Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,983,083 | G→A | 7.2% | A345A (GCG→GCA) | PP_1775 → | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,983,083 | 0 | G | A | 7.2% | 206.1 / 3.1 | 69 | A345A (GCG→GCA) | PP_1775 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base A (2/3); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
AGCTGCACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAGTGAAGGGG > NC_002947/1982938‑1983231 | aGCTGCACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATc < 8:16623/149‑1 (MQ=255) aGCTGCACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATc < 4:123196/149‑1 (MQ=255) gCACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCAATcacga > 5:302465/1‑145 (MQ=255) cACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGa < 4:264818/148‑1 (MQ=255) cGAATATTTGATTGCAGATGCGAGGGCTGGTGTTGCAGCTGGGCGAGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGTACACCCATGCCCGCCAACAGCAGGTTGTCAATTACATCAAGAGCACGGGGCGACCGGCGATCGTTATTg < 4:291281/149‑1 (MQ=255) atatTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCg < 8:221464/149‑1 (MQ=255) tatTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCAATCACGATCGCCgg < 6:302465/149‑1 (MQ=255) atTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGGGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCAATCACGATCGCCggt < 8:327483/149‑2 (MQ=255) ttGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCAATCACGATCGCCggt < 8:145015/148‑2 (MQ=255) ggAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCaa < 2:321961/148‑1 (MQ=255) gAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGa < 4:138368/137‑1 (MQ=255) aGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCggg > 1:213409/1‑149 (MQ=255) gggCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGt < 5:337643/149‑1 (MQ=255) gcgTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCgg > 1:400884/1‑143 (MQ=255) gcgTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCgg < 2:400884/143‑1 (MQ=255) cgTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGgcg > 5:378496/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGgcg > 3:191325/1‑148 (MQ=255) gtTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCAt > 2:369613/1‑149 (MQ=255) cagcagGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTc < 2:213409/149‑1 (MQ=255) gcagGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCaa > 5:207871/1‑149 (MQ=255) gcagGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCaa < 2:153808/149‑1 (MQ=255) agGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAAt > 4:289252/1‑148 (MQ=255) gATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCAt < 3:254567/134‑1 (MQ=255) gATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCAt > 4:254567/1‑134 (MQ=255) tCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAgg < 6:89674/149‑1 (MQ=255) cACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGc > 2:320662/1‑148 (MQ=255) aCTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAAt > 6:309169/1‑106 (MQ=255) aCTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAAt < 5:309169/106‑1 (MQ=255) aCTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCa > 3:262559/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCa > 2:197071/1‑149 (MQ=255) ggCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCt > 5:195079/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTggg > 8:342123/1‑149 (MQ=255) ccAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATc > 3:270050/1‑149 (MQ=255) ccAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATc > 5:353109/1‑149 (MQ=255) aTTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCcgc < 1:369613/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCAt > 8:76119/1‑148 (MQ=255) cTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATg > 8:169468/1‑149 (MQ=255) tgtgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAAtt > 1:175106/1‑113 (MQ=255) tgtgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAAtt < 2:175106/113‑1 (MQ=255) tgtgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATg < 1:197071/146‑1 (MQ=255) tgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGt < 7:342123/148‑1 (MQ=255) tgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGt < 1:165654/148‑1 (MQ=255) tgGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGt > 2:165654/1‑148 (MQ=255) acCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTgg > 4:222332/1‑124 (MQ=255) acCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTgg < 3:222332/124‑1 (MQ=255) ccATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGTCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCg > 4:397325/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCg > 7:85550/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCg > 5:139359/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCg > 4:277098/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTg < 4:191325/149‑1 (MQ=255) ccGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGTTCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGt < 6:353109/149‑1 (MQ=255) gCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTc > 1:111473/1‑92 (MQ=255) gCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTc < 2:111473/92‑1 (MQ=255) cagcagGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGc < 1:320662/149‑1 (MQ=255) cagGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTaa < 6:139359/149‑1 (MQ=255) cagGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTaa < 6:207871/149‑1 (MQ=255) ggtggtCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAgg < 4:270050/149‑1 (MQ=255) gtggtCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAggg < 3:277098/149‑1 (MQ=255) tggtCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAgggg > 7:274106/1‑149 (MQ=255) ggtCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGa > 6:281184/1‑149 (MQ=255) cAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGc > 5:265989/1‑149 (MQ=255) aaTTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCAt > 5:286624/1‑53 (MQ=255) aaTTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCAt < 6:286624/53‑1 (MQ=255) aCCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCggg < 6:265989/148‑1 (MQ=255) aCCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATc > 7:158939/1‑147 (MQ=255) gCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGa < 6:195079/149‑1 (MQ=255) ttgccGGCAATCACGATCGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGAGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAg > 4:103416/4‑149 (MQ=255) gACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGTCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAGt < 3:397325/149‑1 (MQ=255) ggCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAGTGAAg > 2:67324/1‑149 (MQ=255) gATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAGTGAAgggg > 2:42133/1‑149 (MQ=255) | AGCTGCACGAATATTGGAATGCAGAAGCCAGGGCGCGTGTTGCAGCAGGGCGCGATCCACTCGGCTTCAGCCAATTGATCTGTGTGGACACCCATGCCCGCCACCAGCAGGTGGTCAATTACCTCAAGAGCACCGGGCGACCGGCGATCGTGATTGCCGGCAATGGCATGTGTTCGGGTGGGCGCATCGTCAATTACCTCAAGGCCATGCTGGGGGATCCGCGGCATGAGGTGATGTTCGTGGGGTACCAGGCTAAGGGGACGCCGGGGGCGGTAATCCAGGCGAGTGAAGGGG > NC_002947/1982938‑1983231 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |