Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,801,849 | C→T | 6.0% | A78V (GCC→GTC) | rbsA‑I → | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,801,849 | 0 | C | T | 6.0% | 205.7 / 2.1 | 66 | A78V (GCC→GTC) | rbsA‑I | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base T (2/2); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGAGGTCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCCACAAGCGT > NC_002947/2801711‑2801997 | gCGAGGTCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGccc > 5:192882/1‑149 (MQ=255) cGAGGTCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCg < 6:99923/149‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTTCCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCa < 4:122380/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAg > 2:332299/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGc < 8:17988/149‑1 (MQ=255) tCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGc < 7:350403/149‑1 (MQ=255) agcctgagcctgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCcg < 5:223015/149‑1 (MQ=255) cctgagcctgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCcgcg > 7:27418/1‑149 (MQ=255) cctgagcctgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCAAGGCCTACGCGCCCGGCAGCcgcg < 5:242478/149‑1 (MQ=255) ctgagcctgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCgcgg > 8:306246/1‑149 (MQ=255) gcctgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAg < 6:338792/149‑1 (MQ=255) tgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGTCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAgg < 3:225926/147‑1 (MQ=255) tgCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGTCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAgg > 4:225926/1‑147 (MQ=255) cGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTg < 7:306246/149‑1 (MQ=255) cGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCATCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAgg < 1:112677/116‑1 (MQ=255) cGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAgg > 2:112677/1‑116 (MQ=255) agaACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACTCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAg < 5:179303/149‑1 (MQ=255) gaACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGc < 2:169036/149‑1 (MQ=255) gaACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGc > 5:192695/1‑149 (MQ=255) gaACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGc < 8:27418/149‑1 (MQ=255) ggCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACctgct > 4:231804/1‑149 (MQ=255) gCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACctgct > 5:75850/1‑148 (MQ=255) gCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACctgct < 6:75850/148‑1 (MQ=255) aaGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGcc > 3:401231/1‑149 (MQ=255) aaGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGcc > 6:46330/1‑149 (MQ=255) agagTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCg > 7:86665/1‑149 (MQ=255) agagTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCg > 7:81071/1‑149 (MQ=255) tACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGc > 1:395283/1‑149 (MQ=255) cGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTg > 7:176669/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGa > 3:324830/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGa > 8:6758/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGa > 4:110576/1‑149 (MQ=255) ttGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGAc < 8:86665/149‑1 (MQ=255) tttCCAACCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGCCCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGAc < 8:81071/146‑1 (MQ=255) cAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGAGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTgg > 7:112070/1‑149 (MQ=255) aaGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGTCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGc > 7:12686/1‑149 (MQ=255) gCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTg > 7:143395/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGt > 5:394642/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTtc > 4:231949/1‑149 (MQ=255) cTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTtct < 6:192695/149‑1 (MQ=255) cTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTtct < 2:395283/149‑1 (MQ=255) cTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTtct < 8:143395/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGAc < 8:176669/149‑1 (MQ=255) tGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAAc < 1:332299/149‑1 (MQ=255) tGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAAc > 5:380625/1‑149 (MQ=255) cccACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCt < 8:112070/149‑1 (MQ=255) ccaccaCCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGaaaa < 8:313015/130‑1 (MQ=255) ccaccaCCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGaaaa > 7:313015/1‑130 (MQ=255) caccGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGcc > 5:121363/1‑147 (MQ=255) ccGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGc < 3:231804/149‑1 (MQ=255) cGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGTCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGcc < 8:12686/149‑1 (MQ=255) gTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCt > 5:19518/1‑124 (MQ=255) gTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCt < 6:19518/124‑1 (MQ=255) tGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGc < 3:231949/149‑1 (MQ=255) aCCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCt < 4:324830/148‑1 (MQ=255) cTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGTTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGa < 6:192882/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATc < 3:110576/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGAt > 2:98560/1‑147 (MQ=255) ccGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCa < 5:46330/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAg < 7:6758/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAg > 4:380143/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCcac > 6:256492/1‑147 (MQ=255) cAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCCACaa < 5:256492/149‑1 (MQ=255) aGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGTCGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGc < 8:18329/134‑1 (MQ=255) aGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGTCGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGc > 7:18329/1‑134 (MQ=255) gCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCCACAAGCg > 7:336442/1‑149 (MQ=255) ccTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCCACAAGCGt < 1:98560/149‑1 (MQ=255) | GCGAGGTCAGCCTGAGCCTGCGCGCGGGCGAAGTGCTGGCCCTGACCGGCGAGAACGGCGCAGGCAAGAGTACGTTGTCCAAGCTTATCAGCGGCCTGGAGGTGCCCACCACCGGTCACATGACCTACCGCGGCCAGGCCTACGCGCCCGGCAGCCGCGGCGAGGCCGAACGCCTTGGGGTGCGCATGGTCATGCAGGAGCTGAACCTGCTGCCGACGCTGACCGTGGCGGAAAACCTGTTTCTCGACAACCTGCCCAGCCGCTTCGGCTGGATCAGCCACAAGCGT > NC_002947/2801711‑2801997 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |