Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,901,484 | A→G | 5.5% | R54R (AGA→AGG) | PP_3444 → | glyoxalase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,901,484 | 0 | A | G | 5.5% | 217.1 / 2.1 | 73 | R54R (AGA→AGG) | PP_3444 | glyoxalase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/31); new base G (2/2); total (40/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 |
CATCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGGCCGCCGGGG > NC_002947/3901337‑3901632 | cATCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGaa < 7:162128/149‑1 (MQ=255) aTCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGGAt > 2:90146/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGGAt > 2:84476/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAAt > 7:115856/1‑149 (MQ=255) cccGAAGGCCAGCACAGCATGACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCATGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTGCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCg < 5:113643/148‑1 (MQ=255) ccGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCTAACTGAGAATCGGc > 8:289267/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGc < 2:105879/149‑1 (MQ=255) cagcacagcaTCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATtcgtc > 2:394898/1‑149 (MQ=255) gcacagcaTCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGc < 7:289267/149‑1 (MQ=255) cacagcaTCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCt > 2:391094/1‑149 (MQ=255) agcaTCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGAt > 5:1066/1‑149 (MQ=255) cTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTg > 8:156628/1‑149 (MQ=255) gCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGTACTGAGGATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGa < 1:84476/149‑1 (MQ=255) gCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGGATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGa < 1:90146/149‑1 (MQ=255) aTCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACAt > 5:66834/1‑149 (MQ=255) acgacgCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATgg > 1:4448/1‑147 (MQ=255) acgacgCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGaa < 8:115856/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcg < 1:391094/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcg < 1:394898/149‑1 (MQ=255) gccgccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcgg > 7:265144/1‑149 (MQ=255) ccgccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGAc > 4:376265/1‑137 (MQ=255) ccgccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGAc < 3:376265/137‑1 (MQ=255) ccgccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcggc < 2:4448/149‑1 (MQ=255) ccgccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcggc < 6:66834/149‑1 (MQ=255) gccAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCt > 5:327522/1‑149 (MQ=255) aaGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCAc > 1:331198/1‑149 (MQ=255) cATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCgc > 7:82091/1‑147 (MQ=255) tCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCg > 5:228128/1‑123 (MQ=255) tCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCg < 6:228128/123‑1 (MQ=255) aGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCgccagcca < 3:166412/148‑1 (MQ=255) aGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCgccagc > 4:166412/1‑146 (MQ=255) tCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAg > 4:343471/1‑149 (MQ=255) cTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGa > 2:249198/1‑98 (MQ=255) cTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGa < 1:249198/98‑1 (MQ=255) tACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcg > 8:168589/1‑127 (MQ=255) tACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAggcg < 7:168589/127‑1 (MQ=255) caagcaagCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTc > 4:159569/1‑148 (MQ=255) caagcaagCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCa < 3:343471/149‑1 (MQ=255) gcaagcCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACg > 7:322611/1‑149 (MQ=255) gcaagcCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACg > 5:225665/1‑149 (MQ=255) aagcCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGt > 2:26481/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGgt < 6:1066/148‑1 (MQ=255) gTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGATGGCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGgtgt > 1:212828/1‑149 (MQ=255) tGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTg < 2:331198/149‑1 (MQ=255) gTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCt < 3:171909/149‑1 (MQ=255) aTGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACtt > 4:388606/1‑149 (MQ=255) gTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGccagccag > 2:412923/1‑115 (MQ=255) gTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGccagccag < 1:412923/115‑1 (MQ=255) ttCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGc > 7:143159/1‑128 (MQ=255) ttCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGc < 8:143159/128‑1 (MQ=255) tgcctcgtCGCT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGt < 1:141229/141‑1 (MQ=255) tCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAg > 6:351217/1‑149 (MQ=255) gAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGa < 8:265144/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTCGCGTTGGCCATGTCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGc > 1:105896/1‑148 (MQ=255) ccAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGa < 8:312473/52‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGa > 7:312473/1‑52 (MQ=255) ccAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGa < 1:242067/140‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGa > 2:242067/1‑140 (MQ=255) aGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGAc > 8:64512/1‑148 (MQ=255) gCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAg > 1:27600/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAg < 7:64512/149‑1 (MQ=255) tCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTc > 7:160707/1‑148 (MQ=255) gcgTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTAc < 8:82091/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGcc > 1:176177/1‑147 (MQ=255) ccATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGt > 2:392656/1‑116 (MQ=255) ccATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGt < 1:392656/116‑1 (MQ=255) gCCGAACAGAGAATCGGAGATTCGTCCATGATGCACGCCCACCCTTGCGACATCGAAGGCGGCCTCACCCCAAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTTGCGTGCACTTGTATATTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCt > 4:61212/1‑149 (MQ=255) cGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTgg < 3:202787/35‑1 (MQ=255) cGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTgg > 4:202787/1‑35 (MQ=255) cGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTgg < 6:225665/149‑1 (MQ=255) gAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGgc < 6:327522/149‑1 (MQ=255) aaCTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGgcc < 3:388606/149‑1 (MQ=255) tGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGc > 2:19692/1‑119 (MQ=255) tGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGc < 1:19692/119‑1 (MQ=255) aaTCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGGCCGCCgggg < 2:27600/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTACGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGGCCGCCgggg < 3:159569/149‑1 (MQ=255) | CATCCCCGAAGGCCAGCACAGCATCACGCCCTACCTGGCCATCAACGACGCCGCCAAGGCCATCGAGTTCTACAAGCAAGCCTTTGGTGCGGTGGAAATGTTCCGCCTCGAT‑GCCCCAGGCGGTCGCGTTGGCCATGCCGAACTGAGAATCGGCGATTCGTCGCTGATGCTGGGCGACCCTTGCGACATGGAAGGCGGCCTCACCGCCAGCCAGAAGCTCAACGGTGCGGGTGTTGGCCTGCACTTGTATGTTGAGGACTGCGACAAGGTCTACGCCCAGGCCCTGGCCGCCGGGG > NC_002947/3901337‑3901632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |