| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 990,583 | A→C | 7.8% | D155A (GAC→GCC) | PP_0856 → | lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 990,583 | 0 | A | C | 7.8% | 212.3 / 6.5 | 74 | D155A (GAC→GCC) | PP_0856 | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/33); new base C (2/4); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
TATGGCCTGGTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCAAGGTAGT > NC_002947/990435‑990730 | tATGTCCTGGGCACGCTCGGTAAACTCAAGGCTGATCTCATTGCCCTGGACTCCCGCAACGCTGAGGAGCTTTGGCGCTCTCGCGTGACCAGCGAAGTTCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGa < 2:81649/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGA‑CCAGGACGAt < 1:29191/148‑1 (MQ=255) ccTGGTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATc < 8:36941/149‑1 (MQ=255) gTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGc < 8:29239/147‑1 (MQ=255) gTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGGCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCt < 5:169292/149‑1 (MQ=255) gCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCg > 8:216231/1‑149 (MQ=255) tCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGc > 6:263715/1‑149 (MQ=255) ggTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCt < 6:386024/149‑1 (MQ=255) tACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGCCGATCAGGCGATCGTCCTgg < 3:316889/149‑1 (MQ=255) aaGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATgccgc > 4:297519/1‑149 (MQ=255) tGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGCCGATCAGGCGATCGTCCTgg > 2:266708/1‑137 (MQ=255) tGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGCCGATCAGGCGATCGTCCTgg < 1:266708/137‑1 (MQ=255) aaGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGc < 7:216231/149‑1 (MQ=255) tCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGAc < 2:9025/149‑1 (MQ=255) aTTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGCCGATCAGGCGATCGTCCTgg > 3:389131/1‑130 (MQ=255) aTTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGCCGATCAGGCGATCGTCCTgg < 4:389131/130‑1 (MQ=255) aTTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGAccg > 7:153074/1‑149 (MQ=255) cccTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGCCCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGt > 7:355600/1‑149 (MQ=255) gACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTgg < 3:297519/147‑1 (MQ=255) cAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTAc > 5:415219/1‑148 (MQ=255) aGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGAt < 6:135024/117‑1 (MQ=255) aGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGAt > 5:135024/1‑117 (MQ=255) aGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACg > 2:299564/1‑148 (MQ=255) cGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACt > 3:159227/1‑149 (MQ=255) cGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACt > 5:7627/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTc < 7:91317/149‑1 (MQ=255) gTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCg > 7:390538/1‑149 (MQ=255) gagCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGAGCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgccggc > 3:138966/1‑149 (MQ=255) gagCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgccggc < 4:159227/149‑1 (MQ=255) gagCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgccggc > 3:13403/1‑149 (MQ=255) gagCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTACCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATc > 8:6935/1‑88 (MQ=255) gagCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTACCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATc < 7:6935/88‑1 (MQ=255) agCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgccggcc < 4:69074/149‑1 (MQ=255) agCGGTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgccggcc < 4:13403/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCt < 7:33694/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGa > 3:27167/1‑149 (MQ=255) tCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCt > 2:231427/1‑149 (MQ=255) gcgcgTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGc > 7:146122/1‑149 (MQ=255) gcgcgTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGc < 6:415219/149‑1 (MQ=255) gtgTGACCATCGAAGTGCTGGCCCCTCCTGCCAACAACGGTGAGGTGGTGGTGGTGCAGAGCCAGGACTATCGCCTGATGGGCGTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGt < 4:138966/147‑1 (MQ=255) cgTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTg < 1:299564/149‑1 (MQ=255) gTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTgg < 2:132115/149‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGGTGGATCTAc > 7:339888/1‑113 (MQ=255) cAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCg > 8:168086/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgc > 8:120180/1‑121 (MQ=255) aGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCgc < 7:120180/121‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGtt < 5:411597/99‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGtt > 6:411597/1‑99 (MQ=255) tGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGcc > 3:157180/1‑148 (MQ=255) gCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATc < 7:168086/147‑1 (MQ=255) ccccACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGc > 4:401702/1‑148 (MQ=255) cccACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGcca < 5:263715/149‑1 (MQ=255) caacaaCGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGcc > 6:358653/1‑149 (MQ=255) caacaaCGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGcc > 3:355264/1‑149 (MQ=255) aacaacGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGTTGCCGCCTCTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCg < 7:138443/124‑1 (MQ=255) aacaacGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGTTGCCGCCTCTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCg > 8:138443/1‑124 (MQ=255) caacGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCTCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTgg < 8:153074/149‑1 (MQ=255) aacGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGc > 3:373922/1‑149 (MQ=255) aCGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGc < 8:284226/148‑1 (MQ=255) aCGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGc > 7:284226/1‑148 (MQ=255) cGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCg < 8:146122/149‑1 (MQ=255) gtggtggtggtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTg > 3:243116/1‑138 (MQ=255) gtggtggtggtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTg < 4:243116/138‑1 (MQ=255) gtggtggtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCt < 4:27167/149‑1 (MQ=255) gtggtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCa < 7:125112/103‑1 (MQ=255) gtggtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCa > 8:125112/1‑103 (MQ=255) gtgCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTAc < 4:373922/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGCCGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAATCTCCCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCaa < 8:355600/149‑1 (MQ=255) ccAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCt > 3:336124/1‑135 (MQ=255) ccAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCt < 4:336124/135‑1 (MQ=255) aGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGGTCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCAAgg > 4:373196/1‑147 (MQ=255) aGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCAAgg > 4:378171/1‑147 (MQ=255) aGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCAGGCGGTTggtg < 3:76799/129‑4 (MQ=255) aGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCAGGCGGTTggtg > 4:76799/1‑126 (MQ=255) gACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCAAGGTAGt > 8:46203/1‑149 (MQ=255) | TATGGCCTGGTCATGCTCGGTACCCTCAAGGGTGAAGTCATTGCCCTGGACTCCAGCACCGGTGAGGAGCGTTGGCGCTCGCGCGTGACCAGCGAAGTGCTGGCCCCACCTGCCAACAACGGTGACGTGGTGGTGGTGCAGACCCAGGACGATCGCCTGATCGGCCTGGATGCCGCCACTGGCGACCGCCGTTGGATCTACGAAAACTCGCCGGCCGTGCTGACGCTGCGTGGCACCGGTGCGCCGATCGCCACCAACCGCCTGGCGGTTGCCGGCCTGTCTACCGGCAAGGTAGT > NC_002947/990435‑990730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |