| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,946,533 | C→T | 7.1% | intergenic (‑62/+22) | PP_1747 ← / ← PP_1748 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,946,533 | 0 | C | T | 7.1% | 207.7 / 3.9 | 70 | intergenic (‑62/+22) | PP_1747/PP_1748 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/32); new base T (3/2); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.82e-01 | |||||||||||
GCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATCGCTG > NC_002947/1946385‑1946678 | gCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGcc > 2:371825/1‑149 (MQ=255) gTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCt > 2:371700/1‑149 (MQ=255) ttGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCtt > 1:330160/1‑149 (MQ=255) tCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTg < 4:197223/148‑1 (MQ=255) tGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGcc > 7:370102/1‑149 (MQ=255) tGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGcc < 2:306937/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGcccc > 6:324813/1‑147 (MQ=255) tCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAg < 8:370102/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAggg > 8:17603/1‑149 (MQ=255) gTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGtt < 1:371700/149‑1 (MQ=255) aCGAAGTCCTCAATCAGGCGTGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTa < 1:371825/148‑1 (MQ=255) gAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGcc > 4:300156/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGcc > 8:47097/1‑149 (MQ=255) gTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCttt < 6:129436/149‑1 (MQ=255) gTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCttt < 7:47097/149‑1 (MQ=255) gTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCttt > 1:212143/1‑149 (MQ=255) tCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGttt > 3:141395/1‑149 (MQ=255) cAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc < 7:178692/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc < 1:150254/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc < 4:32850/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc < 2:330160/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc < 2:212143/148‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCTGCAAAGCGGCCCCaaca < 8:82906/129‑3 (MQ=255) aTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCTGCAAAGCGGCCCCaaca > 7:82906/1‑127 (MQ=255) aGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGAc < 7:17603/148‑1 (MQ=255) cGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAgg > 6:228009/1‑149 (MQ=255) gTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTg > 4:282938/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGCGGATCAGCAAGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAATCATTAGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTATCTTTCCGACCAGCCTGt > 3:218987/1‑149 (MQ=255) tttCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCTAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGtt < 2:33325/129‑1 (MQ=255) tttCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGtt > 1:33325/1‑129 (MQ=255) cGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGcc < 5:228009/148‑1 (MQ=255) ttGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGc < 1:142840/115‑1 (MQ=255) ttGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGc > 2:142840/1‑115 (MQ=255) gCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTAccc > 3:43314/1‑149 (MQ=255) gTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTc > 5:44848/1‑149 (MQ=255) aTGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATc > 2:329129/1‑143 (MQ=255) aTGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATc < 1:329129/143‑1 (MQ=255) ggTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATc > 3:190524/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATc > 8:350469/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATc < 1:386138/148‑1 (MQ=255) gCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTc < 4:141395/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAg > 2:354818/1‑149 (MQ=255) gtCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCt < 3:282938/149‑1 (MQ=255) tCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCt < 5:324813/148‑1 (MQ=255) tGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGttt > 2:243011/1‑71 (MQ=255) tGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGttt < 1:243011/71‑1 (MQ=255) aaaTAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggtgg > 3:235933/1‑149 (MQ=255) aaaTAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggtg < 7:350469/148‑1 (MQ=255) aaaTAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggt < 6:44848/147‑1 (MQ=255) aTGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTcc < 6:71924/114‑1 (MQ=255) aTGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTcc > 5:71924/1‑114 (MQ=255) cATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCaa < 4:43314/149‑1 (MQ=255) gCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGc > 6:213080/1‑134 (MQ=255) gCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGc < 5:213080/134‑1 (MQ=255) tACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGAc > 1:218070/1‑149 (MQ=255) gcgAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGaa > 8:340650/1‑133 (MQ=255) gcgAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGaa < 7:340650/133‑1 (MQ=255) aaCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGAc > 8:367063/1‑142 (MQ=255) aaCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGAc < 7:367063/142‑1 (MQ=255) aaCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGATTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTgg > 1:198667/1‑149 (MQ=255) aCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCcgc < 5:372281/84‑1 (MQ=255) aCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCcgc > 6:372281/1‑84 (MQ=255) ttCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTAGTTTCCGACCAGGCTGTCAACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGAGCATCGTGCTCCAGCAGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTCACGTATTTGccag > 2:42998/1‑147 (MQ=255) gAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTg < 4:190524/149‑1 (MQ=255) ccttGGGGCTGCAAAGCGGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGc < 4:9620/144‑1 (MQ=255) ccttGGGGCTGCAAAGCGGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGc > 3:9620/3‑146 (MQ=255) gtTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAAt > 3:317997/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCTGCAAAGCGGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATc > 2:49489/1‑149 (MQ=255) ggggCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATCGc > 6:423640/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTTTGCAGCCCCAAGTGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATCGCTg < 4:235933/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATCGCTg > 2:348746/1‑149 (MQ=255) | GCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAATCGCTG > NC_002947/1946385‑1946678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |