Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,246,194 | C→T | 6.3% | F183F (TTC→TTT) | PP_1087 → | OmpA family outer membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,246,194 | 0 | C | T | 6.3% | 190.7 / 2.1 | 63 | F183F (TTC→TTT) | PP_1087 | OmpA family outer membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/27); new base T (2/2); total (34/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
GCGCAACTACACCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTACCAACCG > NC_002947/1246047‑1246334 | gcgcAACTACACCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTCCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAAAGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGCTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTcc > 7:369683/1‑149 (MQ=255) gcAACTACACCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTcccc > 2:18500/1‑149 (MQ=255) acacCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGc > 2:218008/1‑149 (MQ=255) cacCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTTCCCGGGGGCg > 8:334410/1‑149 (MQ=255) cacCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCg < 3:257998/149‑1 (MQ=255) acCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCg > 4:257998/1‑148 (MQ=255) gTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTTTGCTGCCGGTCATCTTCGGCATAGCCTACAATTAATATCAGGTCTGTGCTGGCATGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATc < 8:187096/149‑1 (MQ=255) gTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATc < 4:287782/149‑1 (MQ=255) gTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATc > 3:287782/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGa < 1:305306/148‑1 (MQ=255) gCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCAGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTTCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGTGGGCGGTATCGAGCt > 5:350834/1‑149 (MQ=255) gCGGGCAGGCCGAGGGAGGTGCGGGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGAGGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCt < 7:326069/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACg < 5:186712/149‑1 (MQ=255) tGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCggg > 7:753/1‑122 (MQ=255) tGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCggg < 8:753/122‑1 (MQ=255) gctgcCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGcagcag > 3:201231/1‑134 (MQ=255) gctgcCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGcagcag < 4:201231/134‑1 (MQ=255) tgcCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGAc > 5:87101/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCgg < 5:267823/139‑1 (MQ=255) ggTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCgg > 6:267823/1‑139 (MQ=255) aGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTTCCCGGGGGc > 3:273591/1‑102 (MQ=255) aGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTTCCCGGGGGc < 4:273591/102‑1 (MQ=255) aGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGa > 5:27451/1‑110 (MQ=255) aGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGa < 6:27451/110‑1 (MQ=255) aaaaGCCTACAATGACTATCAGGGCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACAGAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTAGCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACa < 5:120078/148‑1 (MQ=255) ccTACAATGACTATGAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTTCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGaaa < 7:334410/149‑1 (MQ=255) ccTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACAt > 1:179325/1‑145 (MQ=255) ccTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACAt < 2:179325/145‑1 (MQ=255) ccTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGaaa < 5:121365/149‑1 (MQ=255) cTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCC‑GGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCg > 5:119585/1‑136 (MQ=255) cTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCC‑GGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCg < 6:119585/136‑1 (MQ=255) cTACAATGACTATAAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAg > 7:63727/1‑149 (MQ=255) aaTGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGAt > 1:103387/1‑135 (MQ=255) aaTGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGAt < 2:103387/135‑1 (MQ=255) aGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTg < 6:87101/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCa > 1:25167/1‑149 (MQ=255) tgCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATg > 3:306312/1‑149 (MQ=255) tgCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATg > 7:293008/1‑149 (MQ=255) gCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGt > 7:72910/1‑149 (MQ=255) cTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTc < 4:306312/149‑1 (MQ=255) aaGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCt < 8:293008/149‑1 (MQ=255) aaGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCt > 5:53666/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCt > 6:13172/1‑144 (MQ=255) gTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCt < 5:13172/144‑1 (MQ=255) ttGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATg < 1:218008/148‑1 (MQ=255) gCCGTTGAACTACGACCAGGTTCGCGAGACTGAGGTGGGTTTCCCGGGTGGCGGTATCTAGGTGGACGCAGCATCCAAGGCGCGGTTGGACGTGATCCTTGATTACATTAAAGCCGTCCCTACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATggg < 8:369683/148‑1 (MQ=255) cGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCAt > 1:45653/1‑149 (MQ=255) cGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCAt > 2:306896/1‑149 (MQ=255) gATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCAtt > 6:194485/1‑149 (MQ=255) cTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGac > 3:145410/1‑148 (MQ=255) cTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGac > 5:135008/1‑148 (MQ=255) ccAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTg > 3:372295/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTg < 8:63727/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTg > 2:306285/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGa > 4:342727/1‑138 (MQ=255) ggTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGa < 3:342727/138‑1 (MQ=255) tGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAAc > 2:295010/1‑149 (MQ=255) gcCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGc > 8:269319/1‑149 (MQ=255) cAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCt < 7:269319/149‑1 (MQ=255) cAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCt > 2:247230/1‑149 (MQ=255) acacAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTAc < 1:18500/149‑1 (MQ=255) acacAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTAc < 2:25167/149‑1 (MQ=255) cacaGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTAc > 5:384836/1‑148 (MQ=255) aGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAATCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTACCAAc < 1:306896/149‑1 (MQ=255) gTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTACCAACcg > 4:184918/1‑149 (MQ=255) ccccGGGGGCAGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTAc > 5:186877/1‑135 (MQ=255) ccccGGGGGCAGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTAc < 6:186877/135‑1 (MQ=255) | GCGCAACTACACCGGTGAGGCGGGCAGGCCGATGGAGGTGCGTGTGCTGCCGGTCAGCTTCGCCAAAGCCTACAATGACTATCAGGTCTGTGCTGGCAAGCTGTTGCCGATGAACTACGACCAGGTGCGCCAGACACAGGTGGGTTTCCCCGGGGGCGGTATCGAGCTGGACGCAGCAGCCAAGGCGCGGCTGGACGTGATCCTCGATTACATGAAAGCCGACCCGACGGTGAACCATGTCGAGCTCAATGGGCATTCCGACAACAGTGGCAACCGCCTTACCAACCG > NC_002947/1246047‑1246334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |