Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,859,120 | C→G | 8.1% | intergenic (+40/+61) | PP_1661 → / ← PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,859,120 | 0 | C | G | 8.1% | 234.6 / 9.2 | 74 | intergenic (+40/+61) | PP_1661/PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/32); new base G (3/3); total (39/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.75e-01 |
TTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGCCCAC > NC_002947/1858979‑1859264 | ttGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCAttt > 2:36196/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTggg > 2:373955/1‑149 (MQ=255) gCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTgggg < 3:179229/149‑1 (MQ=255) gCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGc > 3:211375/1‑148 (MQ=255) aTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCa > 8:298565/1‑149 (MQ=255) tGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAg > 5:383348/1‑149 (MQ=255) tGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAg < 1:373955/149‑1 (MQ=255) cgacCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGcc > 3:176361/1‑148 (MQ=255) gacCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGcc > 4:208094/1‑147 (MQ=255) ccTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATTCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAgg > 2:294336/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGc > 1:176027/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGc > 1:38425/1‑149 (MQ=255) gACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTgggg < 5:10378/127‑1 (MQ=255) gACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTgggg > 6:10378/1‑127 (MQ=255) gACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAg > 1:221102/1‑149 (MQ=255) gCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgg > 4:379203/1‑149 (MQ=255) cGTTACGTGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAggg < 5:405359/149‑1 (MQ=255) cGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAggg < 5:410986/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTcgccg < 2:221102/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTcgccg > 4:5045/1‑149 (MQ=255) gCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCATTg > 7:190402/1‑149 (MQ=255) cTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTggg < 5:88107/105‑1 (MQ=25) cTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTggg > 6:88107/1‑105 (MQ=25) gATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGt > 5:140559/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgggg > 3:303671/1‑124 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgggg < 4:303671/124‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCAtt < 5:105715/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCAtt > 6:105715/1‑148 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATtg > 2:268587/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCATTGG‑GCAGGGTCATtgt < 8:190402/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGgcgcgc < 6:383348/149‑1 (MQ=255) gTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTg > 6:138395/1‑149 (MQ=255) gcGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGGGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGCTGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTgg < 7:287735/148‑1 (MQ=255) gagGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑CCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTcc < 1:36196/149‑1 (MQ=255) gTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAgg > 2:327607/1‑149 (MQ=255) gTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAgg > 4:133963/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGATTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCtt < 5:171335/149‑1 (MQ=255) tttCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTc < 3:5045/149‑1 (MQ=255) ggggCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCA‑GGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCt < 2:38425/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCt > 4:273368/1‑148 (MQ=255) gtgtAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGtt < 7:372828/127‑1 (MQ=255) gtgtAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAAcg > 3:398836/1‑149 (MQ=255) tAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAAcgcg < 3:379203/148‑1 (MQ=255) tAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCgg > 6:138109/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTcc < 7:49277/126‑1 (MQ=255) ggCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTcc > 8:49277/1‑126 (MQ=255) gCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTAt > 3:245773/1‑149 (MQ=255) cccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTAtt > 8:114041/1‑149 (MQ=255) ccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCTTTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTg < 4:211375/149‑1 (MQ=255) ccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTg < 8:8777/149‑1 (MQ=255) ccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTg < 4:398836/149‑1 (MQ=255) ccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTg < 2:176027/149‑1 (MQ=255) gTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGTGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgtg > 5:98626/1‑149 (MQ=255) tCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgtgt < 7:298565/149‑1 (MQ=255) tCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgt < 5:138395/147‑1 (MQ=255) tgagCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGc > 3:28417/4‑149 (MQ=37) gagCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAg < 4:356054/125‑1 (MQ=25) ggCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTcc < 2:147513/115‑1 (MQ=255) ggCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTcc > 1:147513/1‑115 (MQ=255) cAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGTTCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTc < 1:327607/149‑1 (MQ=255) ccACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc < 4:245773/149‑1 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAt > 4:100934/1‑74 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAt < 3:100934/74‑1 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAg < 8:357800/109‑1 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAg > 7:357800/1‑109 (MQ=255) gATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTa < 3:208094/149‑1 (MQ=255) ctgcGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGa < 4:28417/146‑1 (MQ=255) tCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTgg < 3:289279/93‑1 (MQ=255) tCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTgg > 4:289279/1‑93 (MQ=255) cGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGaa < 1:294336/147‑1 (MQ=255) cGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACa > 2:107989/1‑149 (MQ=255) gCATTGCCGGAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATg > 5:114081/1‑149 (MQ=255) gCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATg > 5:81554/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCATTTTGGCGTTGCTCACAGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTACGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGAGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTGAACGCGGTATTGGTCTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGCcgac > 1:100390/1‑148 (MQ=255) gcagcaTTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCgg < 3:261201/108‑1 (MQ=255) gcagcaTTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCgg > 4:261201/1‑108 (MQ=255) | TTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGG‑GCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGCCCAC > NC_002947/1858979‑1859264 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |