Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 285,287 | G→C | 5.5% | Q55E (CAG→GAG) | atsK ← | alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 285,287 | 0 | G | C | 5.5% | 233.4 / 2.6 | 72 | Q55E (CAG→GAG) | atsK | alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/36); new base C (2/2); total (34/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
AAAAGGTCACGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTGGGCTTAGGGGA > NC_002947/285143‑285432 | aaaaGGTCACGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGt > 2:211876/1‑149 (MQ=255) tCACGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCgg < 1:398522/148‑1 (MQ=255) cGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATGGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTg < 8:29365/149‑1 (MQ=255) cGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTg < 4:16459/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCg < 7:174841/149‑1 (MQ=255) ccACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGt > 3:222681/1‑149 (MQ=255) cacaCGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTc > 6:230230/1‑149 (MQ=255) acacGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTCCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTcg > 1:267964/1‑149 (MQ=255) acacGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGACGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGGTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTCCTGTGCCGGGTTGCTCGGCTGGTcg > 1:273858/1‑149 (MQ=255) acGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTcgcg > 8:140986/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTcgcg > 5:79695/1‑147 (MQ=255) ttGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGaa < 3:257272/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAAc < 1:316833/148‑1 (MQ=255) gTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAAc < 6:385760/148‑1 (MQ=255) tCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACa < 3:303959/148‑1 (MQ=255) gTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTg > 4:211233/1‑149 (MQ=255) cgccgTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCa < 1:211876/149‑1 (MQ=255) cgccgGGTCGAGCACAAGCCCCTGTGGGGTGTCTGGCACGTGGGGGTAACGCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGGCGCGGAGGAACAGCACCTGGGGCTGGAGCa < 6:209561/149‑1 (MQ=255) ccgTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTCCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGt < 2:267964/149‑1 (MQ=255) ccgTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGGCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCTGCAAAGCGCGCCTCCTGGTCCGGGTGGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGt < 2:273858/149‑1 (MQ=255) gtgtCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGc < 7:216446/149‑1 (MQ=255) tgtCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGcc < 1:50708/149‑1 (MQ=255) aGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTc > 5:193050/1‑149 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCggag < 2:135485/111‑1 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCAcc < 2:228112/121‑1 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCAcc > 1:228112/1‑121 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGc < 4:225259/138‑1 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGc > 3:225259/1‑138 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATgg < 6:193050/149‑1 (MQ=255) aaGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATgg < 7:140986/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCg < 4:244135/139‑1 (MQ=255) cTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCg > 3:244135/1‑139 (MQ=255) gggTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGctct < 2:90216/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCtcttc > 1:398038/1‑149 (MQ=255) gtgtCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCtcttc < 5:230230/149‑1 (MQ=255) tCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTg > 1:319255/1‑110 (MQ=255) tCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTg < 2:319255/110‑1 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTg > 7:278269/1‑111 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTg < 8:278269/111‑1 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTgcgc > 3:107264/1‑149 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTgcgc > 1:197601/1‑149 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTgcgc > 7:390650/1‑149 (MQ=255) tGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGACTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTgcgc > 5:275912/1‑149 (MQ=255) ggCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCt > 8:43774/1‑149 (MQ=255) gCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGtt > 8:260319/1‑105 (MQ=255) gCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTgcgc < 6:79695/147‑1 (MQ=255) gCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTg < 7:43774/149‑1 (MQ=255) gCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTg < 3:211233/149‑1 (MQ=255) ttGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATc > 2:284037/1‑149 (MQ=255) ggggTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGaa < 8:388478/87‑1 (MQ=255) ggggTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGaa > 7:388478/1‑87 (MQ=255) gtgCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCAcgccgc > 2:412821/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCAcgccgc < 6:374921/147‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTggg > 6:164547/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTggg > 2:212833/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTgg > 4:44845/1‑148 (MQ=255) gCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTgg < 3:44845/148‑1 (MQ=255) ccGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGgc > 4:127909/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGcc > 4:61966/1‑147 (MQ=255) gCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGa < 8:390650/149‑1 (MQ=255) cGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAg > 3:233881/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAg < 7:266217/149‑1 (MQ=255) gTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGt < 3:127909/149‑1 (MQ=255) gTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGt > 6:157336/1‑149 (MQ=255) cGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCt > 7:239095/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTg < 8:239095/149‑1 (MQ=255) ggCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTg > 1:404758/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCCGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTg < 4:107264/149‑1 (MQ=255) cgcgcCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTgg > 2:45535/1‑129 (MQ=255) cgcgcCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTgg < 1:45535/129‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTGGGCTTAgg < 1:284037/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTGGGCTTAGGGGa < 6:275912/149‑1 (MQ=255) | AAAAGGTCACGTCGGTGTGCCACACGGCGTTGTCGCGCACATCGGTAACCGCCGTGTCGAGCACAAGCACCTGTGGGGTGTCTGGCACGTTGGGGTAAATCGGGTGGATGTGCAGGTCGCCGAAGCGTGCGGCAAAGCGCGCCTGCTGTTCCGGGTTGATCGGCTGGTCGCGGAGGAACAGCACCTGGTGCTGGAGCAGTGCCTGTTCGATGGCATCGCGCTCTTCTGCGCTGATATCGCGGCTGATGTCCACGCCGCTGATCTGGGCGCCGAGTGCTGGGCTTAGGGGA > NC_002947/285143‑285432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |