| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,744,888 | T→A | 6.3% | intergenic (‑14/+327) | PP_1542 ← / ← PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,744,888 | 0 | T | A | 6.3% | 194.6 / 3.3 | 63 | intergenic (‑14/+327) | PP_1542/PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/34); new base A (2/2); total (27/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
TTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAGG > NC_002947/1744744‑1745030 | ttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGcc > 5:416450/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgt < 7:209842/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgt < 7:12336/149‑1 (MQ=255) tcgtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgtt < 5:424102/149‑1 (MQ=255) tcgtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgtt < 2:17732/149‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGcc < 4:232666/149‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAACACCGGCCAAGCCGgtgcttgca < 3:183703/148‑7 (MQ=255) tAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCt < 7:187812/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGa > 4:125096/1‑149 (MQ=255) cTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATa < 3:125096/149‑1 (MQ=255) gggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGt > 2:122506/1‑149 (MQ=255) gggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGt > 4:287757/1‑149 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttg < 8:98604/134‑1 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttg > 7:98604/1‑134 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATatgtagc > 4:285338/1‑143 (MQ=255) gTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCa < 1:117229/149‑1 (MQ=255) gAAATGGGTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 3:324266/148‑1 (MQ=255) gTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCAtt > 5:214311/1‑149 (MQ=255) tttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt > 3:301577/1‑121 (MQ=255) tttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt < 4:301577/121‑1 (MQ=255) ccGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt < 5:401947/148‑1 (MQ=255) ccGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt < 8:30581/148‑1 (MQ=255) ggTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgat < 5:133401/149‑1 (MQ=255) cGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCAATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt < 5:274813/148‑1 (MQ=255) ggCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa > 6:319221/1‑149 (MQ=255) aTCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAc < 6:416450/149‑1 (MQ=255) cccGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg < 6:379969/89‑1 (MQ=255) ccGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAg > 1:384754/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGTATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGt < 1:227206/149‑1 (MQ=255) gTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACgaga < 1:395843/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg < 6:315887/76‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg > 5:315887/1‑76 (MQ=255) ccAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATg > 6:244755/1‑148 (MQ=255) ccAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGa < 1:206658/149‑1 (MQ=255) ggtgCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAccc < 8:260832/148‑1 (MQ=255) gCCAGAGCAAGTCGAGCGGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGt < 8:17387/88‑1 (MQ=255) gagCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGAc > 4:359248/1‑149 (MQ=255) agCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGAcc < 8:194509/149‑1 (MQ=255) gCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa < 3:357258/116‑1 (MQ=255) gCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa > 4:357258/1‑116 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAccc > 5:238128/1‑139 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAccc < 6:238128/139‑1 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc < 2:407249/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGc < 3:359248/148‑1 (MQ=255) aGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCcaa < 6:214311/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATa < 4:148676/104‑1 (MQ=255) ttCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATa > 3:148676/1‑104 (MQ=255) tGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAAt > 2:158868/1‑149 (MQ=255) cGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCTGTGTTGTGCCTGATATTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgca < 2:384754/147‑1 (MQ=255) cGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcag > 1:93317/1‑148 (MQ=255) cGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcag < 5:319221/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAAGCAGGAAATCGCagcagc > 8:291421/1‑149 (MQ=255) ctcCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCAtt > 5:312341/1‑149 (MQ=255) aTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTATTGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGACAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTATCTGCATtgat > 7:145470/1‑148 (MQ=255) cacaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAg > 6:421111/6‑149 (MQ=255) acaacACCGGCCAAGCCGGTGCTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCcaa > 7:85562/5‑110 (MQ=255) acaacACCGGCCAAGCCGGTGCTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCcaa < 8:85562/106‑1 (MQ=255) aaGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc > 4:308153/1‑102 (MQ=255) aaGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc < 3:308153/102‑1 (MQ=255) gCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCAt > 8:273237/1‑138 (MQ=255) gCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCAt < 7:273237/138‑1 (MQ=255) cACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGAt > 4:404586/1‑147 (MQ=255) ccGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAAAGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGACAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCACGGCATTGATGAGGATCAgg > 2:90448/1‑149 (MQ=255) | TTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCT‑‑TCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAGG > NC_002947/1744744‑1745030 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |