Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,460,377 | G→A | 6.0% | R143C (CGC→TGC) | PP_2153 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,460,377 | 0 | G | A | 6.0% | 197.5 / 2.2 | 66 | R143C (CGC→TGC) | PP_2153 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/27); new base A (2/2); total (37/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.00e-01 |
TTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCAC > NC_002947/2460234‑2460524 | ttCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTg > 4:373299/1‑147 (MQ=255) cAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAg > 1:275118/1‑148 (MQ=255) ggTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATg > 2:133211/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATc < 2:275118/149‑1 (MQ=255) tcGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCggg > 4:360138/1‑149 (MQ=255) tcGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCggg > 8:224189/1‑149 (MQ=255) tcGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCggg > 7:84020/1‑149 (MQ=255) tcGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCggg > 6:71064/1‑149 (MQ=255) gggTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTAGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGc > 2:303992/1‑148 (MQ=255) gTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCgg > 5:330439/1‑144 (MQ=255) gTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCgg < 6:330439/144‑1 (MQ=255) cTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCcagcag < 7:224189/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGtt < 1:133211/148‑1 (MQ=255) cccTTGGCGGCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCATGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCGAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGGTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTc < 5:147985/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGGTCAGGAGGCGGGGGCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGtt < 4:8997/147‑1 (MQ=255) ggCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGGCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTCTCGGGCCAGCAGTTGTCGTTg < 3:271489/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATGGCCGTAGATCAGGTTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTgg < 8:132383/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTgg < 3:360138/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCACGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTgg < 1:230408/148‑1 (MQ=255) gATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTTCTGGCGCTGCAGGATGTATCTGGAcagca > 8:288119/1‑130 (MQ=255) gATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCcagca < 7:288119/130‑1 (MQ=255) cGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTc < 8:84020/149‑1 (MQ=255) gTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGAt > 5:92372/1‑109 (MQ=255) gTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGAt < 6:92372/109‑1 (MQ=255) gATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGAt > 4:202458/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGa > 8:63539/1‑148 (MQ=255) cgttcgttCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTAc < 3:327543/148‑1 (MQ=255) cgttcgttCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGATCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTAc > 4:327543/1‑148 (MQ=255) gttcgttcCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTAcc > 1:162678/1‑148 (MQ=255) cAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGAGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAgcc > 5:238192/1‑149 (MQ=255) tCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGccc > 1:52341/1‑149 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGTGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCg > 4:196893/1‑149 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGAc < 3:248441/132‑1 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGAc > 4:248441/1‑132 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCg > 5:102285/1‑149 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCg > 3:140149/1‑149 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGGTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGCTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCg > 2:360586/1‑149 (MQ=255) aaaaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACCTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCgg < 1:30215/149‑1 (MQ=255) aaaaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCggg < 7:63539/149‑1 (MQ=255) aaaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGc < 2:409292/149‑1 (MQ=255) aaaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGc > 5:306040/1‑149 (MQ=255) aaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTc < 2:123990/143‑1 (MQ=255) aaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTc > 1:123990/1‑143 (MQ=255) aTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGAt < 5:69302/111‑1 (MQ=255) aTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGAt > 6:69302/1‑111 (MQ=255) cTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCAt > 2:241633/1‑100 (MQ=255) cTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCAt < 1:241633/100‑1 (MQ=255) tCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCg > 4:298041/1‑148 (MQ=255) aggaggCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCaa < 3:373299/149‑1 (MQ=255) gaggCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATg > 8:352244/1‑149 (MQ=255) gaggCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATg < 4:140149/149‑1 (MQ=255) aggCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATgg < 2:164693/149‑1 (MQ=255) tCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCtt < 8:54056/145‑1 (MQ=255) tCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCtt > 7:54056/1‑145 (MQ=255) aGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCcgcg > 5:386983/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCTGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgca < 6:238192/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgcagcagca < 3:202458/149‑1 (MQ=255) gttgttgttGCTGGCACTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGa < 1:330831/66‑1 (MQ=255) gttgttgttGCTGGCACTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGa > 4:349698/1‑66 (MQ=255) gttgttgttGCTGGCACTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGa > 2:330831/1‑66 (MQ=255) gttgttgttGCTGGCACTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGa < 3:349698/66‑1 (MQ=255) gttgttgCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTGCTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCGCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCACCAGGCCGTGGgcgcgc > 5:96877/1‑149 (MQ=255) ttgCTTGAGCTGCAGGAACTATCGGGCCAGCACTTGACTTAGGGCGTAAGTCATGTAGATGAA‑CTCCGTACAGACCACCAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGCGTCACATAGCCGCCAACCAACAAGCCTTGGGCCCGCGGc > 2:291483/1‑148 (MQ=255) cTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCa > 7:278882/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAg > 1:165688/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAg > 7:76799/1‑148 (MQ=255) cgcTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCAc < 6:386983/149‑1 (MQ=255) gcTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCAc > 6:39128/1‑148 (MQ=255) | TTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAA‑CTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCAC > NC_002947/2460234‑2460524 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |