| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,823,005 | T→A | 6.0% | H750L (CAC→CTC) | mutS ← | DNA mismatch repair protein MutS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,823,005 | 0 | T | A | 6.0% | 208.4 / 2.8 | 67 | H750L (CAC→CTC) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/34); new base A (2/2); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
CAGGCTGGTGGTTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGAC > NC_002947/1822857‑1823142 | cAGGCTGGTGGTTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATtgt < 3:276026/149‑1 (MQ=255)cAGGCTGGTGGTTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATtgt < 1:336715/149‑1 (MQ=255) tggtggTTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCg > 6:174290/1‑149 (MQ=255) ggtggtTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCgg > 3:201001/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAgg < 6:351095/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGt < 7:124790/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGt < 5:346978/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCAc < 8:56738/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCAc < 8:50407/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTg < 8:156467/131‑1 (MQ=255) ggTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTg > 7:156467/1‑131 (MQ=255) ggTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTg < 6:159533/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTg < 5:174290/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGcca < 2:236895/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGtt > 5:346197/1‑143 (MQ=255) tCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGtt < 6:346197/143‑1 (MQ=255) gCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCgg > 8:169244/1‑149 (MQ=255) gCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCgg < 1:40513/149‑1 (MQ=255) gCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGgctcg > 3:89431/1‑149 (MQ=255) gCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGgctcg < 1:5812/149‑1 (MQ=255) tGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGgctcg‑ct > 3:379413/1‑149 (MQ=255) ggATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGgctcg‑ctc > 4:152131/1‑149 (MQ=255) ccGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGATTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGTCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGgcag > 3:218795/1‑148 (MQ=255) ggTAGGCCGGCCAACTGCGCAACGGACAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATTCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCATGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGt < 4:218795/149‑1 (MQ=255) ggTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGt < 4:67261/149‑1 (MQ=255) tACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCa < 3:152131/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGtt > 5:95227/1‑149 (MQ=255) ccAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAag < 4:255093/149‑1 (MQ=255) ccAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGAGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCa < 7:141989/141‑1 (MQ=255) ccAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGAGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCa < 7:147613/141‑1 (MQ=255) ccAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGAGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCa > 8:141989/1‑141 (MQ=255) ccAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGAGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCa > 8:147613/1‑141 (MQ=255) aaCTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAag > 6:78775/1‑147 (MQ=255) aaCTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAag > 8:186702/1‑147 (MQ=255) cTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAagtagt < 4:379413/149‑1 (MQ=255) cgcAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCGACTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAgtgg < 1:55417/149‑1 (MQ=255) cgcAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAgtgg < 8:223930/148‑1 (MQ=255) cAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAgtgggtg < 4:201001/149‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGgca < 1:171603/122‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGgca > 2:171603/1‑122 (MQ=255) gCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGaa < 7:169244/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGaa > 2:276496/1‑148 (MQ=255) gCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAg < 1:252079/148‑1 (MQ=255) cTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTTAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAgg > 5:420381/1‑148 (MQ=255) cTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAgg > 1:77535/1‑148 (MQ=255) ggctggcAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACg < 7:9902/148‑1 (MQ=255) ggctggcAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACg > 8:138222/1‑148 (MQ=255) ctggcAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAg > 6:242783/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTgg < 4:89431/149‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGt > 3:325704/1‑106 (MQ=255) aGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGt < 4:325704/106‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTggg > 7:285224/1‑149 (MQ=255) gggCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGGGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCTCGTTGGGCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGc < 4:333780/149‑1 (MQ=255) ccGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCCCGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAg > 2:330976/1‑149 (MQ=255) ccGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGctgc > 3:2736/1‑146 (MQ=255) gggTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGgc < 7:186702/149‑1 (MQ=255) ggTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGgcg < 2:77535/149‑1 (MQ=255) aGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGtt < 3:262489/97‑1 (MQ=255) aGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGtt > 4:262489/1‑97 (MQ=255) cACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGaa < 6:228860/99‑1 (MQ=255) cACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGaa > 5:228860/1‑99 (MQ=255) gtggtgCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGgcagc > 2:184746/1‑82 (MQ=255) gtggtgCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGgcagc < 1:184746/82‑1 (MQ=255) gtgCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAg > 6:237722/1‑112 (MQ=255) gtgCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAACTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAg > 3:272334/1‑149 (MQ=255) gAAGACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGGTCAGGTGCACGTTGGCCTCCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCATCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCa < 4:272334/147‑1 (MQ=255) acGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAg > 2:359777/1‑149 (MQ=255) acGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAg > 3:342773/1‑149 (MQ=255) gCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTTAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGAc < 6:420381/148‑1 (MQ=255) | CAGGCTGGTGGTTTCCAGCCGGCCAAGGTGCTCGCGGGCACGCTGGATCACTGCCGTCGGTACGCCGGCCAACTGCGCAACGGCCAGGCCGTAGCTTTGGCTGGCAGGGCCGGGTAGCACGTGGTGCAGGAACACGATGCGTTCATTGTGCTCGGTGGCGTTCAGGTGCACGTTGGCCACCAGCGGCTCG‑CTCTCCGGCAGCACGGTCAGTTCGAAGTAGTGGGTGGCGAACAAGGTGTAGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGAC > NC_002947/1822857‑1823142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |