Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,933,674 | A→C | 8.4% | L27R (CTC→CGC) | minD ← | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,933,674 | 0 | A | C | 8.4% | 217.4 / 9.7 | 71 | L27R (CTC→CGC) | minD | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/33); new base C (4/2); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
TCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAGG > NC_002947/1933531‑1933820 | tCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCg > 5:21835/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCTTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGccac < 5:227335/148‑3 (MQ=255) aGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCgg < 7:65185/148‑1 (MQ=255) ggCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTAc < 6:405507/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCa < 7:285182/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATgg > 5:194094/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATgg < 3:346680/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATggcgg < 8:59417/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGgcggcg > 5:60993/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGgcgccg < 7:321489/148‑3 (MQ=255) gCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTgg > 5:148222/1‑148 (MQ=255) gCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATAACGGTCATGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCCGTACCAATGCCGCCCCTgg > 1:135422/1‑148 (MQ=255) ttCGCCGTTGCCCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGAGCGAGGCCGGTACCAAAGGCGGCGCTGGTAg > 3:326223/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTg < 6:148222/148‑1 (MQ=255) gCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTg < 6:194094/148‑1 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTc > 3:136419/1‑149 (MQ=255) ccACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGTGGCGCTGGTa < 8:158797/137‑1 (MQ=255) ccACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGTGGCGCTGGTa > 7:158797/1‑137 (MQ=255) ccACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGccc > 6:83178/1‑149 (MQ=255) aCGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATggcg < 4:380819/126‑1 (MQ=255) aCGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATggcg > 3:380819/1‑126 (MQ=255) aCGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACAccccc > 4:94288/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGt > 6:79962/1‑133 (MQ=255) cGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGt < 5:79962/133‑1 (MQ=255) cGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACAcccccc < 6:128113/149‑1 (MQ=255) tCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTTGTAGTGGTCTTGCCCACACACCCCTTGcc > 8:176155/1‑149 (MQ=255) gTACACCACGCGGGGTTTGGAGGCCATGATAAGGTTGAGGTTACGCATGCCCAAGTGGTAGTCGTCAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCATTTGGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCg < 2:135422/148‑1 (MQ=255) caccacGCGGCGTTCGCAGCCCTTGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGGCGACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGaa < 4:326223/148‑1 (MQ=255) cgcgGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt < 4:401891/100‑1 (MQ=255) cgcgGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt > 3:401891/1‑100 (MQ=255) cgcgGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAAc > 5:312556/1‑148 (MQ=255) ttCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGaa > 6:334926/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCt > 1:1395/1‑149 (MQ=255) aGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGGCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTg < 6:21835/149‑1 (MQ=255) gCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTgg < 6:60993/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGgtg > 3:15244/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAAGGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCGGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGttt < 7:176155/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCa < 2:1395/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCa > 1:397057/1‑149 (MQ=255) tCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCa > 7:238322/1‑149 (MQ=255) gAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAcc > 5:266904/1‑149 (MQ=255) gAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAcc > 3:136993/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaaaa > 8:37219/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaaaa > 7:172270/1‑149 (MQ=255) aGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaaaa < 5:270997/147‑1 (MQ=255) aGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTaaaaa > 6:270997/1‑147 (MQ=255) cccACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTc < 1:317594/149‑1 (MQ=255) cACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCgg < 8:172270/149‑1 (MQ=255) aCGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCgg > 8:126401/1‑148 (MQ=255) gTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGac < 6:266904/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATa > 5:114411/1‑138 (MQ=255) gAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATa < 6:114411/138‑1 (MQ=255) gAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGacac < 8:238322/148‑1 (MQ=255) gTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGt < 3:94288/149‑1 (MQ=255) gTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGAAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTAGGCCAAGGTGTTTCCCCCCTAAATATAGTCGGCACACTTGt > 6:275808/1‑149 (MQ=255) gACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGc < 1:85731/108‑1 (MQ=255) gACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGc > 2:85731/1‑108 (MQ=255) aaTGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGc < 7:126401/149‑1 (MQ=255) ggTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCaaaaaa < 5:83178/149‑1 (MQ=255) ggTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCaaaaa > 7:353902/1‑148 (MQ=255) gtaccggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCt > 8:185282/6‑138 (MQ=255) gtaccggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCt < 7:185282/133‑1 (MQ=255) accggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGa > 2:270534/4‑148 (MQ=255) tgGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGaaa < 2:335208/148‑1 (MQ=255) gCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAg < 4:136993/149‑1 (MQ=255) ccGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAccc < 6:392197/104‑1 (MQ=255) ccGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAccc > 5:392197/1‑104 (MQ=255) actGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCtaaat > 7:240077/3‑148 (MQ=255) actGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCtaaat > 5:395452/3‑148 (MQ=255) cGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAGATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAAAAAAg < 4:15244/148‑1 (MQ=255) gAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAgg > 2:303541/1‑148 (MQ=255) | TCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGTTACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAGG > NC_002947/1933531‑1933820 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |