| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,231,195 | C→G | 6.9% | K506N (AAG→AAC) ‡ | glpD ← | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,231,195 | 0 | C | G | 6.9% | 221.3 / 6.3 | 72 | K506N (AAG→AAC) ‡ | glpD | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/35); new base G (2/3); total (34/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
GCACTGAAGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGT > NC_002947/1231048‑1231335 | gCACTGAAGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCt > 7:2503/1‑149 (MQ=255) aaGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCg < 3:378662/147‑1 (MQ=255) aGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGc > 2:96814/1‑149 (MQ=255) aGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCAAGGTGCGGGc < 2:83679/149‑1 (MQ=255) gCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCtt < 5:73370/149‑1 (MQ=255) cTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCCGCGCGGCTATTCGCCCGCAAGGTGCGGGcgaa < 3:145469/149‑4 (MQ=255) aTTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttgt < 7:181616/147‑1 (MQ=255) aTTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttgt < 2:227630/147‑1 (MQ=255) tttCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGc < 8:2503/149‑1 (MQ=255) gATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGa < 5:14521/148‑1 (MQ=255) cGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGc > 6:240116/1‑142 (MQ=255) cGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGc < 5:240116/142‑1 (MQ=255) agcgagcgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCt > 2:302296/1‑149 (MQ=255) cgagcgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttg > 2:185347/1‑133 (MQ=255) cgagcgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttg > 2:185343/1‑133 (MQ=255) cgagcgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttg < 1:185343/133‑1 (MQ=255) cgagcgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCttg < 1:185347/133‑1 (MQ=255) gcgGGCATTGTTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAgg < 5:38252/149‑1 (MQ=255) cgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAggg < 8:20564/149‑1 (MQ=255) cgGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAggg < 8:26606/149‑1 (MQ=255) ggCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGc > 4:213265/1‑148 (MQ=255) aTTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATGCGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATc < 6:131232/149‑1 (MQ=255) ctcgcgcGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCt > 6:191801/4‑149 (MQ=255) cTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCGCCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATACGCCAGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGACTCCATGGCCATCTGCt > 3:245795/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCt > 7:106913/1‑149 (MQ=255) gcgGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTgc > 7:189905/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGcgcg < 4:106662/149‑1 (MQ=255) gcgTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGc < 5:191801/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGa > 5:215337/1‑149 (MQ=255) gcTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGt < 1:52101/149‑1 (MQ=255) gcTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGt < 6:215337/149‑1 (MQ=255) aaTACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGcc < 4:251192/149‑1 (MQ=255) aaTACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGc > 2:11518/1‑148 (MQ=255) gCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTgc > 8:388089/1‑110 (MQ=255) gCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTgc < 7:388089/110‑1 (MQ=255) ccccTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGa > 7:71974/1‑145 (MQ=255) ccccTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGa < 8:71974/145‑1 (MQ=255) ccccTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAAt > 2:385907/1‑149 (MQ=255) cccTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGCGCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAAt < 1:11518/149‑1 (MQ=255) cccTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATg > 6:169610/1‑149 (MQ=255) cTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCCGCGACCG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGt > 4:122049/1‑148 (MQ=255) aCGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACa > 8:80461/1‑114 (MQ=255) aCGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACa < 7:80461/114‑1 (MQ=255) tCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTgcg > 8:330082/1‑97 (MQ=255) tCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTgcg < 7:330082/97‑1 (MQ=255) agagGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCATATAATGTCAGc < 4:264456/140‑1 (MQ=255) agagGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCATATAATGTCAGc > 3:264456/1‑140 (MQ=255) gagGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAAt > 7:212673/1‑133 (MQ=255) gagGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAAt < 8:212673/133‑1 (MQ=255) ttCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCAt > 6:417707/1‑149 (MQ=255) cACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATg > 4:275344/1‑126 (MQ=255) cACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATg < 3:275344/126‑1 (MQ=255) aCCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtc < 6:402719/148‑1 (MQ=255) aCCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtc < 8:189905/148‑1 (MQ=255) ccGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTGCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtcct > 1:155870/1‑149 (MQ=255) tAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGcc < 7:290006/139‑1 (MQ=255) tAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGcc > 8:290006/1‑139 (MQ=255) gTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtcctcctc > 4:63728/1‑147 (MQ=255) tATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCACGGCCATCTGCTCCTTCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCATCTTCGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtcctcctcc < 1:302296/148‑1 (MQ=255) aTCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCcag > 3:29243/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCcagca < 4:29243/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCcagcag > 2:46621/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTaa > 7:381320/1‑149 (MQ=255) tGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAAt > 7:386803/1‑149 (MQ=255) gcgGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtc < 6:230681/129‑1 (MQ=255) gcgGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtc > 5:230681/1‑129 (MQ=255) acaagCCCGCAAGGTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTcgc > 2:320989/5‑149 (MQ=255) ttCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTcgcg < 8:112408/149‑1 (MQ=255) cGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCgg < 1:385907/148‑1 (MQ=255) gCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGt < 1:46621/149‑1 (MQ=255) gCCCGCAAGGTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtcctcctc > 7:364146/1‑125 (MQ=255) gCCCGCAAGGTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATtcctcctc < 8:364146/125‑1 (MQ=255) | GCACTGAAGGCTGATTTCGATCGCAGCGAGCGGGCATTGCTGGCGCGGTTGGCGCGTGAAGCCTACGAGCGCTGGGCGAATACGCCCCCTTGACGGATCAAGAGGGCTTCACCGTAGGTATCAGGCTGCGCGGCTATTCGCCCGCACCTTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAG‑GCCCAGCTT‑GGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGT > NC_002947/1231048‑1231335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |