Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,377,012 | G→T | 5.4% | G57C (GGC→TGC) | PP_2084 → | ribonuclease activity regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,377,012 | 0 | G | T | 5.4% | 229.2 / 3.5 | 74 | G57C (GGC→TGC) | PP_2084 | ribonuclease activity regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base T (2/2); total (37/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.24e-01 |
TGTGACGCCTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGCTGATC > NC_002947/2376871‑2377155 | tgtgACGCCTACCCTGACCTTTTACAAGTGCTTGAGCCTATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAg < 1:277989/147‑1 (MQ=255) tgtgACGCCTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAggg > 6:125238/1‑149 (MQ=255) aCGCCTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCaaa < 4:323547/149‑1 (MQ=255) cTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGc > 6:99174/1‑149 (MQ=255) cTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGc > 6:167731/1‑149 (MQ=255) aCCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTAGACGGCAAGGGCAAAGTGCtg > 7:146762/1‑149 (MQ=255) cccGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCtgg < 3:278754/149‑1 (MQ=255) cccGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCtgg < 3:119413/149‑1 (MQ=255) cccGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCtg < 5:125238/148‑1 (MQ=255) gACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACTGCAAGGGCAAAGTGCTggtggt > 2:11126/1‑149 (MQ=255) gACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACTGCAAGGGCAAAGTGCTggtggt > 2:17655/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTc < 5:167731/149‑1 (MQ=255) ccTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGTGCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCtggtgggc > 6:404655/1‑146 (MQ=255) cTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTggtggt > 5:229660/1‑146 (MQ=255) cTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTggtggt < 6:229660/146‑1 (MQ=255) gTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGAt < 5:99174/147‑1 (MQ=255) gTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGAt < 1:40785/147‑1 (MQ=255) gTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATgg > 8:74996/1‑149 (MQ=255) cAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCgg > 8:71647/1‑149 (MQ=255) gAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGAGTCGTTCGGTGGCCAGAGCGTTAGCCTCAAGTGGTTCGAGGACAATTCGGTGGTGAAGGAGCAGGTCGACCTGGACGGGCAGGTGAATGGGGTGGTGGTCGATGGGGGTGGGTCGCt > 4:262060/1‑149 (MQ=255) ccGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTgcg > 1:378786/1‑149 (MQ=255) ccGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGAGGTGGGTCGCTgcg > 4:401558/1‑149 (MQ=255) ttCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTAGCTGGTCAAGGAGCAGTTCGAACTCGACGGCACGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGACGCTGCGCCGTgc > 2:373281/1‑149 (MQ=255) aGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTgcgc < 6:83760/148‑1 (MQ=255) aGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCgct > 3:315850/1‑149 (MQ=255) cAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGt > 3:157523/1‑142 (MQ=255) cAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGt < 4:157523/142‑1 (MQ=255) tggtggCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGc < 4:315850/148‑1 (MQ=255) gtggACGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTTGTCAAGGAGCAGGTCTAACTCGACGGCAAGGTCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCTGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGAc < 2:86391/149‑1 (MQ=255) gcgATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGGAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTc > 3:350930/1‑149 (MQ=255) gcgATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGCTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTc > 6:241058/1‑149 (MQ=255) gTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGcc > 4:212019/1‑149 (MQ=255) gTGGCCAGATCGTTACAATCAAGTGTTTCGAGGCCAATTCGCTGGTCAAGGCGCAGGTCGAACGCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTCGGGGTCCATGGCGGTGGGTCGCTGCGGCGTGCGCTGCTCGGCCCCATGCTCGCCGAAAACGcc > 2:254834/1‑149 (MQ=255) cAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCgctgc < 1:59392/118‑1 (MQ=255) cAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCgctgc > 2:59392/1‑118 (MQ=255) cAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCTCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCaa > 5:165007/1‑148 (MQ=255) tCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAAc > 6:234744/1‑149 (MQ=255) gTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGTCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACg < 1:373281/148‑1 (MQ=255) gTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACg < 2:378786/148‑1 (MQ=255) ttACCATCATCTGTTTCGAGTACAATTCGCTGGTCAAGGTGCAGGTCGTACTCGACGGCAAGGTCTAATTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGTCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACgtt < 8:255962/149‑3 (MQ=255) ttACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGt < 7:71647/149‑1 (MQ=255) aCCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGtt < 3:237957/148‑1 (MQ=255) ccATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACTGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCCCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTg < 1:11126/148‑1 (MQ=255) ccATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACTGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCCCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTg < 1:17655/148‑1 (MQ=255) tCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTggg > 6:88093/1‑147 (MQ=255) tCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGaa < 3:401558/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGtt > 4:251796/1‑142 (MQ=255) aaGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGtt < 3:251796/142‑1 (MQ=255) gtgtTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGACGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGATGGGAAGGCt > 4:35095/1‑149 (MQ=255) cGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTg < 7:74996/148‑1 (MQ=255) gAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGa > 2:281039/1‑148 (MQ=255) gAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGAt < 8:146762/149‑1 (MQ=255) aGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATc > 2:108968/1‑149 (MQ=255) ggACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTg > 1:251173/1‑142 (MQ=255) ggACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTg < 2:251173/142‑1 (MQ=255) ggACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCt < 3:212019/149‑1 (MQ=255) cAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACg < 5:241058/149‑1 (MQ=255) aaTTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGa > 4:107754/1‑131 (MQ=255) aaTTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGa < 3:107754/131‑1 (MQ=255) aaTTCCCTGGTCAAGGAGCAGGGCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGGCGATGGCGGTGGGTCGATGCGACGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAGAGCCGGAAAACACGGTTGGGAAGTCTTGGTGATCTACgg > 4:235806/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCt > 6:257935/1‑149 (MQ=255) ggAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACgg < 3:10388/111‑1 (MQ=255) ggAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACgg > 4:10388/1‑111 (MQ=255) gCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTc > 7:147244/1‑148 (MQ=255) aGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGAc < 4:350930/149‑1 (MQ=255) gTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGt < 5:234744/149‑1 (MQ=255) tCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGAc > 7:51779/1‑146 (MQ=255) tCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGAc < 8:51779/146‑1 (MQ=255) gAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCg < 8:101819/79‑1 (MQ=255) gAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCg > 7:101819/1‑79 (MQ=255) gAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGGTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGc < 1:281039/148‑1 (MQ=255) aCTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGc < 5:257935/146‑1 (MQ=255) aCTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGCTGa < 8:147244/149‑1 (MQ=255) cGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGCTGATc > 1:124541/1‑148 (MQ=255) ggCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTa > 7:273883/1‑113 (MQ=255) ggCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTa < 8:273883/113‑1 (MQ=255) | TGTGACGCCTACCCGGACCTGGTACAAGTGCTGGAGCCGATGTTCAGCAATTTTGGTGGCCGCGATTCGTTCGGTGGCCAGATCGTTACCATCAAGTGTTTCGAGGACAATTCGCTGGTCAAGGAGCAGGTCGAACTCGACGGCAAGGGCAAAGTGCTGGTGGTCGATGGCGGTGGGTCGCTGCGCCGTGCGCTGCTCGGCGACATGCTCGCCGAAAAAGCCGCAAAAAACGGTTGGGAAGGCTTGGTGATCTACGGCTGCGTGCGTGATGTCGACGTGCTGATC > NC_002947/2376871‑2377155 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |