Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,416,868 | T→A | 8.6% | L39Q (CTG→CAG) | PP_1239 → | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,416,868 | 0 | T | A | 8.6% | 199.5 / 8.2 | 70 | L39Q (CTG→CAG) | PP_1239 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/33); new base A (4/2); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.42e-01 |
TGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCATGCGCAA > NC_002947/1416721‑1417015 | tGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTg < 5:339970/149‑1 (MQ=255) ttCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCg < 5:12788/147‑1 (MQ=255) ggACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGttt < 6:140843/149‑1 (MQ=255) gACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTc > 4:40050/1‑149 (MQ=255) gACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTc < 2:317173/149‑1 (MQ=255) accaccTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCt > 3:105732/1‑149 (MQ=255) ccaccTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTg < 5:106918/149‑1 (MQ=255) accTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGca < 7:157685/149‑1 (MQ=255) tGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagct > 7:165706/1‑149 (MQ=255) gggCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagct > 6:14500/1‑148 (MQ=255) aGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAgctcagctca < 8:165706/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCTCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgcagt > 4:388570/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgcagt > 7:101236/1‑149 (MQ=255) cgGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTg < 4:68369/149‑1 (MQ=255) gTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGATCGGCACTCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATGCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGt < 6:128010/149‑1 (MQ=255) cTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCa < 6:158157/148‑1 (MQ=255) cTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCAc < 1:340083/149‑1 (MQ=255) tCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTg < 7:51686/143‑1 (MQ=255) tCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTg > 8:51686/1‑143 (MQ=255) gCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTgg < 3:292076/138‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTgg > 4:292076/1‑138 (MQ=255) cGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAATGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGaa > 1:250776/1‑148 (MQ=255) aaGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCTCTG‑CGTGTAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGAc < 3:388570/149‑1 (MQ=255) aaGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGAc < 5:14500/149‑1 (MQ=255) ggAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGc > 7:57621/1‑142 (MQ=255) ggAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGc < 8:57621/142‑1 (MQ=255) aCGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTg > 5:119459/1‑149 (MQ=255) ggCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCa > 7:95033/1‑149 (MQ=255) aCGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGc < 5:53131/95‑1 (MQ=255) aCGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGc > 6:53131/1‑95 (MQ=255) tGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTc > 3:172696/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCCCATGCACGTGGTCg < 8:101236/148‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTc < 6:118853/147‑1 (MQ=255) ccAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCACTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTg > 6:216572/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCGAAGCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCtt > 1:322896/1‑149 (MQ=255) tgACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCAc < 6:324119/149‑1 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGTTTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTTAAACCTAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGGTGGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCt < 2:198545/138‑1 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCt > 1:198545/1‑138 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGgcgc > 4:57283/1‑148 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGgcgc > 3:385927/1‑148 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCt < 8:95033/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACaa > 1:321423/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCCGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTc > 1:212551/1‑136 (MQ=255) ccTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTc < 2:212551/135‑1 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTT‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGc < 8:127930/129‑1 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGc > 7:127930/1‑129 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTa > 1:388743/1‑149 (MQ=255) gTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTAcc > 7:3516/1‑149 (MQ=255) gTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTAc < 3:57283/148‑1 (MQ=255) tCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCg < 5:216572/149‑1 (MQ=255) gATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCgg > 4:93722/1‑148 (MQ=255) gCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTa < 1:392112/133‑1 (MQ=255) gCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTa > 2:392112/1‑133 (MQ=255) ttCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGc > 5:7863/1‑148 (MQ=255) ccTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAg > 7:235869/1‑149 (MQ=255) cTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCTGTCTACCTCAGCCAAgg < 4:172696/149‑1 (MQ=255) gTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCCCATGCACGTGGTCGGc < 6:319844/101‑1 (MQ=255) gTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCCCATGCACGTGGTCGGc > 5:319844/1‑101 (MQ=255) tGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACtt < 8:3516/149‑1 (MQ=255) accccGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATACCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCa > 6:129577/4‑135 (MQ=255) accccGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATACCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCa < 5:129577/132‑1 (MQ=255) cccGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTgcg > 8:34529/2‑149 (MQ=255) cccGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTgcg > 6:190367/2‑149 (MQ=255) ccGAGCAGCG‑‑CCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTgcgc > 1:43060/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCCGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGcgcg < 3:93722/149‑1 (MQ=255) gcggcg‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACttt < 7:120237/141‑1 (MQ=255) gcggcg‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACttt > 8:120237/1‑141 (MQ=255) ggcg‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCATg < 6:119459/149‑1 (MQ=255) cg‑‑cCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCATgcg > 5:259984/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCATGCGCaa < 2:250776/149‑1 (MQ=255) | TGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTG‑CGTGAAACCGAGCGGCG‑‑CCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCATGCGCAA > NC_002947/1416721‑1417015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |