| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,736,646 | A→G | 5.2% | S332P (TCG→CCG) | dapD ← | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑succinyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,736,646 | 0 | A | G | 5.2% | 228.6 / 2.1 | 77 | S332P (TCG→CCG) | dapD | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑succinyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/36); new base G (2/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.31e-01 | |||||||||||
CCAGGGAGAGGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCGGTGATG > NC_002947/1736503‑1736791 | ccAGGGAGAGGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTtgt < 1:138028/149‑1 (MQ=255) aGGGAGAGGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGGCTTGT‑gg > 3:230266/1‑149 (MQ=255) gagGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCtt < 7:307097/149‑1 (MQ=255) gagGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCtt < 1:119779/149‑1 (MQ=255) ggCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCtt > 1:214485/1‑146 (MQ=255) ggCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCtt < 2:214485/146‑1 (MQ=255) tGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTc > 3:178629/1‑149 (MQ=255) aCATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTAcc < 3:133332/149‑1 (MQ=255) aCATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTAAATCAGCTCGATGGCCGACTAGT‑GGGTCTTGCATTCTaac > 1:341340/1‑147 (MQ=255) aTGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACcgc > 2:242314/1‑149 (MQ=255) gAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCAtt > 1:249233/1‑134 (MQ=255) gAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCAtt < 2:249233/134‑1 (MQ=255) ggCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGc > 5:115426/1‑149 (MQ=255) ccTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGa < 1:7661/149‑1 (MQ=255) gAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGGCTTGT‑GGGTCtt > 1:149673/1‑121 (MQ=255) gAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGGCTTGT‑GGGTCtt < 2:149673/121‑1 (MQ=255) gAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTg > 6:40452/1‑149 (MQ=255) gAATGAAAATCGGGTCTGGTACATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTtgt > 2:41117/1‑114 (MQ=255) gAATGAAAATCGGGTCTGGTACATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTtgt < 1:41117/114‑1 (MQ=255) tGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGGCTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTgcgg < 4:230266/149‑1 (MQ=255) gAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTgcggc > 8:144201/1‑149 (MQ=255) aaaaTCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTgcggc < 4:308012/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAgg > 5:12501/1‑149 (MQ=255) ggTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggtg > 7:294921/1‑148 (MQ=255) ggTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTAACGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggtc > 5:188451/1‑149 (MQ=255) gTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggtc < 4:140732/148‑1 (MQ=255) aTTGGCGCCAGACCGGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTACCTGCTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCt < 1:342656/149‑1 (MQ=255) cccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggtcggtc < 5:186087/136‑1 (MQ=255) cccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggtcggtc > 6:186087/1‑136 (MQ=255) cccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTggc < 3:226545/140‑1 (MQ=255) cccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTggc > 4:226545/1‑140 (MQ=255) ccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTc > 3:16605/1‑149 (MQ=255) ccGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTc < 5:40452/149‑1 (MQ=255) ttAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGc > 5:172423/1‑149 (MQ=255) aaCACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTGGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCgg < 8:294921/145‑1 (MQ=255) aaCACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGcc < 6:115426/148‑1 (MQ=255) aaCACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCt > 8:386154/1‑149 (MQ=255) acacCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCtt < 7:144201/149‑1 (MQ=255) acacCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCtt > 5:424172/1‑149 (MQ=255) cTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCATTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGAc > 2:257896/1‑148 (MQ=255) tCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGAcc > 3:1550/1‑148 (MQ=255) cAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCAc > 3:203901/1‑149 (MQ=255) aaaCCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTgcggcg > 4:184273/1‑103 (MQ=255) aaaCCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTgcggcg < 3:184273/103‑1 (MQ=255) aaCCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACtt < 4:203901/149‑1 (MQ=255) aCCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCATTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACttt < 1:257896/149‑1 (MQ=255) gTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCg < 7:208900/149‑1 (MQ=255) gTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCg < 6:7049/149‑1 (MQ=255) ttCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑CGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTAAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGTCCAGCTCGCCGGCCATGACCACATAGACCAGTTCgt > 5:411412/1‑149 (MQ=255) tcAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCgttgt > 6:153306/1‑149 (MQ=255) aGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTtc > 2:29582/1‑149 (MQ=255) ttGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTtctc < 1:242314/149‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTtctc < 6:12501/149‑1 (MQ=255) tgAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGt < 4:178629/148‑1 (MQ=255) tGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCcagcag > 4:376780/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGGTCGTGGTTCTCGTCCAGCAgg > 8:257706/1‑149 (MQ=255) 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tCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCgttgtt < 7:268594/128‑1 (MQ=255) tCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCgttgtt > 8:268594/1‑128 (MQ=255) ttCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggt > 3:221111/1‑73 (MQ=255) ttCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAggt < 4:221111/73‑1 (MQ=255) cTCGATGTCCGAATTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGGGCCGTTCAGGGAGTTGCTTCGGAACAGCAGGTCTGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCAATTTGACCAGTTCGTTGTTCTAGTc < 4:175588/126‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGACGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTc > 3:175588/1‑126 (MQ=255) gagggCCGACTTGT‑GGGTCTTGCTTTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGGCGGTCTGGCCGGCCAGGGCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTGCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCgg < 7:257706/146‑1 (MQ=255) gATGGCCAACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACTGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCgg < 2:256419/149‑1 (MQ=255) gCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCGGTGa < 6:172423/148‑1 (MQ=255) gCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCGGTGa < 7:386154/148‑1 (MQ=255) ccGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGTCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCcg > 1:365374/1‑141 (MQ=255) ccGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGTCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCcg < 2:365374/141‑1 (MQ=255) ccGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGCCCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCAACTTGGTGCCCGCGGTGATg > 4:211430/1‑149 (MQ=255) cGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTg < 6:21906/136‑1 (MQ=255) cGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTg > 5:21906/1‑136 (MQ=255) | CCAGGGAGAGGGCTGGAACATGTTTGCGAGGCCTGGAATGAAAATCGGGTCTGGTGCATTGGCGCCAGACCCGATCTTAACACCTCAAACCCGGCAGGGTTCTCAGTTGTGAGCGTGCAGCGCTTCGTTCAGCTCGATGGCCGACTTGT‑GGGTCTTGCATTCTACCGCGCCGTTCAGCGAGTTGCGGCGGAACAGCAGGTCGGTCTGGCCGGCCAGGTCGCGGGCCTTGACCACTTTGACCAGTTCGTTGTTCTCGTCCAGCAGGTTCACCTTGGTGCCCGCGGTGATG > NC_002947/1736503‑1736791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |