGCTGGCGCAGCGATTTTCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGTATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTg < 3:276720/149‑1 (MQ=255) gcggGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCg < 2:29447/149‑1 (MQ=255) ggggTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGAc < 3:51951/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCa < 4:257230/149‑1 (MQ=255) tGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAgt < 1:388012/149‑1 (MQ=255) aTGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAgtgt < 4:147319/149‑1 (MQ=255) tGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGtgtg < 6:264422/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGtt < 7:17145/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTg < 8:11550/149‑1 (MQ=255) gCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATc < 3:293652/149‑1 (MQ=255) gCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATc < 3:330373/149‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgtg < 6:13034/144‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTagat > 5:13034/1‑146 (MQ=255) cACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACtt > 3:277534/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTcc < 5:192399/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTTGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCca < 4:277534/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTa > 4:237201/1‑143 (MQ=255) cGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTa < 3:237201/143‑1 (MQ=255) ggACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt < 8:70538/134‑1 (MQ=255) ggACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt > 7:70538/1‑134 (MQ=255) cGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGTGGTAGGTGCCGGTGGCACCttcacc > 8:290054/1‑95 (MQ=18) cGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGTGGTAGGTGCCGGTGGCACCttcacc < 7:290054/100‑6 (MQ=18) gAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTc > 8:60435/1‑137 (MQ=255) gAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGcc > 4:170199/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCggg < 3:170199/149‑1 (MQ=255) gTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGc > 5:77649/1‑149 (MQ=255) gTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGc > 3:232695/1‑149 (MQ=255) ccATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTg > 3:173531/1‑148 (MQ=255) ccATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGt < 4:173531/149‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTaccac < 7:270080/84‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTaccac > 8:270080/1‑84 (MQ=255) aTCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTAc < 7:133103/149‑1 (MQ=255) tCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTAc > 4:58417/1‑148 (MQ=255) aTGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGt < 7:196902/149‑1 (MQ=255) aTGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGt < 3:58417/149‑1 (MQ=255) aTGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGt < 8:172620/149‑1 (MQ=255) ggCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTg < 5:20941/103‑1 (MQ=255) ggCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTg > 6:20941/1‑103 (MQ=255) ggCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTg < 4:232695/148‑1 (MQ=255) ccacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTAc < 7:360181/138‑1 (MQ=255) ccacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTAc > 8:360181/1‑138 (MQ=255) cacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGc > 3:109506/1‑92 (MQ=255) cacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGc < 4:109506/92‑1 (MQ=255) cacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTgg > 3:68259/1‑149 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGt < 5:138072/117‑1 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGt > 6:138072/1‑117 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCg > 4:178851/1‑145 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCg < 3:178851/145‑1 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCg > 3:119484/1‑149 (MQ=255) agTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGc < 6:77649/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt < 1:144171/92‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt > 2:144171/1‑92 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt < 3:311653/92‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCgt > 4:311653/1‑92 (MQ=255) cGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGccac > 5:230874/1‑148 (MQ=255) gTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGccacca > 4:48612/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGt > 5:222026/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGc < 3:48612/149‑1 (MQ=255) gATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGgctggctg < 4:68259/149‑1 (MQ=255) tGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTggg < 4:119484/149‑1 (MQ=255) gtaGGTGCCGGTGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCTACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTg < 1:47700/146‑1 (MQ=255) gtaGGTGCCGGTGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTg > 2:47700/3‑148 (MQ=255) aGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGtt < 6:230874/149‑1 (MQ=255) ccACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCgg > 3:398371/1‑149 (MQ=255) aCCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGa > 3:69164/1‑149 (MQ=255) | CTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGCGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGT‑GAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGA > NC_002947/938688‑938981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |