| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,334,867 | T→C | 5.3% | T14T (ACT→ACC) | PP_1160 → | asparaginase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,334,867 | 0 | T | C | 5.3% | 227.2 / 2.0 | 75 | T14T (ACT→ACC) | PP_1160 | asparaginase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/33); new base C (2/2); total (40/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 | |||||||||||
CGGCCTATGTGCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCA > NC_002947/1334729‑1335014 | cGGCCTATGTGCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCa > 3:336332/1‑149 (MQ=255) cTATGTGCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGt > 2:202566/1‑149 (MQ=255) tgtgCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGTTGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGGTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTc < 3:135868/147‑1 (MQ=255) gCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTgg > 4:169701/1‑137 (MQ=255) gCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTgg < 3:169701/137‑1 (MQ=255) gCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTAt > 3:406181/1‑149 (MQ=255) aTGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGc > 1:196457/1‑149 (MQ=255) aTGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGc > 3:32698/1‑149 (MQ=255) aTGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGc > 1:29121/1‑149 (MQ=255) tGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATGGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCg > 5:244901/1‑149 (MQ=255) gCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCgg < 4:406181/148‑1 (MQ=255) cTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGc > 1:214019/1‑149 (MQ=255) cTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCATGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGc > 8:258498/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCg < 7:207323/148‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGt < 5:129985/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTg < 1:202566/149‑1 (MQ=255) gCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTg > 4:16177/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTGTCGATGGCCATCTGGACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGTAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCg < 2:196457/149‑1 (MQ=255) gtgtCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGAt > 1:389126/1‑149 (MQ=255) gtgtCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGAt > 2:198270/1‑149 (MQ=255) tgtCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATg > 3:313889/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgt < 4:313889/149‑1 (MQ=255) tCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgt < 2:214019/149‑1 (MQ=255) tCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgt < 1:198270/149‑1 (MQ=255) gATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgtgt < 7:89257/149‑1 (MQ=255) gCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGAc < 7:127227/148‑1 (MQ=255) cATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGcc < 4:32698/149‑1 (MQ=255) cATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATAAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACCCAGAGTGGcgat > 2:215641/1‑105 (MQ=255) cATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATAAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACCCAGAGTGGcgat < 1:215641/108‑4 (MQ=255) tGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGc > 7:94213/1‑149 (MQ=255) gCTTTGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGTGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGa < 4:365326/149‑1 (MQ=255) gCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATtgtg < 4:336332/149‑1 (MQ=255) cATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgtg > 8:71864/1‑127 (MQ=255) cATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGgtg < 7:71864/127‑1 (MQ=255) tCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCGAGCCTGGATTGTGAGc < 2:29121/149‑1 (MQ=255) tCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATtgt < 7:191142/145‑1 (MQ=255) tCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATtgt > 8:191142/1‑145 (MQ=255) gCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAg > 3:32063/1‑144 (MQ=255) gCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAg < 4:32063/144‑1 (MQ=255) ttGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCca > 3:112467/1‑148 (MQ=255) gggggAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTg > 4:261702/1‑149 (MQ=255) ggggAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTgc < 7:346904/149‑1 (MQ=255) ggggAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAACCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTgc > 2:316468/1‑149 (MQ=255) gCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAAtt < 4:143460/139‑1 (MQ=255) gCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAAtt > 3:143460/1‑139 (MQ=255) gCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATg < 3:16177/149‑1 (MQ=255) aTGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCa > 7:13498/1‑125 (MQ=255) aTGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCa < 8:13498/125‑1 (MQ=255) aTGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGgc > 3:90740/1‑149 (MQ=255) aTGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGgc > 5:127674/1‑149 (MQ=255) aGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCa < 2:389126/149‑1 (MQ=255) gTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAg > 3:311071/1‑149 (MQ=255) gTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGCTTCCACAATTGCTCGAAATGGCGCAg > 4:260343/1‑149 (MQ=255) tGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGt > 7:98565/1‑149 (MQ=255) gAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGtt > 7:242873/1‑149 (MQ=255) aaCATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGtt > 7:313047/1‑148 (MQ=255) aaCATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGtt > 7:318814/1‑148 (MQ=255) aCATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGa < 1:194243/149‑1 (MQ=255) aCATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGa < 1:200520/149‑1 (MQ=255) aCATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCCATTTCGCGCAATTgt < 8:94213/149‑2 (MQ=255) cATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGaa < 7:258498/149‑1 (MQ=255) gAGCCTTCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGTCACGGTCAGTATGCGGGCCGTTGCTGTCGGGTATGGTGTGACGCCTAGCGTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGATATGGCGCAGTTGAACGtt < 1:316468/148‑1 (MQ=255) cgtgccacccAGAGTGGCGATCGACAGCCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGt < 7:45713/140‑1 (MQ=255) cgtgccacccAGAGTGGCGATCGACAGCCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGt > 8:45713/8‑147 (MQ=255) aGCCTGCCCAGGCTGTCGATGGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGc < 6:244901/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCt > 2:153093/1‑149 (MQ=255) gCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCt > 2:146924/1‑149 (MQ=255) cccAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGtt < 4:93075/134‑1 (MQ=255) cccAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGtt > 3:93075/1‑134 (MQ=255) cTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCt < 8:242873/149‑1 (MQ=255) tCGCCACTCTGGCAGGCACGGACACTATGCGGGCCAGTGCTCTCGTGGATGGTGTGACGCCAAGCCTCTATTGTGAGCGGCAACTGCTTCACTTTCCACAATTGAGCGAAATAGCGCAGTTGAACGTTCCTTCATTGTGCATGCAccc > 4:26849/1‑148 (MQ=255) gcgaCTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCAtt < 4:255048/131‑1 (MQ=255) gCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCAtt > 3:255048/1‑134 (MQ=255) ccACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGt > 5:144975/1‑149 (MQ=255) ccACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGt > 3:261324/1‑149 (MQ=255) ctctGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCa < 6:144975/149‑1 (MQ=255) | CGGCCTATGTGCATGGCTACATCGGCAATGTGGTGTCGATGGCCATCTGCACGCTTGGCATCGTGCCGGTAGTCGGGTTGCTTGTGGGGGGAGAAGCATGAGTGAACATTCGAGCCTGCCCAGGCTGTCGATCGCCACTCTGGGTGGCACGGTCAGTATGCGGGCCGGTGCTGTCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCA > NC_002947/1334729‑1335014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |