| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,379,362 | G→C | 5.5% | G214G (GGG→GGC) | cmpX → | protein CmpX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,379,362 | 0 | G | C | 5.5% | 238.3 / 3.3 | 73 | G214G (GGG→GGC) | cmpX | protein CmpX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base C (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
GTGATCATCATCAGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGC > NC_002947/2379219‑2379505 | gTGATCATCATCAGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCggg > 1:271757/1‑144 (MQ=255)gTGATCATCATCAGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGAt < 1:236437/149‑1 (MQ=255) atcaGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGc < 6:287171/136‑1 (MQ=255) atcaGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGc > 5:287171/1‑136 (MQ=255) tcaccctctcGGTGGGCATCCCCCAGCTTGAAGTTCAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGCCAGGATCTGCCCGGc < 8:316266/143‑1 (MQ=255) ggCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTgcgc > 1:118037/1‑148 (MQ=255) gCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGGTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGa < 4:61824/149‑1 (MQ=255) cATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGc > 5:160435/1‑149 (MQ=255) cATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGc > 2:314074/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTACTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCt > 1:30030/1‑149 (MQ=255) agccagcTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGt < 4:72552/148‑1 (MQ=255) aGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGc > 6:423968/1‑148 (MQ=255) gTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCGGATCCTGGCCGGCATCt < 6:130928/121‑1 (MQ=255) gTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCGGATCCTGGCCGGCATCt > 5:130928/1‑121 (MQ=255) gTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGc > 4:359760/1‑147 (MQ=255) gTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCca > 1:145843/1‑149 (MQ=255) tGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCt > 4:147952/1‑120 (MQ=255) tGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCt < 3:147952/120‑1 (MQ=255) tGAAAACCGAACTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACAGTTGGACTGGCCGTTGCCTTTGCCATGGGACTTGTCAGTCCCGAAATTGCCGGGCAGATACTGGCCGGCATCTACGATCGCGAGCTGTACCAAGTCg > 4:266847/1‑144 (MQ=255) tGAAAACAGTCCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCTTTGGTCTGGCAGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAATTTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCg < 3:266847/144‑1 (MQ=255) aCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGt > 7:336565/1‑149 (MQ=255) aCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGt < 2:30030/149‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGc < 6:160435/149‑1 (MQ=255) ctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTTCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTg > 7:366023/1‑148 (MQ=255) ctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTg > 6:125752/1‑148 (MQ=255) ctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTg < 5:423968/148‑1 (MQ=255) aaCCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGgaga < 3:359760/149‑1 (MQ=255) aCCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGagag < 7:89990/149‑1 (MQ=255) ccACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCt > 6:391946/1‑114 (MQ=255) aTCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAgg < 2:271757/149‑1 (MQ=255) gTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGc < 2:145843/148‑1 (MQ=255) ttATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCa > 2:154731/1‑148 (MQ=255) tATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGt < 8:145614/138‑1 (MQ=255) tATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGt > 7:145614/1‑138 (MQ=255) ggCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgag > 2:255861/1‑149 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGAtt < 1:371047/124‑1 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGAtt > 2:371047/1‑124 (MQ=255) cTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAgg < 7:244101/137‑1 (MQ=255) cTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAgg > 8:244101/1‑137 (MQ=255) aTTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgag > 2:154393/1‑144 (MQ=255) cGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCt > 4:362182/1‑87 (MQ=255) cGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCt < 3:362182/87‑1 (MQ=255) cGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagg < 2:193237/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagg > 1:193237/1‑140 (MQ=255) ttGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACg > 6:213251/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCTAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTg < 1:314074/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTg > 1:15381/1‑148 (MQ=255) tGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTg > 3:85277/1‑146 (MQ=255) gCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAg > 6:382184/1‑75 (MQ=255) gCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAg < 5:382184/75‑1 (MQ=255) cGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAgacga < 1:255861/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCATGGGGCTTGGCTGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCGTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCATGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGTCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACgctg < 8:336565/149‑1 (MQ=255) ttGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACgctgct > 6:56470/1‑149 (MQ=255) gCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGa < 5:56470/148‑1 (MQ=255) gCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGAc < 1:154731/149‑1 (MQ=255) gCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGAc < 2:15381/149‑1 (MQ=255) cATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACgg < 8:81997/128‑1 (MQ=255) cATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACgg > 7:81997/1‑128 (MQ=255) tGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCgat < 1:154393/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGatgatg > 5:223985/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGatgatg > 8:251589/1‑149 (MQ=255) cTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGGTTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATgg > 8:44013/1‑149 (MQ=255) cTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATgg > 5:109618/1‑149 (MQ=255) cTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATgg < 5:213251/149‑1 (MQ=255) ggCAGTCGCGATATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGTCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGc < 2:118037/147‑1 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGt < 4:32988/112‑1 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGt > 3:32988/1‑112 (MQ=255) aaTTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCAc < 7:251589/149‑1 (MQ=255) gatGCCGGCCAGGATCTGCCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGAGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGATCGATGATGGCGAACTGGTGTCACt > 4:52341/3‑149 (MQ=255) atGCCGGCCAGGATCTGCCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTg < 1:39253/106‑1 (MQ=255) atGCCGGCCAGGATCTGCCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTg > 2:39253/2‑107 (MQ=255) gCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAggg > 5:172419/1‑81 (MQ=255) gCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAggg < 6:172419/81‑1 (MQ=255) gCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGc > 3:287141/1‑149 (MQ=255) ggCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGTCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCgatga > 7:192498/1‑124 (MQ=255) ggCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCgatga < 8:192498/124‑1 (MQ=255) | GTGATCATCATCAGCATCTCGGTGGCCATCAGCCAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGC > NC_002947/2379219‑2379505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |