| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,475,772 | T→G | 5.8% | Q314P (CAG→CCG) | PP_3087 ← | excinuclease ABC subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,475,772 | 0 | T | G | 5.8% | 217.6 / 2.5 | 68 | Q314P (CAG→CCG) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/32); new base G (2/2); total (34/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GAGGCCGAGGTCAAGCAGCGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTGC > NC_002947/3475624‑3475918 | gaggccgaggTCAAGCAGCGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCt < 4:251472/149‑1 (MQ=255)gaggccgaggTCAAGCAGCGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCt < 6:397969/149‑1 (MQ=255)gaggccgaggTCAAGCAGCGTATCAATGCGCTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCt > 5:2352/1‑149 (MQ=255) cgaggTCAAGCAGCGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAAc < 5:331542/149‑1 (MQ=255) agcagcGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTg < 6:235496/149‑1 (MQ=255) agcGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGa > 5:358129/1‑149 (MQ=255) cGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGa > 1:66259/1‑147 (MQ=255) gTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAg > 2:86473/1‑149 (MQ=255) aTCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGtt > 4:80739/1‑149 (MQ=255) tCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTc > 8:246221/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTTGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTc < 8:200747/148‑1 (MQ=255) aGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGccc > 2:196964/1‑149 (MQ=255) tGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGaa < 1:86473/148‑1 (MQ=255) aTGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCg < 7:92822/138‑1 (MQ=255) aTGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCg > 8:92822/1‑138 (MQ=255) ttGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCAc < 3:106048/144‑1 (MQ=255) ttGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCAc > 4:106048/1‑144 (MQ=255) ccgccAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGt > 7:170495/1‑120 (MQ=255) ccgccAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGt < 8:170495/120‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgc < 1:196964/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgcgc < 5:301729/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGAAGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgcgc > 1:15806/1‑149 (MQ=255) gCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAg < 1:18143/127‑1 (MQ=255) gCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAg > 2:18143/1‑127 (MQ=255) gTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgcgctt > 5:196959/1‑148 (MQ=255) gTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGAAGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgcgcttc < 2:15806/149‑1 (MQ=255) tttttCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAgcgcttcgcgctt > 3:98334/1‑147 (MQ=255) tttttCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCa < 6:2352/149‑1 (MQ=255) ttCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAgg < 5:208901/148‑1 (MQ=255) ttCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGATCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGc > 1:338098/1‑149 (MQ=255) aGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGttt < 2:338098/149‑1 (MQ=255) gtgtCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAg > 6:243227/1‑82 (MQ=255) gtgtCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAg < 5:243227/82‑1 (MQ=255) tCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGcc > 8:273835/1‑148 (MQ=255) tCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGcc < 3:80739/148‑1 (MQ=255) gCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTgg > 3:144951/1‑149 (MQ=255) tCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAg < 4:98334/149‑1 (MQ=255) tgctgctgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACg > 2:368471/1‑108 (MQ=255) tgctgctgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACg < 1:368471/108‑1 (MQ=255) tgctgctgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCgg > 5:26875/1‑149 (MQ=255) ctgctgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCggg < 7:246221/148‑1 (MQ=255) ctgctgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGc < 6:358129/149‑1 (MQ=255) tgGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGt > 6:113276/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGc > 1:379380/1‑149 (MQ=255) gTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCt > 7:27336/1‑149 (MQ=255) tCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTg > 7:88533/1‑149 (MQ=255) aGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTggg < 2:66259/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCa > 3:164835/1‑110 (MQ=255) gTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCa < 4:164835/110‑1 (MQ=255) gTCGGCTGCCGCCACCTTGAGGAACACCACAGCCAGAGCCTGCAACGACAGGTTCGACAGTTCGCCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGAGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTTCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCa > 5:416192/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCAt < 5:113276/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCGGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTggg > 3:258266/1‑143 (MQ=255) tCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCGGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTggg > 3:263542/1‑143 (MQ=255) tCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCGGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTggg < 4:263542/143‑1 (MQ=255) tCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCGGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTggg < 4:258266/143‑1 (MQ=255) ccgccACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTgg < 3:50/149‑1 (MQ=255) cgccACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTggg < 8:27336/149‑1 (MQ=255) cgccACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTggg < 4:144951/149‑1 (MQ=255) gacagcTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTg < 8:268109/108‑1 (MQ=255) cTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCacac < 7:273835/149‑1 (MQ=255) cGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCtt < 6:196959/149‑1 (MQ=255) ggAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGa > 6:218521/1‑37 (MQ=255) ggAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGa < 5:218521/37‑1 (MQ=255) gAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTgc < 7:248903/149‑1 (MQ=255) cTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCt > 5:102283/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGTACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCGTgcgtctcag > 6:192181/1‑143 (MQ=255) tCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTg > 7:26379/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTg > 6:195116/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTg > 8:85734/1‑149 (MQ=255) ccTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTGc < 6:26875/149‑1 (MQ=255) cTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTGc > 7:243827/1‑148 (MQ=255) | GAGGCCGAGGTCAAGCAGCGTATCAATGCGTTCGAGCAGTTCTTTGGCGATGCGTTGGGCCGCCAGGCGTTTTTCCAGTGTCAGCTCGTCCTGCTGCTGGGTCAGGTAGTCGGCTGCCGCCACCTTGCGGAACACCTCAGCCAGCGCCTGCAACGACAGGTGCGACAGTTCGGCGATGTCCAGCCCGGCGAAGGTCACGGCCAGCGCTTCGCGCTTCAGGCGTTTGCCCTGGCACAGCGGGCAGGTGCTGGGGTGCATGTACTGGGCCACACGCTTGCGCATCTGCGCGCTCTGC > NC_002947/3475624‑3475918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |