Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,525,375 | G→A | 5.7% | G336D (GGC→GAC) | murC → | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,525,375 | 0 | G | A | 5.7% | 212.6 / 2.3 | 70 | G336D (GGC→GAC) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base A (2/2); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 |
AACCACAACGTGCTCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGCACCCGCGACTTGTAC > NC_002947/1525230‑1525517 | aaCCACAACGTGCTCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAg > 5:233632/1‑149 (MQ=255) acaACGTGCTCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCAGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAgtgt > 7:266884/1‑148 (MQ=255) tGCTCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTg < 3:37477/149‑1 (MQ=255) tCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGACAGTGTGATGCTGGTc > 7:178046/1‑149 (MQ=255) tCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGACAGTGTGATGCTGGTc > 7:172632/1‑149 (MQ=255) cAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTc > 3:164778/1‑148 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGa < 5:97574/139‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGa > 6:97574/1‑139 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcgc > 5:95476/1‑148 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcga > 3:210234/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcga > 8:375525/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcgac > 1:174053/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcgac < 6:382709/149‑1 (MQ=255) aCGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTcgac > 1:47950/1‑149 (MQ=255) gCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACg < 5:204131/148‑1 (MQ=255) gCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACg < 4:210234/148‑1 (MQ=255) ccatcgccaCTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGGACTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCAccc > 1:318736/1‑149 (MQ=255) caCTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAg > 7:45928/1‑149 (MQ=255) tGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCAACGAAGTgg > 1:141416/1‑149 (MQ=255) atgCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCGTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGcggcgg < 2:329192/147‑1 (MQ=255) aGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGcggcgg < 2:174053/149‑1 (MQ=255) aGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGcggcgg < 3:395505/149‑1 (MQ=255) tACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATc > 7:93092/1‑148 (MQ=255) tACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGACGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATc > 3:44159/1‑148 (MQ=255) aCGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCt > 5:151363/1‑149 (MQ=255) gAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCtgt < 2:215528/149‑1 (MQ=255) ccATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTgcgc < 2:47950/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGtggc < 4:44159/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGtggc < 8:93092/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGtggctg < 6:95476/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGtggctggc > 5:325118/1‑148 (MQ=255) ggCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGGGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACTGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGcc < 8:371358/149‑1 (MQ=255) cTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTGCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAg < 1:80148/149‑1 (MQ=255) tGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTggcgg > 1:187030/1‑114 (MQ=255) tGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTggcgg < 2:187030/114‑1 (MQ=255) gTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAgcc > 5:369702/1‑149 (MQ=255) tCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAgc < 2:141416/147‑1 (MQ=255) cGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAgccgc < 8:266884/148‑1 (MQ=255) ttCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCt > 1:282879/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGt < 6:325118/149‑1 (MQ=255) gggTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGa < 2:282879/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTggcgg < 8:185882/99‑1 (MQ=255) gtgtCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTggcgg > 7:185882/1‑99 (MQ=255) ggtcgTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGTGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTa > 5:26571/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTAc > 1:329617/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTAcc < 6:151363/149‑1 (MQ=255) tcgCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCt < 2:64441/132‑1 (MQ=255) tcgCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCt > 1:64441/1‑132 (MQ=255) tcgCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGc > 4:257890/1‑149 (MQ=255) gagtCCAGGTCTACGGCGAGCTGCGGGTCGACGTCGGCAGTGTGATTCTGGCCGACGACTACTGTCAGCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGGGGTTGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCg < 8:170929/146‑1 (MQ=255) ttCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCa > 5:337037/1‑149 (MQ=255) ccAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCAc < 7:375525/148‑1 (MQ=255) gTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGt > 3:292145/1‑83 (MQ=255) gTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGt < 4:292145/83‑1 (MQ=255) ataCGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTa > 3:32342/1‑147 (MQ=255) cGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGcc < 7:200555/149‑1 (MQ=255) cGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGACAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGcc < 8:178046/149‑1 (MQ=255) cGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGACAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGcc < 8:172632/149‑1 (MQ=255) gCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCg > 3:129530/1‑148 (MQ=255) gCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGccca > 1:338297/1‑99 (MQ=255) gCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCaa < 2:338297/101‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATc < 4:183946/118‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATc > 3:183946/1‑118 (MQ=255) gCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTAc > 4:86840/1‑136 (MQ=255) gCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTAc < 3:86840/136‑1 (MQ=255) ggTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGCACCCGCGAc < 5:201083/148‑1 (MQ=255) ggTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGCACCCGCGAc > 6:201083/1‑148 (MQ=255) aaGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGc < 4:56663/134‑1 (MQ=255) aaGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGc > 3:56663/1‑134 (MQ=255) aaGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGCACCCGCGACTTGTac > 8:56346/1‑149 (MQ=255) | AACCACAACGTGCTCAACGCCCTGGCGACCATCGCCATCGCCACTGACGAAGGCATTACTGACGAGGCCATCGTCCAGGGCCTGTCCGG‑CTTCCAGGGTGTCGGTCGTCGCTTCCAGGTATACGGCGAGCTGCCGGTCGAAGGCGGCAGTGTGATGCTGGTCGACGACTACGGTCATCACCCCACCGAAGTGGCGGCGGTGATCAAGGCTGTGCGCGGTGGCTGGCCAAGCCGCCGCCTGGTGATCGTCTACCAGCCGCACCGCTACAGCCGCACCCGCGACTTGTAC > NC_002947/1525230‑1525517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |