Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,825,963 | A→T | 5.1% | V28D (GTC→GAC) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,825,963 | 0 | A | T | 5.1% | 253.0 / 2.7 | 79 | V28D (GTC→GAC) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/40); new base T (2/2); total (37/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 |
GCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGG > NC_002947/3825820‑3826108 | gCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTg < 4:145855/149‑1 (MQ=255) aTGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGc > 1:166953/1‑149 (MQ=255) ccGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCttt < 1:223508/149‑1 (MQ=255) cGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTg < 5:88235/149‑1 (MQ=255) aGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAAc < 2:166953/149‑1 (MQ=255) gTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACg > 3:226197/1‑149 (MQ=255) tCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc > 2:109607/1‑149 (MQ=255) gcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCATGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 6:113488/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCaa > 6:45577/1‑148 (MQ=255) cgcgCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgc < 4:226197/149‑1 (MQ=255) cgcgCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgc > 5:82340/1‑149 (MQ=255) gCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCAc > 7:129967/1‑149 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGa > 3:385634/1‑149 (MQ=255) gAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATg < 3:209707/149‑1 (MQ=255) gCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACACCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGt > 3:309411/1‑149 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGa < 8:202907/149‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGa < 8:42037/149‑1 (MQ=255) tCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGTTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAcc > 5:198534/1‑149 (MQ=255) tCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAcc > 3:142992/1‑149 (MQ=255) tCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAcc > 3:43279/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACg > 6:160016/1‑98 (MQ=255) ggTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGt > 8:332012/1‑149 (MQ=255) gTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGtt > 6:177307/1‑149 (MQ=255) gggCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc > 3:66073/1‑109 (MQ=255) gggCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc < 4:66073/109‑1 (MQ=255) gggCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTcgcg < 6:82340/149‑1 (MQ=255) gggCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTcgc < 4:385634/148‑1 (MQ=255) cGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGt < 5:177307/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATgg < 1:109607/148‑1 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATggg > 8:30410/1‑148 (MQ=255) gAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGTCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg > 4:181616/1‑149 (MQ=255) gAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGTCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg > 4:187881/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAgg > 3:185495/1‑149 (MQ=255) gTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGcgcg > 2:86123/1‑149 (MQ=255) ttCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCATCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGTCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGt < 3:187881/149‑1 (MQ=255) ttCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGTCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGt < 3:181616/149‑1 (MQ=255) aCCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTTGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCAt < 1:135565/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg > 5:128475/1‑149 (MQ=255) ccTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg < 2:305429/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg > 6:403350/1‑149 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATgg > 5:64257/1‑149 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg < 7:305835/148‑1 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg > 8:305835/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGtt > 2:303417/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTc < 1:86123/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTc < 4:185495/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACACCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGtttt < 4:309411/148‑1 (MQ=255) ccGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCtt < 4:43279/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATgg > 4:99331/1‑99 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATgg < 3:99331/99‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTAt < 8:129967/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTAt < 7:30410/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTAt < 7:332012/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGt > 3:66131/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTaa < 5:404301/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa > 6:95984/1‑135 (MQ=255) ttCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa < 5:95984/135‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTaa > 2:20818/1‑147 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGgc < 8:360394/108‑1 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGgc > 7:360394/1‑108 (MQ=255) ccAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgat < 4:142992/149‑1 (MQ=255) aGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtga < 7:371862/146‑1 (MQ=255) aGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtga > 8:371862/1‑146 (MQ=255) aaTTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAAc < 4:66131/149‑1 (MQ=255) aTTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAAcc > 6:351138/1‑149 (MQ=255) gTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTc > 6:30790/1‑148 (MQ=255) tCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCaa < 6:198534/149‑1 (MQ=255) tCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCaa < 6:128475/149‑1 (MQ=255) gCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAAt > 2:207475/1‑148 (MQ=255) gCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATa < 5:30790/149‑1 (MQ=255) ccACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATAc < 1:207475/149‑1 (MQ=255) cACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAAcc < 7:103122/137‑1 (MQ=255) cACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAAcc > 8:103122/1‑137 (MQ=255) cACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACa < 6:64257/149‑1 (MQ=255) aaCGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATg > 1:299309/1‑149 (MQ=255) aaCGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATg > 2:353386/1‑149 (MQ=255) aCGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTaa < 3:302946/114‑1 (MQ=255) gggAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATgcgc < 2:299309/149‑1 (MQ=255) gggAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATgcgc < 5:403350/149‑1 (MQ=255) gagaCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGTTTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCgg < 1:303417/149‑1 (MQ=255) gagaCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCgg > 3:314529/1‑149 (MQ=255) | GCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGG > NC_002947/3825820‑3826108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |