Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,748,903 | A→G | 6.1% | intergenic (‑236/‑96) | PP_1548 ← / → PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,748,903 | 0 | A | G | 6.1% | 243.6 / 4.5 | 82 | intergenic (‑236/‑96) | PP_1548/PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/41); new base G (3/2); total (39/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.65e-01 |
GACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCT > NC_002947/1748758‑1749045 | gACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACtt < 3:395886/149‑1 (MQ=255) cATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGc < 7:241935/149‑1 (MQ=255) cATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGc < 6:334958/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCAtt > 3:93812/1‑149 (MQ=255) acctactaaGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTta < 1:255703/140‑1 (MQ=255) aGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGaa > 8:321732/1‑129 (MQ=255) aGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGaa < 7:321732/129‑1 (MQ=255) aGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATg < 6:368907/149‑1 (MQ=255) cTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCt > 2:400347/1‑149 (MQ=255) gCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTACTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCtt < 8:136882/147‑1 (MQ=255) cTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑t < 1:83813/148‑1 (MQ=255) tACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATATGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTAGATGAAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTAG‑ttt > 8:130208/1‑149 (MQ=255) cGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTaaa < 5:186704/148‑1 (MQ=255) cGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAAt < 3:373154/149‑1 (MQ=255) gTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTAGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCAGGCTTG‑GTTTTTAAATg > 5:415694/1‑149 (MQ=255) tAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTTGCTTCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGc < 3:194628/149‑1 (MQ=255) accaGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAAATGCAAgttcgc > 3:337879/1‑144 (MQ=25) accaGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGc < 6:175712/149‑1 (MQ=255) caGAACTCAATCGGCGGATTAAGTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGGTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGGATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCtt < 7:130208/149‑1 (MQ=255) aaCTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTtgtg > 3:139043/1‑149 (MQ=255) cTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGc < 3:26231/134‑1 (MQ=255) cTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGc > 4:26231/1‑134 (MQ=255) aaTCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAAATGCAAGTT‑‑CGCTtgcattt < 4:337879/147‑6 (MQ=21) aaTCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAAtt < 4:93812/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAAtt > 7:116358/1‑149 (MQ=255) gATTAACACGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTa < 8:363100/149‑1 (MQ=255) ttgagttcTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATg < 5:25789/142‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGTTCGCTTGCAttt > 1:281767/1‑89 (MQ=25) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGTTCGCTTGCAttt < 2:281767/89‑1 (MQ=25) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑tttttt < 8:24335/110‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑tttttt > 7:24335/1‑110 (MQ=255) ggCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATg < 4:15946/147‑1 (MQ=255) gcCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGt > 3:396263/1‑149 (MQ=255) tggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCa > 1:372183/1‑149 (MQ=255) gtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgt < 4:396263/149‑1 (MQ=255) gtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAg < 1:400347/148‑1 (MQ=255) gCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgt < 8:116358/148‑1 (MQ=255) tCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCAGTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgtg > 6:274682/1‑147 (MQ=255) aTCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAg < 2:372183/148‑1 (MQ=255) tCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAg > 8:167797/1‑147 (MQ=255) tgctgGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATgg < 3:403803/130‑1 (MQ=255) tgctgGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATgg > 4:403803/1‑130 (MQ=255) ggTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGATTGAGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGAGTGTAGGAGCTTTc > 2:198494/1‑149 (MQ=255) gTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGGCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 1:32343/1‑149 (MQ=255) gTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 1:361076/1‑149 (MQ=255) gTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGATGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 1:16954/1‑149 (MQ=255) tttttAAAGCGCGGTCGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCgg < 2:351201/149‑1 (MQ=255) tttttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGGATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 5:369737/1‑148 (MQ=255) ttttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCATTTAGTTGTTTAATTTTCTATTTCTGTATGTTTGTCCAGTGTTTTGGAGGtttgg > 1:337098/1‑147 (MQ=255) tttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGc < 4:247315/88‑1 (MQ=255) tttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGc > 3:247315/1‑88 (MQ=255) tttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGAt > 4:137234/1‑149 (MQ=255) agagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGAt > 8:189785/1‑119 (MQ=255) agagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGAt < 7:189785/119‑1 (MQ=255) agagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCgg > 5:417373/1‑149 (MQ=255) gagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAATTGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGgc > 7:25481/1‑149 (MQ=255) gagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgt > 4:13803/1‑127 (MQ=255) gagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgt < 3:13803/127‑1 (MQ=255) gagCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGgc < 2:361076/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGgcgc < 3:137234/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCa < 6:369737/149‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAATTGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAg < 8:25481/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTc < 1:14843/133‑1 (MQ=255) tGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTc > 2:14843/1‑133 (MQ=255) gAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGt > 3:291889/1‑149 (MQ=255) gcAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTAt < 2:32343/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTa < 4:291889/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTAt > 3:176438/1‑149 (MQ=255) cTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGaa < 2:16954/149‑1 (MQ=255) tCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATgg > 5:35920/1‑146 (MQ=255) ttttataaatgcaaGTTCGCTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAaga > 2:355762/7‑149 (MQ=255) gATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAagag > 2:122606/1‑149 (MQ=255) tgcaaatgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGaa < 7:155373/144‑1 (MQ=255) tgcaaatgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGaa > 8:155373/1‑144 (MQ=255) tgcaaatgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGc < 1:119047/148‑1 (MQ=255) atgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGa < 4:139043/149‑1 (MQ=255) caaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGcc > 6:49948/1‑149 (MQ=255) caaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAAATTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGAAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGcc < 6:377773/149‑1 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTc > 6:230134/1‑100 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTc < 5:230134/100‑1 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg < 2:380379/101‑1 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 1:380379/1‑101 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATTGAAGAGCTAACGAgagt > 8:181213/1‑146 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCt > 8:19420/1‑149 (MQ=255) | GACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAATGCAAGCA‑‑CGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCT > NC_002947/1748758‑1749045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |