Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,875,613 | A→G | 6.8% | K113E (AAA→GAA) | cobS → | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,875,613 | 0 | A | G | 6.8% | 167.1 / 2.5 | 59 | K113E (AAA→GAA) | cobS | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/27); new base G (2/2); total (30/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 |
CAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATCGGGCGGGCGGCGATGTTGGGT > NC_002947/1875466‑1875759 | cAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGaa < 3:57832/149‑1 (MQ=255) aGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGa > 6:46115/1‑147 (MQ=255) ggTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGa > 6:118246/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAg < 7:318811/149‑1 (MQ=255) ccgcTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTgg > 3:196059/1‑149 (MQ=255) ccgcTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTgg > 7:310067/1‑149 (MQ=255) ccgcTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTgg > 2:317329/1‑149 (MQ=255) gcTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGc < 8:310067/149‑1 (MQ=255) tGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCg < 4:196059/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGAtt < 2:122245/149‑1 (MQ=255) tttGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCCCAGTGGGCCGATTGCCGtcg > 4:165746/1‑147 (MQ=255) aCGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGt < 2:209749/149‑1 (MQ=255) gtgGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTgg > 1:47012/1‑149 (MQ=255) gtgGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTg < 7:72445/148‑1 (MQ=255) ggTACCGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGTTCACGCTgg < 5:238856/140‑1 (MQ=255) ggTACCGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTgg > 6:238856/1‑140 (MQ=255) cTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGtgttgt < 4:100015/148‑1 (MQ=255) cTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGttgttg < 8:318972/147‑1 (MQ=255) cTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCt > 4:125312/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGGAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGt < 2:282539/132‑1 (MQ=255) cAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGGAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGt < 8:219251/132‑1 (MQ=255) cAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGGAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGt > 7:219251/1‑132 (MQ=255) cAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGGAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGt > 1:282539/1‑132 (MQ=255) tgCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGGAGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCTACCGTGAGCGCACCTTGCGTATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGtttt < 3:165746/149‑1 (MQ=255) cTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTgcg > 3:271569/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTgttgtt > 1:105451/1‑134 (MQ=255) cACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTTCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACTCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTgcg < 2:270202/145‑1 (MQ=255) cACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTgcg > 1:270202/1‑145 (MQ=255) aCCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATtg > 6:321919/1‑149 (MQ=255) ggATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTggg > 5:117370/1‑149 (MQ=255) gATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGTGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCA‑GCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTg < 5:46115/149‑1 (MQ=255) gtgcTGGCGGACAGTGGCGACGCGTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAATGTCCCGCGGAGTGGTCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGc < 1:74778/145‑1 (MQ=255) cAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCgggcagg < 2:47012/149‑1 (MQ=255) aGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCgggcaggg > 2:273727/1‑149 (MQ=255) tGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCgggcagggca > 3:71136/1‑149 (MQ=255) ccGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGttgttg > 3:229786/1‑107 (MQ=255) ccGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGttgttg < 4:229786/107‑1 (MQ=255) cGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCg < 3:170429/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCggg < 6:117370/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGgc < 5:118246/149‑1 (MQ=255) gCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAAt > 1:133198/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGGGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATtgc < 2:16603/149‑1 (MQ=255) gtggtTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATtgt > 7:110928/1‑111 (MQ=255) gtggtTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATtgt < 8:110928/111‑1 (MQ=255) gtggtTTCGGCGACCGTCAGCGCACCTTGCTGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTAACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGAATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATtgat > 6:202044/1‑146 (MQ=255) ggtTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTgctgct < 3:125312/149‑1 (MQ=255) ggCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCg < 5:413803/127‑1 (MQ=255) ggCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCg > 6:413803/1‑127 (MQ=255) cGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGt < 1:317329/149‑1 (MQ=255) gACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGtt < 1:273727/149‑1 (MQ=255) cGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGtttt < 4:371192/88‑1 (MQ=255) cGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGtttt > 3:371192/1‑88 (MQ=255) cGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGAt > 6:134584/1‑149 (MQ=255) gTGATCGAATCTTTCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTTGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTTCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATc < 4:271569/149‑1 (MQ=255) gTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGT‑GGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATcg > 3:113413/1‑149 (MQ=255) gAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTCGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGt < 8:46626/142‑1 (MQ=255) gAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTCGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGt > 7:46626/1‑142 (MQ=255) gcgcACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTACTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATcgggc > 4:362204/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGTGCCGTTGATCGggcgggcg > 8:266742/1‑149 (MQ=255) cATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATCGGGCGGGCGGCGATGTTgg > 3:124736/1‑149 (MQ=255) tGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATCGGGCGGGCGGCGATGTTGGGt > 3:105092/1‑149 (MQ=255) | CAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTGCTCAGTGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCGGACAGTGCCGACGCCTGGCTAGGTGGTTTCGGCGACCGTGAGCGCACCTTGCGGATCATGAAAGACCCGCGCAGTGGGCCGATTGCCGTGGTCACGCTGGTCTTGGTGTTGTTGCTGAAGTTTTGCGCATTGTGGGTGCTGGTCGGGCAGGGCATCGGGGCGCAATTGCTGCTGGCGCCGTTGATCGGGCGGGCGGCGATGTTGGGT > NC_002947/1875466‑1875759 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |