| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,198,992 | G→A | 5.3% | G434G (GGG→GGA) | gspE → | protein secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,198,992 | 0 | G | A | 5.3% | 231.9 / 2.3 | 75 | G434G (GGG→GGA) | gspE | protein secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/34); new base A (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.05e-01 | |||||||||||
CCCGCTACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGTGCTGCGCGTGGTGCAG > NC_002947/1198848‑1199136 | cccGCCACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCa > 7:291362/1‑149 (MQ=255) ccGCTACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCAGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTcgt > 8:364083/1‑147 (MQ=255) cGCTACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATc < 4:263313/149‑1 (MQ=255) gCTACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGTCTGAGGTTGCGGCGTTGGGCTTCTCTTATCACGCCGTTTGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTTCGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCg < 1:172120/149‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTac > 1:70514/1‑149 (MQ=255) cgAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGgcg > 5:345360/1‑149 (MQ=255) gAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGgcgc > 3:404494/1‑149 (MQ=255) gCTATGGCCTGTGCGTGCGGCGTTGGGCTGGTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCg < 6:62510/128‑1 (MQ=255) gCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCg > 5:62510/1‑128 (MQ=255) aTGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTTATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGt > 3:373684/1‑148 (MQ=255) tGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGt < 2:96156/147‑1 (MQ=255) tGGCCTGAGCTTGCAGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCGTCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGt < 7:364083/147‑1 (MQ=255) cTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTg < 6:345360/149‑1 (MQ=255) tGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGACTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTgg > 6:25640/1‑149 (MQ=255) tGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGACTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTgg > 6:124539/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTgg < 7:16600/147‑1 (MQ=255) cggcgTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCa < 5:335896/148‑1 (MQ=255) ggcgTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGAGTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGGTGGGCTCATCGGGCTGTTGTACGCCGGCGCCCGTGAGCTGGCCATGGAgg > 8:390898/1‑149 (MQ=255) ggcgTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAg > 5:215442/1‑148 (MQ=255) ccGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCa > 8:373108/1‑148 (MQ=255) cGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCaaa < 7:352582/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGc > 6:375726/1‑149 (MQ=255) ttGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACTAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTTTCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCtgg > 3:109270/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTATGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCtggtgg > 8:82514/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCtggtgg > 8:129148/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCCCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGc > 2:326021/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGATCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCAATGAAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGa > 7:306004/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGAt < 6:215442/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGc > 4:170702/1‑147 (MQ=255) ccAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCa < 1:411685/149‑1 (MQ=255) cAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGgcgc > 7:270338/1‑86 (MQ=255) cAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGgcgc < 8:270338/86‑1 (MQ=255) cAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAg < 7:373108/149‑1 (MQ=255) aGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGc > 4:106087/1‑149 (MQ=255) gggCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGt > 1:103721/1‑88 (MQ=255) gggCAGCGGTTATATCGGGCGACGGGGGTTGTACGAATTCTTCGCGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGt < 2:103721/88‑1 (MQ=255) ggCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTTATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGa < 4:373684/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGATGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAATCCtgg < 5:289630/132‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGATGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAATCAtgg > 6:289630/1‑132 (MQ=255) gCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGc < 2:245735/142‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGc > 1:245735/1‑142 (MQ=255) gCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGc < 8:291362/149‑1 (MQ=255) ggTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCt < 4:404494/149‑1 (MQ=255) ggTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCt > 6:71502/1‑149 (MQ=255) atatCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCtggtgg > 5:55606/1‑126 (MQ=255) atatCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCtggtgg < 6:55606/126‑1 (MQ=255) tCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGcc < 6:17328/111‑1 (MQ=255) tCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGcc > 5:17328/1‑111 (MQ=255) gggCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAg > 7:362966/1‑131 (MQ=255) gggCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAg < 8:362966/131‑1 (MQ=255) gggCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCgg > 6:201770/1‑149 (MQ=255) gggCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCgg > 7:164/1‑149 (MQ=255) tGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCGGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGAc > 1:187008/1‑148 (MQ=255) ggggTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGAc > 1:45359/1‑147 (MQ=255) gTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCa > 8:312765/1‑146 (MQ=255) gTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCa < 7:312765/146‑1 (MQ=255) gTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTgg > 5:72586/1‑149 (MQ=255) tACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCa < 8:38275/71‑1 (MQ=255) tACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCa > 7:38275/1‑71 (MQ=255) tACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTgg < 8:164/148‑1 (MQ=255) cGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAg < 8:71246/58‑1 (MQ=255) cGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAg > 7:71246/1‑58 (MQ=255) aTTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGaa < 2:45359/148‑1 (MQ=255) ttCATCGAGCTGGACGCTGGACTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGt < 5:124539/149‑1 (MQ=255) ttCATCGAGCTGGACGCTGGACTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGt < 5:25640/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGAc > 6:52399/1‑129 (MQ=255) cGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGAc < 5:52399/129‑1 (MQ=255) gAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGtgctgc < 7:129148/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGtgctgc < 6:72586/148‑1 (MQ=255) cTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCgg < 6:108801/119‑1 (MQ=255) cTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCgg > 5:108801/1‑119 (MQ=255) ggACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTgg > 2:163013/1‑110 (MQ=255) ggACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTgg < 1:163013/110‑1 (MQ=255) gACGCTGGGCCCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGTGCTGCGCgtg < 1:326021/147‑1 (MQ=255) cTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGTGCTGCGCGTGGTGCAg < 3:106087/149‑1 (MQ=255) | CCCGCTACAGGCTGCCGAGCGCGAGCTATGGCCTGAGCTTGCGGCGTTGGGCTGCTCTTATCACGCCGTGGGTTGCGAGCAGTGCCAGGGCAGCGGTTATATCGGGCGACTGGGGTTGTACGAATTCATCGAGCTGGACGCTGGGCTCATCGGCCTGTTGTACGACGGCGCCAGTGAGCTGGCCATGCAGGACTATCTGGCTGACCGGCGCCAAAGCCTGGTGGCGATGGCCAGCGATTGCCTGGCTCGCGGTGAGACCAGCCTGGCCGAAGTGCTGCGCGTGGTGCAG > NC_002947/1198848‑1199136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |