| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,416,441 | A→G | 5.4% | S373G (AGT→GGT) | pdxB → | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,416,441 | 0 | A | G | 5.4% | 219.8 / 2.0 | 75 | S373G (AGT→GGT) | pdxB | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/35); new base G (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
CCGATTTCCGCCGTAGCCTCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTT > NC_002947/2416295‑2416589 | ccGATTTCCGCCGTAGCCTCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAGCATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCa < 1:117348/148‑1 (MQ=255) gccgTAGCCTCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCtgggt < 1:284275/149‑1 (MQ=255) cgTAGCATCCGCGATGCTACGCAGCAACAGCGAGAGGAGTTCGACCAGTGGAGCAAGCAATAACCGCCACGGCGCGAG‑ATCGAGTGGCTGGCCGTGCGCTTGCACTGGTAGGCGCCGCAGTTGGCGCATTT‑TGTCAGTGCCCtgggtgg < 3:77069/149‑1 (MQ=255) gTAGCCTCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCtgggtggg < 5:309636/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCGATGATCCGGAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGATAGCAATACCCGCGAAGGCGCGAG‑ATGGAGGGGCTGGCGGTGCGCTTGCACGGGGAGGCTCCGGAGTTTGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTgggtggggtg < 8:232794/148‑1 (MQ=255) tCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTg > 7:74343/1‑149 (MQ=255) tCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTg > 7:239033/1‑149 (MQ=255) gCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTAGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTAGCACGGGGAGGCGCCGCAGATGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGt > 3:78694/1‑148 (MQ=255) 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gTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGc < 1:277310/146‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGcc < 4:233308/128‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGcc > 3:233308/1‑128 (MQ=255) cAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGgtgt > 4:339498/1‑149 (MQ=255) aGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTgggtggggt > 5:320782/1‑106 (MQ=255) aGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTgggtggggt < 6:320782/106‑1 (MQ=255) cgcAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGt < 7:15456/107‑1 (MQ=255) cgcAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGt > 8:15456/1‑107 (MQ=255) aagcaaTACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTg > 7:12487/1‑149 (MQ=255) caaTACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTg < 3:280815/149‑1 (MQ=255) aaTACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTgg < 4:95618/149‑1 (MQ=255) aaTACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTgg < 3:324636/149‑1 (MQ=255) aTACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGTTCTACGCACGCCGTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGGGGTTACCTGTTggg > 3:255304/1‑149 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCGCGGGGTGGGGTGTTGGTCTAGGCACGCGTGGTCTTGACCTTGCAGGTAGGGGTGGTGGCGTGTTGGggcgg > 8:136260/1‑149 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGtt > 1:196071/1‑92 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGtt < 2:196071/92‑1 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGtt < 7:66327/135‑1 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGtt > 8:66327/1‑135 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTggg > 1:365233/1‑145 (MQ=255) ccGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTggg < 2:365233/145‑1 (MQ=255) cAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCaa < 8:239033/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGtt < 4:273420/86‑1 (MQ=255) aGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGtt > 3:273420/1‑86 (MQ=255) aGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGc > 5:31565/1‑149 (MQ=255) gAGGGGCTGGCCGTGCGATTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGACCTGGGTGGGTTGTTGGTCTAATCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTTGGGCGGCAAAGCCCACTGTCTggg > 2:108323/1‑149 (MQ=255) aGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCt < 6:147231/120‑1 (MQ=255) aGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCt > 5:147231/1‑120 (MQ=255) gCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGggcggc > 6:407976/1‑127 (MQ=255) gCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGggcggc < 5:407976/127‑1 (MQ=255) cTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAAt > 8:389159/1‑148 (MQ=255) tGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAAccc > 8:330442/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGc < 3:136925/136‑1 (MQ=255) gcgcTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGc > 4:136925/1‑136 (MQ=255) ttGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGGTCGGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATaaaaa > 1:268027/1‑142 (MQ=255) ttGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGGTCGGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATaaaaa > 1:262054/1‑142 (MQ=255) ttGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCGGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATaaaaa < 2:262054/141‑1 (MQ=255) ttGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCGGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATaaaaa < 2:268027/141‑1 (MQ=255) aCGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAgc > 1:321445/1‑149 (MQ=255) gggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCActg > 8:264731/1‑118 (MQ=255) gggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCActg < 7:264731/118‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGGT‑GGTCAGTGCCCTGGGGGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCgg < 8:248897/149‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGCAGTGGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGGGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCgg < 8:255154/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGgc < 4:133004/137‑1 (MQ=255) aGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGgc > 3:133004/1‑137 (MQ=255) gcgcCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCGTGGGTGGGGTGTTGGTGTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCTGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGCCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCGGGtt < 1:33394/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGtt > 3:404516/1‑149 (MQ=255) gccgcAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGt > 2:346342/1‑84 (MQ=255) gccgcAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGt < 1:346342/84‑1 (MQ=255) gccgcAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTAc < 4:213023/87‑1 (MQ=255) gccgcAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTAc > 3:213023/1‑87 (MQ=255) gttggcgcagtt‑ggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAgaga < 2:321445/148‑1 (MQ=255) gcgcagtt‑ggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCg > 3:342025/1‑149 (MQ=255) cagtt‑ggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCg < 4:404516/149‑1 (MQ=255) cagtt‑ggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTT‑GGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa > 8:207828/1‑149 (MQ=255) agtt‑ggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa < 8:12487/149‑1 (MQ=255) gTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAAc > 6:148303/1‑149 (MQ=255) gTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTT‑GGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAAc < 7:207828/148‑1 (MQ=255) aGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCtt > 3:233452/1‑149 (MQ=255) | CCGATTTCCGCCGTAGCCTCAGCGATGATCCGCAGCAACAGCGAGCGGCGTTCGACCAGTTGCGCAAGCAATACCCGCCAAGGCGCGAG‑ATCGAGGGGCTGGCCGTGCGCTTGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTT‑GGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTT > NC_002947/2416295‑2416589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |