Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,092,675 | A→G | 6.9% | V51A (GTG→GCG) ‡ | ptsH ← | phosphocarrier protein HPr |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,092,675 | 0 | A | G | 6.9% | 162.2 / 2.8 | 58 | V51A (GTG→GCG) ‡ | ptsH | phosphocarrier protein HPr |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/26); new base G (2/2); total (30/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.63e-01 |
CTGGTGCAAGCGCAGGTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCGCGGGCGGG > NC_002947/1092528‑1092823 | cTGGTGCAAGCGCAGGTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCAc > 3:319661/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCAGGTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCat > 1:213043/1‑149 (MQ=255) gTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCtt > 6:284111/1‑149 (MQ=255) gTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCtt > 3:341982/1‑149 (MQ=255) tGCGAGGCCTATTCTCCTTCGTAATAGATATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATTGCGTCGCTGTCCTGCTCTCCCTCTGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACAGCCATGATGCTCTTGc < 8:306596/148‑1 (MQ=255) gCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATGGCGGTGATGATGctgg > 4:270392/1‑142 (MQ=255) gCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATGGCGGTGATGATGctgg < 3:270392/144‑3 (MQ=255) tATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAg > 6:291339/1‑149 (MQ=255) tATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAg > 1:215076/1‑149 (MQ=255) tATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAg > 5:133985/1‑149 (MQ=255) tATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAg > 2:107678/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAg < 5:108507/147‑1 (MQ=255) ttCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGACTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGc < 1:107678/148‑1 (MQ=255) gCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTg < 6:28104/148‑1 (MQ=255) aGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGa > 6:80533/1‑149 (MQ=255) aGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGa > 3:278445/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGaccca < 6:84302/149‑1 (MQ=255) tgttgATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGacccacc > 7:289185/1‑149 (MQ=255) gttgATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGacccacc < 5:284111/148‑1 (MQ=255) ttgATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGTCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCg > 3:129556/1‑149 (MQ=255) ttgATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGCCCCACCCg > 2:135859/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGcc > 8:30721/1‑113 (MQ=255) aTCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGcc < 7:30721/113‑1 (MQ=255) aTCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATccac > 7:220917/1‑119 (MQ=255) aTCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATccac < 8:220917/119‑1 (MQ=255) aTCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTAc > 2:210671/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATGGCGGTGATGATGctgg < 6:44664/108‑3 (MQ=255) tCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATGGCGGTGATGATGctgg > 5:44664/1‑106 (MQ=255) tCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTAcc > 4:237613/1‑149 (MQ=255) gACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGTATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAgg < 8:295655/149‑1 (MQ=255) gACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAg < 5:80533/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAgggg > 3:348444/1‑148 (MQ=255) aGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAgggg > 4:68613/1‑147 (MQ=255) tCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACGCGTACCTGGCAGGGGAAGcggcc > 2:340143/1‑149 (MQ=255) cATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGcggccg < 2:213043/148‑1 (MQ=255) aTGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGcggccggc < 2:215076/149‑1 (MQ=255) tGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGcggccg > 6:129244/1‑146 (MQ=255) tGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGcggccg < 5:129244/146‑1 (MQ=255) gCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCca > 4:226645/1‑148 (MQ=255) gTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCacac < 3:237613/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCacac < 4:278445/149‑1 (MQ=255) gCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACcg < 4:348444/148‑1 (MQ=255) cTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACcgac < 1:210671/149‑1 (MQ=255) tGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACcgac > 4:354840/1‑148 (MQ=255) gCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTg < 5:291339/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTg < 3:68613/148‑1 (MQ=255) cTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTgccg > 5:330995/1‑149 (MQ=255) ggTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGccc < 6:87574/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCAt < 8:289185/149‑1 (MQ=255) cACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGTCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGAc < 4:129556/149‑1 (MQ=255) gggTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGc > 2:76629/1‑149 (MQ=255) ggTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGc < 3:354840/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCttgt > 3:236033/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCCGGGGGCCACCATCATCACCCCCATGATGCTTTCTCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCttgt < 1:135859/149‑1 (MQ=255) cTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCttgtt > 4:88943/1‑148 (MQ=255) tGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTtgat < 3:226645/148‑1 (MQ=255) gCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGCAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTtgatga > 4:56275/1‑142 (MQ=255) gCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTtgatga < 3:56275/142‑1 (MQ=255) tcatcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCgcgg < 3:88943/149‑1 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCgg > 6:210740/1‑107 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCgg < 5:210740/107‑1 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCCGCTTGTTGATGATGGTGATTTCgcgggcg > 6:324575/1‑149 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTtgatga > 6:423952/1‑132 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTtgatga < 5:423952/132‑1 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGAtt > 6:161615/1‑140 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGAtt < 5:161615/140‑1 (MQ=255) tcaCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCgcgggcg > 7:312014/1‑149 (MQ=255) caCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCgcgggcgg > 2:106972/1‑149 (MQ=255) aCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCGcgggcggg > 7:176776/1‑149 (MQ=255) aCCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCAGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCGcgggcggg > 5:384048/1‑149 (MQ=255) | CTGGTGCAAGCGCAGGTTTGCGAGGCCTATTCGCCTTCGTCAAAGAAATTGTTGATCAGCTCGACCAGCGCGTCCATGGCGTCGCTGTCCTGCTCGCCCTCGGTATGCAGGTGCACCTGGGTGCCTTTGCCTGCGGCCAGCATCATCACCGCCATGATGCTCTTGCCATCCACCAGCTTGTCCGGGGCGCGACCCACCCGTACCTGGCAGGGGAAGCGGCCGGCCACACCGACGAACTTGGCTGCCGCCCGGGCATGCAGACCCAGCTTGTTGATGATGGTGATTTCGCGGGCGGG > NC_002947/1092528‑1092823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |