| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 996,022 | T→A | 5.9% | Q525L (CAG→CTG) | PP_0860 ← | sulfite reductase flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 996,022 | 0 | T | A | 5.9% | 263.6 / 5.3 | 85 | Q525L (CAG→CTG) | PP_0860 | sulfite reductase flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/40); new base A (3/2); total (43/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.21e-01 | |||||||||||
TTCTGCAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAGG > NC_002947/995874‑996168 | ttCTGCAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCctgct < 3:236817/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCtgctgc > 7:210333/1‑148 (MQ=255) cAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCtgctgc < 3:220960/146‑1 (MQ=255) cAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCAt > 5:252366/1‑149 (MQ=255) aGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGCCACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAg > 8:388596/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGAGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGTTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAggg < 7:347593/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGggcg > 5:102336/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAATGGCAGCAggagct < 6:321208/149‑5 (MQ=255) gCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGC‑AAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCt > 4:160812/1‑149 (MQ=255) aGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTg > 5:278570/1‑149 (MQ=255) aGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTg > 6:162172/1‑149 (MQ=255) aGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTg > 6:118956/1‑149 (MQ=255) ggTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTgg < 7:293975/149‑1 (MQ=255) gTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGt < 7:340276/149‑1 (MQ=255) 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ggCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTc < 8:166269/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCa < 6:278570/149‑1 (MQ=255) ttGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACtt > 5:62656/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCAcc > 3:169654/1‑149 (MQ=255) cGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAATGGCAGCAgga < 3:281925/117‑2 (MQ=255) cGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAATGGCAGCAgga > 4:281925/1‑116 (MQ=255) gggTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTCCCACCGGGCt > 1:52767/1‑149 (MQ=255) ggTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACTAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCAtt < 2:183122/105‑1 (MQ=255) ggTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACTAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCAtt > 1:183122/1‑105 (MQ=255) ttGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGaa > 1:200530/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAAt < 5:118956/148‑1 (MQ=255) gAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAAt < 4:203260/148‑1 (MQ=255) ccggtCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCAc < 8:92393/145‑1 (MQ=255) cAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCAc < 6:252366/149‑1 (MQ=255) aGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCAct < 6:62656/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCActgc > 3:86864/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCActgc > 6:324025/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCACCAGTGACCAGTTGGCATAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGtt < 3:142317/118‑1 (MQ=255) cgcgGCGCACCAGTGACCAGATGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGACAGATGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGCGCCGCCTGGTCCGCGtt > 4:142317/1‑118 (MQ=255) gcggcgCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTgg > 5:224826/1‑149 (MQ=255) gcggcgCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTgg < 8:210333/149‑1 (MQ=255) ggcgCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGTGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCa > 4:2716/1‑149 (MQ=255) gcACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACcg > 3:174495/1‑149 (MQ=255) cAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGct > 3:300793/1‑149 (MQ=255) gTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGctct > 3:325141/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGTGCTGAAt < 8:158251/125‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAAt > 7:158251/1‑125 (MQ=255) ccAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTcc > 7:307699/1‑147 (MQ=255) ccAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCa < 5:324025/149‑1 (MQ=255) aGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGc < 4:169654/149‑1 (MQ=255) gCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGc < 8:307699/149‑1 (MQ=255) aaaGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGCATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCCGCCATGCCt > 4:175015/1‑149 (MQ=255) aaaGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAAt < 4:198031/115‑1 (MQ=255) aaaGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAAt > 3:198031/1‑115 (MQ=255) ggTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGaa < 5:162172/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGaa < 4:300793/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAg < 4:174495/149‑1 (MQ=255) cggcTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGcgac < 1:67889/149‑1 (MQ=255) ggcTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGcgac > 7:30482/1‑148 (MQ=255) gCCAGCCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCAACTTCAACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCTCCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGcgacgatc > 7:185988/1‑146 (MQ=255) ccAGGTGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGGAGGCGACGAGc < 3:2716/147‑1 (MQ=255) aGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGc < 8:14576/130‑1 (MQ=255) aGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGc > 7:14576/1‑130 (MQ=255) ggcCACTGGCTGGACACCGGGCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGc < 3:314585/149‑1 (MQ=255) gcCTCTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCa < 3:60649/96‑1 (MQ=255) gcCTCTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCa > 4:60649/1‑96 (MQ=255) gctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGc > 5:36096/1‑149 (MQ=255) gctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGc < 6:224826/149‑1 (MQ=255) ctggACTCCGTTCAGTTGCGACAGCTCCTGCTGACATTGCTGCAGGGCGGCCTTGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCTGGCTGAATGCACTGCTTGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCg < 8:185988/149‑1 (MQ=255) ctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCg > 6:392628/1‑149 (MQ=255) ctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCg < 1:176035/149‑1 (MQ=255) ctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCg > 1:92786/1‑149 (MQ=255) acCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACt > 1:320485/1‑149 (MQ=255) acCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACt > 1:23085/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa < 8:30482/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGACCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGaa > 3:372275/1‑114 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGACCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGaa < 4:372275/114‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGAc > 4:141456/1‑148 (MQ=255) tCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGa < 8:107607/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGAAGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCAc > 5:215734/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCAACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTTAAGGCGACGAGCGAAACAGAAGAAGTGCGGGTACTGACGATCAcc > 8:160074/1‑147 (MQ=255) cAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAggg > 2:367774/1‑149 (MQ=255) cAGCTCCTGCTGCCATTGCTGAAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAggg < 7:160074/149‑1 (MQ=255) gCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGTCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa > 6:290933/1‑134 (MQ=255) gCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGTCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa < 5:290933/134‑1 (MQ=255) gCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCg < 2:200530/149‑1 (MQ=255) cgcccTGCAGCAATGGCAGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGc > 6:217366/4‑148 (MQ=255) ccTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGc < 7:388596/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCAATGGCAGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCCCTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCTGAAGTGCGGGTCCTGACGATCACCGAGGGCTAg > 3:308067/1‑148 (MQ=255) tgctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAg > 1:244526/1‑149 (MQ=255) tgctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAg > 8:371319/1‑149 (MQ=255) ctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGTGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAg < 4:86864/147‑1 (MQ=255) ctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAgg < 2:92786/148‑1 (MQ=255) ctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAgg < 6:36096/148‑1 (MQ=255) | TTCTGCAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCAGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAGG > NC_002947/995874‑996168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |