| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,403,591 | T→C | 9.3% | intergenic (‑57/+24) | PP_1227 ← / ← PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,403,591 | 0 | T | C | 9.3% | 163.3 / 7.2 | 65 | intergenic (‑57/+24) | PP_1227/PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/27); new base C (3/3); total (34/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.12e-01 | |||||||||||
TGGCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCG > NC_002947/1403444‑1403735 | tggCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTg < 5:50704/149‑1 (MQ=255)tggCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTg > 6:50704/1‑149 (MQ=255) gCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGcc < 3:398144/149‑1 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGccc > 5:207390/1‑145 (MQ=255) gAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGccc < 6:207390/145‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAagag > 1:277958/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGc > 8:127264/1‑149 (MQ=255) ggcggcGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCt < 3:281308/149‑1 (MQ=255) aTCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGc < 7:127264/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTa < 6:179522/149‑1 (MQ=255) ggggCGTAAACGCCCTTGTTCGCTGGGGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGAc < 7:392651/146‑1 (MQ=255) ggTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGAc < 5:396169/149‑1 (MQ=255) tGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGAcgc < 2:277958/149‑1 (MQ=255) ttGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCGCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCa > 5:360131/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGGCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTTGACGCGAAACTGCTCCATCAgcgc > 1:179014/1‑149 (MQ=255) gTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctg < 2:357959/148‑1 (MQ=255) gATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCCTCAGCGCctgctg > 8:83172/1‑149 (MQ=255) ggcGAAGAAAGGGGATCGGGTTGGATTAGGCATCAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctgctgct < 8:378927/146‑1 (MQ=255) cGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGt > 2:84188/1‑149 (MQ=255) aagaaAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGTAC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGtt < 1:84188/149‑1 (MQ=255) aagaaAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 8:264357/1‑149 (MQ=255) agaaAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAAAACCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTgg > 1:338086/1‑149 (MQ=255) gtgATCGGGTTGGAATAGGCATAACTTGTGCAGAAGAATAACGATTGTGCGGTTCCTTTCACGGCCTCATAGCAGGCGTTCCCGCGCAGACGCCCAG‑AC‑ATGCGAGCAGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCAGCTGGTTGGcaaccc > 8:200834/3‑144 (MQ=255) ggATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAACAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCAGGTTGGCCAGCCg > 3:401620/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCgg > 8:285379/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCg < 6:360131/148‑1 (MQ=255) aTCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGt < 7:200834/149‑1 (MQ=255) ggTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAg < 7:202288/149‑1 (MQ=255) ttGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAggg > 4:295872/1‑149 (MQ=255) ttGGATTAGCCATAAGTTGTTCTCAATAATAACGATGGGGCGGTGCCTGTCAGGGCCGGTGCGCGGGCGCGCCCGATAAGTGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAggg < 2:179014/149‑1 (MQ=255) ggATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGATTAGGCCCGT‑ACAAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAggg < 1:323302/148‑1 (MQ=255) ggCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTg < 7:285379/149‑1 (MQ=255) gccttAAGTTGTGCTCAAGAATAACGTTGGTGCGGTGCCTGTAAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCt < 4:401620/144‑1 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑CGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa > 2:146580/1‑149 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa > 5:24765/1‑149 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGAGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa > 2:37762/1‑149 (MQ=255) ttGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGc > 3:278245/1‑149 (MQ=255) tCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGAtt > 2:24801/1‑148 (MQ=255) cAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGt > 7:391620/1‑140 (MQ=255) cAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGt < 8:391620/140‑1 (MQ=255) aaGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 5:265138/1‑109 (MQ=255) aaGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg < 6:265138/109‑1 (MQ=255) aaGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCAt > 1:314966/1‑149 (MQ=255) gAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCg < 6:24765/149‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTc < 3:128689/141‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTc > 4:128689/1‑141 (MQ=255) gATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGcc > 5:238273/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGccc < 4:278245/149‑1 (MQ=255) tgcggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGC‑GGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCg > 6:195641/1‑136 (MQ=255) tgcggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGC‑GGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCg < 5:195641/136‑1 (MQ=255) gcggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCccagc > 2:107079/1‑147 (MQ=255) cggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCccagcca < 6:238273/148‑1 (MQ=255) tagcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGt > 5:293656/3‑148 (MQ=255) tCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGt < 1:37762/149‑1 (MQ=255) aGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTc < 3:295872/148‑1 (MQ=255) aGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCa > 4:88472/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAgg > 5:376097/1‑94 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAgg < 6:376097/94‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGtc > 3:354745/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 7:368314/1‑76 (MQ=255) tctTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg < 8:368314/76‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGtctc > 4:139841/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGtctc < 2:338086/147‑1 (MQ=255) cgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATga > 6:119566/1‑148 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCg > 6:388603/1‑149 (MQ=255) | TGGCGATGAACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTG‑AC‑AGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCG > NC_002947/1403444‑1403735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |