| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,822,912 | T→C | 5.5% | V162A (GTC→GCC) | curA → | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,822,912 | 0 | T | C | 5.5% | 214.3 / 2.7 | 77 | V162A (GTC→GCC) | curA | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/34); new base C (2/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.81e-01 | |||||||||||
GACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTCGCCGAGCAAC > NC_002947/2822766‑2823058 | gACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATTCCCGGCGTGACCCCTTTTATTGGCGTTCTGGGTTTTTGGCCGCCGCAAGCCGGTTAAAACCATGTTGTTGCGGCGGCCAACCGGCCGGtac > 1:313728/1‑147 (MQ=255) gTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGGTGACTATTGGCCGGCCTCAAGCGGGTGAAAACCTTGTGGTTGAGGCGGCCAACGGGCCGGTCGGCGCGACtttt > 1:338150/1‑146 (MQ=255) tGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTgg < 6:395690/149‑1 (MQ=255) aGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTgggg < 6:150632/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTgggg > 2:8353/1‑145 (MQ=255) gCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTgggg > 8:190110/1‑145 (MQ=255) ccGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTACTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAt < 3:59673/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCgg < 8:258452/149‑1 (MQ=255) cgcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGc < 2:87564/149‑1 (MQ=255) gcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGc > 6:105158/1‑148 (MQ=255) gcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGc > 4:362912/1‑148 (MQ=255) tATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAggg > 1:302905/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg < 4:136309/146‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTg > 3:81457/1‑149 (MQ=255) cTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGc > 5:169271/1‑148 (MQ=255) gCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑tgtg > 3:14909/1‑149 (MQ=255) gCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGACGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑tgtg > 5:23145/1‑149 (MQ=255) aTCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGt < 5:105158/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAt < 2:37399/120‑1 (MQ=255) cTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAt > 1:37399/1‑120 (MQ=255) tttGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGAGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAACGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGAGGTCgg > 5:101321/1‑149 (MQ=255) ggCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGgtgt > 2:277101/1‑149 (MQ=255) gCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg > 3:133211/1‑128 (MQ=255) gCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg < 4:133211/128‑1 (MQ=255) gCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTc < 2:338150/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCg > 8:247380/1‑149 (MQ=255) cGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg < 5:302137/122‑1 (MQ=255) cGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg > 6:302137/1‑122 (MQ=255) ttCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGgcgc > 3:113918/1‑149 (MQ=255) gCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGt < 8:337427/138‑1 (MQ=255) gCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGt > 7:337427/1‑138 (MQ=255) gCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGaaaa < 3:325988/149‑1 (MQ=255) tGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCgg < 7:190110/149‑1 (MQ=255) tGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCg < 4:81457/148‑1 (MQ=255) ggCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGACGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGc < 6:23145/148‑1 (MQ=255) cTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGgcgc > 7:178192/1‑132 (MQ=255) cTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGgcgc < 8:178192/132‑1 (MQ=255) ttGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACtgt < 6:198736/77‑1 (MQ=255) ttGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACtgt > 5:198736/1‑77 (MQ=255) cTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGt > 2:259345/1‑149 (MQ=255) cTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGCCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGt > 3:356708/1‑149 (MQ=255) cTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGCCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGt > 1:385734/1‑149 (MQ=255) tCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc < 4:113918/149‑1 (MQ=255) tCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc > 8:135395/1‑149 (MQ=255) gATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGTTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGACGGCATGCGGTc > 5:137333/1‑147 (MQ=255) gATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGa < 7:247380/149‑1 (MQ=255) gATATTGGCCGGCCACAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc > 7:130142/1‑147 (MQ=255) atatTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGCCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAg < 2:385734/149‑1 (MQ=255) atatTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGCCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAg < 4:356708/149‑1 (MQ=255) ccggcctCTGGCTGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCAGCGGGGCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTgg < 8:130142/149‑1 (MQ=255) ccggccgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTgg > 2:119651/1‑149 (MQ=255) cgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc < 5:153592/134‑1 (MQ=255) cgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc > 6:153592/1‑134 (MQ=255) cgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTagggcg > 1:351039/1‑145 (MQ=255) cgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGtttt > 4:220402/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGGGGAAACCCTTGGGGTGGCGTCTGCCACCGGGCCGGGCGGCGCGAGTGTGGGGCAGATCGGAAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGGCGAGGTGCTGGGTTTTGa < 6:137333/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGa < 3:297638/149‑1 (MQ=255) aGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGAt < 2:313728/149‑1 (MQ=255) aGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGAt < 4:14909/149‑1 (MQ=255) ggTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTg > 2:28659/1‑149 (MQ=255) tGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTc > 1:159831/1‑149 (MQ=255) tGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTc < 2:302905/149‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATTGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCgg < 1:84775/121‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCgg > 2:84775/1‑120 (MQ=255) aaaCCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCt < 7:135395/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGt > 1:146885/1‑123 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGt < 2:146885/123‑1 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGAt > 5:329005/1‑148 (MQ=255) tggtggCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGt > 1:277008/1‑149 (MQ=255) ggcggcggcCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc < 6:131535/109‑1 (MQ=255) ggcggcggcCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTc > 5:131535/1‑109 (MQ=255) cggcggcCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCg < 6:169271/149‑1 (MQ=255) ccACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTc < 3:362912/149‑1 (MQ=255) cACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACtt > 6:165591/1‑147 (MQ=255) cACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACtt < 5:165591/147‑1 (MQ=255) aCCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTCGc > 7:17849/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCGGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTCGCCGAGCAAc < 1:259345/149‑1 (MQ=255) ggTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑GTTTGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGGATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCGTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTCGCCGAGCAAc < 6:101321/149‑1 (MQ=255) | GACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTTTGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCA‑TGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCCGGACTTCGCCGAGCAAC > NC_002947/2822766‑2823058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |