| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,389,951 | C→G | 5.8% | P25A (CCG→GCG) | PP_1212 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,389,951 | 0 | C | G | 5.8% | 280.6 / 5.7 | 86 | P25A (CCG→GCG) | PP_1212 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/38); new base G (3/2); total (46/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
AGTGCTTGCTAACCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAGGCCGACT > NC_002947/1389803‑1390098 | aGTGCTTGCTAACCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAgcgccgcgc < 5:133201/149‑1 (MQ=255) tgcttgctAACCATATATAATCCCGCTTTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAgcgccgcgcc > 1:243853/1‑149 (MQ=255) ctAACCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATc > 3:42734/1‑149 (MQ=255) aCCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCTGCTGATCGa < 6:297256/148‑1 (MQ=255) aCCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGAt > 3:153107/1‑149 (MQ=255) ccATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGAtt < 4:42734/149‑1 (MQ=255) ccATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGAtt < 4:9612/149‑1 (MQ=255) atataATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGccc > 2:18673/1‑149 (MQ=255) tataATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCg < 2:14537/149‑1 (MQ=255) ccGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTc > 7:138978/1‑149 (MQ=255) cGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGt > 1:274454/1‑147 (MQ=255) tgctgcCGCCCGGCAGCGAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCTTGCGCCTTTATGACTATCATTGTGGGTCCTGCGAGCACGTCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCGGGTGATCGATTGGCCGGCCTGTCAGGC‑Gcc < 6:55098/148‑1 (MQ=255) ctgcCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCgg > 5:357840/1‑148 (MQ=255) gcCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCAc > 2:275961/1‑149 (MQ=255) ccccccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCa < 3:52720/137‑1 (MQ=255) ccccccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCa > 4:52720/1‑137 (MQ=255) ccccccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCAc < 2:27828/148‑1 (MQ=255) ccccccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACt > 2:377866/1‑149 (MQ=255) ccccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGa < 2:243853/149‑1 (MQ=255) cccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGa < 5:359614/119‑1 (MQ=255) cccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGa > 6:359614/1‑119 (MQ=255) ccGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGaaa < 4:167803/149‑1 (MQ=255) gccagcGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg < 2:274454/149‑1 (MQ=255) ccagcGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGcc < 5:304531/116‑1 (MQ=255) ccagcGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGcc > 6:304531/1‑116 (MQ=255) ccagcGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg > 4:290813/1‑148 (MQ=255) ccagcGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg < 3:290813/148‑1 (MQ=255) ttATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCgg < 6:357840/149‑1 (MQ=255) aTGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGt < 1:377866/148‑1 (MQ=255) tGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGCAGCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGt < 1:18673/148‑1 (MQ=255) ggTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGc > 3:75800/1‑148 (MQ=255) agagaCACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑Tc < 7:220238/149‑1 (MQ=255) ccATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGc > 4:207344/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGc > 6:154116/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGc > 2:297698/1‑149 (MQ=255) tGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCgg > 7:372130/1‑148 (MQ=255) ccTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACg > 7:95001/1‑149 (MQ=255) tATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTg > 2:143494/1‑149 (MQ=255) aTGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGGCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCTGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTg < 4:153107/148‑1 (MQ=255) gACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGc > 1:282351/1‑80 (MQ=255) gACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGc < 2:282351/80‑1 (MQ=255) cTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGc > 7:195424/1‑116 (MQ=255) cTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGc < 8:195424/116‑1 (MQ=255) tATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACg > 2:200721/1‑148 (MQ=255) aTCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg > 1:261060/1‑104 (MQ=255) aTCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg < 2:261060/104‑1 (MQ=255) aTCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGa > 7:380073/1‑148 (MQ=255) tCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGaaa > 5:179325/1‑149 (MQ=255) cGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTc < 5:347229/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTc > 8:374556/1‑148 (MQ=255) tCCTGCGAGCACCTCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCTCAGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGTCACTGAAAAAGCTGCTGTCTGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCaa < 8:380073/149‑1 (MQ=255) tCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg < 1:188974/93‑1 (MQ=255) tCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAgctg > 2:188974/1‑93 (MQ=255) tCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTc > 1:299232/1‑147 (MQ=255) tGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCtt‑t < 5:315146/108‑1 (MQ=255) tGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCtt‑t > 6:315146/1‑108 (MQ=255) tGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGAc > 3:122235/1‑149 (MQ=255) tGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGAc > 2:320881/1‑149 (MQ=255) gCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑ACGACAGACCGGTAACGGTTGGTACGAAAGCGACTTCAAGAcc > 6:214454/1‑149 (MQ=255) 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gaTCAGCGGCGCGGCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAggcggc > 6:382442/1‑148 (MQ=255) gaTCAGCGGCGCGGCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGgcggcg < 5:382442/149‑1 (MQ=255) gaTCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGaa < 6:42364/135‑1 (MQ=255) gaTCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGaa > 5:42364/1‑135 (MQ=255) aTCAGCGGCGCGGCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGa > 3:142144/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGa > 1:177055/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGAc < 6:179325/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGAc > 3:258269/1‑148 (MQ=255) gcgccgcgccGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGAc > 5:195626/1‑146 (MQ=255) gcgccgcgccGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACaa < 6:195626/148‑1 (MQ=255) gcgccgcgccGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGA‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAg > 5:68925/1‑149 (MQ=255) cgccgcgccgCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAgg < 4:285119/149‑1 (MQ=255) ccgcgccgcTGATCGATTGCCCGGCCTGTGCGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTCCGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAGGcc < 3:265432/149‑1 (MQ=255) ccgcgccgcTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAGGcc < 8:138978/149‑1 (MQ=255) gccgcTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAGGCCGACt < 5:343580/149‑1 (MQ=255) | AGTGCTTGCTAACCATATATAATCCCGC‑TTTTTGCTGCCCCCCGGCAGCCAGCGTTATGGTTGACGAGAGACACCCATGCCCCTTTATGACTATCAATGTGCGTCCTGCGAGCACCGCATGGAAGTGCTGCAGAAGATCAGCGCCGCGCCGCTGATCGATTGCCCGGCCTGTCAGGC‑GCCGGCACTGAAAAAGCTGCTGTCGGTGCCAGGCTT‑TCGCCTGAGCGGTAACGGTTGGTACGAAACCGACTTCAAGACCGGGGCGAAAAAGAATCTGGCAGGCGGCGACAAGGCCGACT > NC_002947/1389803‑1390098 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |