| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,896,803 | G→A | 6.4% | R41Q (CGG→CAG) | PP_2551 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,896,803 | 0 | G | A | 6.4% | 231.0 / 4.4 | 78 | R41Q (CGG→CAG) | PP_2551 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/39); new base A (2/3); total (36/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.77e-01 | |||||||||||
CCTTGAATTCCACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCG > NC_002947/2896655‑2896946 | ccTTGAATTCCACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCg > 2:58451/1‑149 (MQ=255) cTTGAATTCCACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCgg < 1:176592/149‑1 (MQ=255) cACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGc < 1:58451/148‑1 (MQ=255) cACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCt > 3:246403/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTc > 3:274311/1‑149 (MQ=255) ggCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCTCCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAAGCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCAc < 7:243986/148‑1 (MQ=255) gCAGTGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGGCTCagg < 8:290810/149‑3 (MQ=255) gCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCAcc < 8:253865/149‑1 (MQ=255) gggAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGc < 7:290831/149‑1 (MQ=255) ggAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCg > 6:24428/1‑149 (MQ=255) ggAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCg < 7:40680/149‑1 (MQ=255) gAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCTCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGt < 5:43611/149‑1 (MQ=255) gAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGt > 6:348108/1‑149 (MQ=255) gAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGACTCag > 4:82341/1‑142 (MQ=255) gAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGACTCag < 3:82341/143‑2 (MQ=255) ccTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTg > 6:209931/1‑147 (MQ=255) ccTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGaa < 6:117443/149‑1 (MQ=255) cATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGGCCACCTGCGCACCCTCGACCACGTGTTGAAGCTTAAAAACCTCAGCCTCGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTTATCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCt < 3:120084/149‑1 (MQ=255) aTGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCtt < 2:320389/149‑1 (MQ=255) gAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTc > 7:294665/1‑148 (MQ=255) aCCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTGGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCATCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTTAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCga < 6:126749/148‑1 (MQ=255) aCCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgat > 5:27063/1‑149 (MQ=255) aCCCCACCTTCGCCTACCTCAGCCTGGCCCACCTGCCCAACCTCGACCAACTGTTGCATCTTAAAAACCTCAGACACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCga < 6:132595/148‑1 (MQ=255) ccccACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgat > 7:137413/1‑148 (MQ=255) ccACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgatgat < 4:330852/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGAGGATCCGt > 6:163225/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCCCTCAGCCTAGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCGGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGtt > 3:54033/1‑149 (MQ=255) gCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCt > 3:368497/1‑149 (MQ=255) gCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCAATCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCt > 3:368492/1‑149 (MQ=255) cctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTgc > 3:365126/1‑149 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAg > 2:212334/1‑124 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAg < 1:212334/124‑1 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTgcg < 5:209931/149‑1 (MQ=255) gCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCaa < 8:68345/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAg > 3:176446/1‑149 (MQ=255) tCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAggg > 6:160236/1‑149 (MQ=255) cccACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGt < 4:274311/149‑1 (MQ=255) ccgcgcgcgcCCCCGCGACCACCTGGTGCCGCTTACACCCCTCAGCCCCGCGGCCGAGCGCCTGGGGGGCAGCCAATCGGCCCGGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg < 3:223133/143‑1 (MQ=255) ccACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg < 8:294665/149‑1 (MQ=255) acttGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGaa < 3:87889/107‑1 (MQ=255) acttGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGaa > 4:87889/4‑110 (MQ=255) gcACCCTCGACCCCCTGTTGCAGCTTAAAACCCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGCGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGGGAAGCAGTCGAGGATCCTGTGCGGGTACGCCAAGGGCGTg > 4:223133/1‑141 (MQ=255) aCCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCt > 7:135535/1‑149 (MQ=255) ccaccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAAc < 8:137413/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg > 2:260295/1‑128 (MQ=255) ccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg < 1:260295/128‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCAGCGTGAAGACTTCGATGATGCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATg > 4:310119/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAATCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGc < 6:27063/149‑1 (MQ=255) gCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAAc < 3:103597/140‑1 (MQ=255) gCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAAc > 4:103597/1‑140 (MQ=255) gCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAg > 8:44511/1‑149 (MQ=255) cTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCt < 8:135535/149‑1 (MQ=255) aaaaaCCTCAGCCTCGCTGCCGAGCTAATGGGTTTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGAAGCTGGATCACCTGCGTGAAGCATTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTTGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTgg < 4:368492/148‑1 (MQ=255) aaaaaCCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTgg < 4:368497/148‑1 (MQ=255) cTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCAGGTCGAGcc > 5:364004/1‑149 (MQ=255) aGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGc < 3:113391/64‑1 (MQ=255) aGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGc > 4:113391/1‑64 (MQ=255) gCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg < 5:348108/149‑1 (MQ=255) ccACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGcc > 4:5774/1‑127 (MQ=255) ccACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCGGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTgc < 5:24428/149‑1 (MQ=255) gggCCGAGCGCCTGTGTGTCAGCCATTCGGCCCTGAGACGGAAGCTGGCTCACCTGAGTGAAGCCTTCGCTGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGTTCGAGCCTTTGCGCCAg < 4:54033/148‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCga < 4:176446/149‑1 (MQ=255) tccTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCgaa < 4:365126/148‑1 (MQ=255) cTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGc > 6:328636/1‑102 (MQ=255) cTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGc < 5:328636/102‑1 (MQ=255) gggTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCg < 3:270680/143‑1 (MQ=255) gggTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGACGAAGCCCTGGTCGAGCGTTTGAGCCAGGTGCTCgaatatc > 4:270680/1‑145 (MQ=255) ggTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGc > 7:204321/1‑107 (MQ=255) ggTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGc < 8:204321/107‑1 (MQ=255) ggTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCAGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAAc < 6:364004/148‑1 (MQ=255) tCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCAc > 2:378849/1‑149 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAg < 6:7363/72‑1 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAg > 5:7363/1‑72 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGt > 6:91887/1‑112 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGt < 5:91887/112‑1 (MQ=255) aggtGAGCCAGCTGCCGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg < 5:284920/110‑1 (MQ=255) aggtGAGACAGCTGCCGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg > 6:284920/4‑113 (MQ=255) tGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGACCTGCACGCGCTGCGCCAGccc > 4:217548/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCg > 8:194525/1‑146 (MQ=255) ccGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCg < 7:194525/146‑1 (MQ=255) | CCTTGAATTCCACCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCG > NC_002947/2896655‑2896946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |