Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,029,411 | G→T | 100% | G384V (GGG→GTG) | wbpM → | polysaccharide biosynthesis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,029,411 | 0 | G | T | 100.0% | 215.8 / NA | 65 | G384V (GGG→GTG) | wbpM | polysaccharide biosynthesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (32/33); total (32/33) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCAC > NC_002947/2029265‑2029552 | cGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGgtgt < 1:128161/149‑1 (MQ=255) cGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGgtgt > 1:150139/1‑149 (MQ=255) aGCTTTGCCGACAGATCATAGGGCGTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCAACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCg < 8:388424/149‑1 (MQ=255) ccAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTAGCAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAAt > 1:313659/1‑149 (MQ=255) ccAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAAt > 1:400735/1‑148 (MQ=255) ccAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAAt > 4:152904/1‑148 (MQ=255) cAGATCATAGGGCTCGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAAt > 7:68585/1‑147 (MQ=255) tAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCAt > 6:275191/1‑149 (MQ=255) cAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑t > 8:280506/1‑148 (MQ=255) aaCGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTa < 2:150139/149‑1 (MQ=255) cGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATg < 8:195376/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCAc < 8:68585/149‑1 (MQ=255) gctgTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑t > 7:107817/1‑135 (MQ=255) gctgTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑t < 8:107817/135‑1 (MQ=255) gTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCggg > 6:367382/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCgg < 6:56489/147‑1 (MQ=255) cGACCAGAGCGAGTA‑CTCCCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGTAGCAACGCGTTGCGCTCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGGGGTTa < 5:303291/148‑1 (MQ=255) cGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATg < 1:226511/133‑1 (MQ=255) cGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATg > 2:226511/1‑133 (MQ=255) gACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGc < 2:400735/149‑1 (MQ=255) gACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCAATTGGCGGGTAGc > 2:319461/1‑149 (MQ=255) aCCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGc > 7:259873/1‑148 (MQ=255) acaGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCAcc < 5:418069/149‑1 (MQ=255) caGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCg > 1:149312/1‑149 (MQ=255) caGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCg > 1:155422/1‑149 (MQ=255) aGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGt < 7:280506/149‑1 (MQ=255) cAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCAcg > 1:339322/1‑149 (MQ=255) ctctACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACgcggc > 1:28435/1‑149 (MQ=255) cGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCt < 3:31023/148‑1 (MQ=255) gCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTa < 3:152904/149‑1 (MQ=255) cTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTAc < 2:339322/149‑1 (MQ=255) tCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACa < 1:297703/148‑1 (MQ=255) ccTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACaaa > 6:117420/1‑148 (MQ=255) tCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACAt > 1:296103/1‑149 (MQ=255) gAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGc < 1:319461/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCAt < 8:259873/149‑1 (MQ=255) gAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGcggcgg > 4:396331/1‑127 (MQ=255) gAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGt > 2:81029/1‑149 (MQ=255) gAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGt > 7:101472/1‑149 (MQ=255) cAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGtt > 4:175836/1‑147 (MQ=255) cAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGtt > 1:203316/1‑147 (MQ=255) cAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGa < 3:175836/149‑1 (MQ=255) aCGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAg > 6:35321/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGGGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGcac > 5:118365/1‑147 (MQ=255) cgcgcgAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGcc > 4:377194/1‑130 (MQ=255) cgcgcgAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGcc < 3:377194/130‑1 (MQ=255) gcgcgAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATgg < 2:313659/149‑1 (MQ=255) aGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAg < 5:35321/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAgg < 2:28435/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAgg < 5:117420/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGt < 2:149312/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGTCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGt < 2:155422/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATAc < 5:275191/148‑1 (MQ=255) gACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCTATGGTTGAGCACAACATGGc < 5:48331/130‑1 (MQ=255) gACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCTATGGTTGAGCACAACATGGc > 6:48331/1‑130 (MQ=255) ctgcCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACAt < 3:39507/99‑1 (MQ=255) ctgcCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACAt > 4:39507/1‑99 (MQ=255) ctgcCCATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGtt < 1:81029/149‑1 (MQ=255) cccATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCTGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCacaaca < 6:2387/118‑1 (MQ=255) cccATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCacaaca > 5:2387/1‑118 (MQ=255) cccATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTc < 7:216574/147‑1 (MQ=255) cccATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTc > 8:216574/1‑147 (MQ=255) cccATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTc < 2:203316/147‑1 (MQ=255) cATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCtt > 5:287658/1‑86 (MQ=255) cATTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCtt < 6:287658/86‑1 (MQ=255) aTTCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCAc > 8:312754/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGCCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCAc > 6:289580/1‑148 (MQ=255) | CGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTA‑CAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGCAATCAGCAGCATCTTGCCCACG‑TTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCAC > NC_002947/2029265‑2029552 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |