Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 350,615 | G→A | 5.4% | G10S (GGC→AGC) | hisH → | imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 350,615 | 0 | G | A | 5.4% | 225.8 / 2.0 | 74 | G10S (GGC→AGC) | hisH | imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base A (2/2); total (37/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCACAACACCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATGGCCGAGA > NC_002947/350467‑350762 | ccACAACACCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGCGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATg > 4:352626/1‑149 (MQ=255) ccACAACACCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATg < 7:35196/149‑1 (MQ=255) cacaACACCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATgg > 5:423599/1‑149 (MQ=255) aacaCCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCAt < 3:158453/149‑1 (MQ=255) aacaCCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCAt > 3:158904/1‑149 (MQ=255) cacccaccACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATgg < 2:314393/149‑1 (MQ=255) acccaccACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATgtg > 2:235938/1‑147 (MQ=255) ccaccaccaGATCGAAACCGTATTACAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATggg > 7:257248/1‑148 (MQ=255) caccaccaGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTaa > 3:194796/1‑149 (MQ=255) accaccaGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGATTTCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTaa < 1:121576/149‑1 (MQ=255) accaccaGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAAc > 5:335228/1‑149 (MQ=255) caccaGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCt < 3:75292/149‑1 (MQ=255) caccaGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCt > 4:324798/1‑149 (MQ=255) aaCCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTgg > 5:90891/1‑149 (MQ=255) cGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCAGTAATCG‑ACTATAGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGcc > 4:118275/1‑148 (MQ=255) cGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCAGTAATCG‑ACTATAGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGcc > 4:123989/1‑148 (MQ=255) t‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGgc < 3:324798/148‑1 (MQ=255) cAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGgcgc > 1:165731/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGgcgc < 4:96483/148‑1 (MQ=255) aaGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCt > 2:246487/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCt > 3:401560/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCt > 7:356241/1‑149 (MQ=255) aGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTGGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCGCACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAg < 1:60489/144‑1 (MQ=255) aGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAg > 2:60489/1‑143 (MQ=255) ggCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTg < 1:246487/149‑1 (MQ=255) gCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCtt > 5:20095/1‑147 (MQ=255) gCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGa < 6:423599/149‑1 (MQ=255) tttCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTg < 6:159661/146‑1 (MQ=255) tttCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTg > 5:159661/1‑146 (MQ=255) tCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGc < 2:165731/147‑1 (MQ=255) tCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGc < 6:229668/147‑1 (MQ=255) ccGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAg > 4:222842/1‑149 (MQ=255) cgcgCTCTGCGCATGGCCATCAACCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTACACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGTCATGGGTAACCTCCACTCGGTGGCAAATGCGCAAGAGCACGAAgg > 6:292107/1‑149 (MQ=255) 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ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGc > 8:152749/1‑119 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGc < 7:152749/119‑1 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTa < 3:260871/124‑1 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTa > 4:260871/1‑124 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGt > 3:403783/1‑133 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGt < 4:403783/133‑1 (MQ=255) ccTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTAc > 5:369252/1‑147 (MQ=255) gacgaGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCa < 7:298440/145‑1 (MQ=255) gacgaGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCa > 8:298440/1‑145 (MQ=255) gaGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGc < 6:90891/149‑1 (MQ=255) gCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCt > 1:206329/1‑149 (MQ=255) cGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTc < 6:419553/149‑1 (MQ=255) cGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTc < 2:206329/149‑1 (MQ=255) gTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCa < 6:20095/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGa > 3:174676/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGa < 1:354731/148‑1 (MQ=255) cAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGa < 8:356241/149‑1 (MQ=255) cAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGa < 1:378469/149‑1 (MQ=255) aGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAg > 2:385143/1‑149 (MQ=255) cTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGAc > 1:179384/1‑149 (MQ=255) cTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGAc > 1:185500/1‑149 (MQ=255) accaAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCgtgt > 4:154995/1‑149 (MQ=255) ccaAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGtgtg < 8:257248/149‑1 (MQ=255) ccaAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGtgtg < 3:352626/149‑1 (MQ=255) ccaAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGtgtg < 7:131295/149‑1 (MQ=255) cGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTgg < 7:242569/84‑1 (MQ=255) cGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTgg > 8:242569/1‑84 (MQ=255) cGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACt > 3:119917/1‑149 (MQ=255) cGTAATCC‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACt > 4:6620/1‑149 (MQ=255) tAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGc < 4:158904/149‑1 (MQ=255) aaTCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTc > 2:327394/1‑140 (MQ=255) aaTCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTc < 1:327394/140‑1 (MQ=255) aaTCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCa > 1:39898/1‑149 (MQ=255) g‑ACTATAGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATgg < 3:118275/148‑1 (MQ=255) g‑ACTATAGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATgg < 3:123989/148‑1 (MQ=255) aCTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATGGcc < 6:369252/149‑1 (MQ=255) tGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATGGCCgaga < 3:154995/149‑1 (MQ=255) tGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATGGCCgaga < 3:6620/149‑1 (MQ=255) | CCACAACACCCACCACCAGATCGAAACCGTATT‑CAAGGCTTTCGGCCGCGCTCTGCGCATGGCCATCACCCTCGACGAGCGTATGGCCGGGCAGA‑TGCCTTCCACCAAAGGGTGCCTGTAAATGCAAACGGTAGCCGTAATCG‑ACTATGGCATGGGTAACCTGCACTCGGTGGCCAAGGCGCTTGAGCACGTAGGTGCCGGTAAAGTGCTGGTTACCAGCGATGCCTCAGTGATCCGCGAGGCCGACCGTGTGGTGTTCCCGGGCGTGGGCGCGATTCGCGACTGCATGGCCGAGA > NC_002947/350467‑350762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |