| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,681,669 | C→G | 7.9% | A63G (GCC→GGC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,681,669 | 0 | C | G | 7.9% | 236.4 / 7.5 | 73 | A63G (GCC→GGC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/30); new base G (3/3); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGG > NC_002947/1681532‑1681816 | ccTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc > 1:125309/1‑149 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagc < 8:35104/148‑1 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagc > 7:35104/1‑148 (MQ=255) gCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc > 4:219086/1‑149 (MQ=255) ccACCGTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGGGGGGGGTGAAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCATACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcca < 2:381590/149‑1 (MQ=255) tcccTTGCTGCCCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtcc < 1:366434/148‑7 (MQ=255) cTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑Ct < 6:294418/149‑1 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGCccagcaggt > 8:292344/1‑131 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggt < 7:292344/135‑5 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCAtcg > 2:400168/1‑149 (MQ=255) cgcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTc > 2:311067/1‑148 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGa < 3:25499/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTg > 1:3331/1‑149 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGcc < 3:219086/149‑1 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGc > 7:256224/1‑148 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGc > 7:79040/1‑148 (MQ=255) gCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAcc > 2:92056/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGc < 5:404257/149‑1 (MQ=255) gAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGAATTCGATGCCGACGGTGCCACCGc > 4:219507/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCa > 5:346543/1‑149 (MQ=255) aGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc < 6:346543/149‑1 (MQ=255) aGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc > 1:320243/1‑149 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCg > 1:142444/1‑149 (MQ=255) aCAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAcc < 7:20268/134‑1 (MQ=255) aCAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAcc > 8:20268/1‑134 (MQ=255) aCAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 2:125309/149‑1 (MQ=255) aCAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 8:79040/149‑1 (MQ=255) cAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCGAAGGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg > 1:137024/1‑149 (MQ=255) cAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 8:256224/148‑1 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGAt > 6:373742/1‑117 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGAt < 5:373742/117‑1 (MQ=255) gCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTg < 2:320243/149‑1 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 2:142444/149‑1 (MQ=255) cTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAc > 1:188706/1‑125 (MQ=255) cTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAc < 2:188706/125‑1 (MQ=255) ggCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGcc > 6:237116/1‑127 (MQ=255) ggCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGcc < 5:237116/127‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgc < 1:311067/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 6:258823/138‑1 (MQ=255) tgctgcCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg > 5:258823/1‑138 (MQ=255) ctgcCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACAGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcctg < 7:253363/147‑1 (MQ=255) cccTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgctg < 1:191037/147‑1 (MQ=255) tACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGc > 3:226414/1‑149 (MQ=255) agcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 4:3575/115‑1 (MQ=255) agcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg > 3:3575/1‑115 (MQ=255) agcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 3:244990/1‑140 (MQ=255) agcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt < 4:244990/140‑1 (MQ=255) agcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCAt < 1:92056/149‑1 (MQ=255) gcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATg > 5:421789/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCCCCGCCAGCACCGTCggg > 3:260809/1‑113 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 4:260809/113‑1 (MQ=255) aaGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc < 1:400168/147‑1 (MQ=255) aaGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGa > 7:5955/1‑149 (MQ=255) gCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAc > 5:30398/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc > 4:183406/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGcc > 1:176650/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGcc > 1:256061/1‑149 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt < 4:259140/132‑1 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt > 3:259140/1‑132 (MQ=255) tgGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGc > 7:280200/1‑149 (MQ=255) ggACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCt > 6:170168/1‑149 (MQ=255) gACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCtt > 6:72553/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCCCCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc > 2:254041/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc < 2:3331/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 3:183406/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 8:271967/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 8:302393/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg < 5:170168/148‑1 (MQ=255) gTCGAAGCCATCCACCAGCGCCAGCGCATCTCTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCAATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 1:245390/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTa > 7:181230/1‑149 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTa > 8:328798/1‑149 (MQ=255) aGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACg < 5:72553/149‑1 (MQ=255) gCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACgg < 2:176650/149‑1 (MQ=255) | CCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATC‑CTCATCGTCG‑GCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGG > NC_002947/1681532‑1681816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |