| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,979,696 | A→T | 5.1% | L312Q (CTG→CAG) | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,979,696 | 0 | A | T | 5.1% | 247.9 / 2.1 | 79 | L312Q (CTG→CAG) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/35); new base T (2/2); total (42/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
CAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCGGTGGTATTGAC > NC_002947/3979556‑3979844 | cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCGAGTAGCAGACAACGTCGGACTGGATGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCATTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTcgcg > 1:233399/1‑149 (MQ=255)cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTcgcgc < 8:382137/149‑1 (MQ=255)cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTcgcgc < 5:68278/149‑1 (MQ=255)cAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTCGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTcgcgc > 7:17528/1‑149 (MQ=255) aaaGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTcgcgcg > 6:33477/1‑149 (MQ=255) aGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCTGGGcgcgcgcg > 4:127938/1‑149 (MQ=255) tGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGccc < 5:305594/146‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGccc > 6:305594/1‑146 (MQ=255) gggTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCTGGGCGCGCGCGACCTGGCCATGcac < 3:127938/149‑3 (MQ=255) ggCTCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGTCTCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTg < 7:148698/148‑1 (MQ=255) gACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCccagccag > 6:303840/1‑149 (MQ=255) gACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGGGATAATGCGACCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCccagccag > 6:259840/1‑149 (MQ=255) cAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGc > 2:28795/1‑149 (MQ=255) aaCGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAACGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCt > 8:139371/1‑149 (MQ=255) aaCGTCGGACTGCCTGCGCTCCCTGCGCCACCCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGACCAGCTCCCGCAATGCAATGT‑GCATCGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTACCAGCCAggat > 8:202877/1‑147 (MQ=255) gTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGt < 5:303840/149‑1 (MQ=255) gTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGt > 5:396720/1‑149 (MQ=255) gTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTCGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGt < 8:17528/149‑1 (MQ=255) tCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGtt < 5:33477/149‑1 (MQ=255) ggACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgg > 3:308604/1‑145 (MQ=255) ggACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgg < 4:308604/145‑1 (MQ=255) gACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTc > 3:48775/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgg < 3:361260/139‑1 (MQ=255) gCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgg > 4:361260/1‑139 (MQ=255) gCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTgcg < 1:28795/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTg < 3:368995/147‑1 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTc < 3:335223/124‑1 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTc > 4:335223/1‑124 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGca > 5:361745/1‑149 (MQ=255) tGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATCGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGATGTCCTGCGca > 5:243903/1‑149 (MQ=255) gctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTgg > 1:159556/1‑130 (MQ=255) gctGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATgg > 5:128396/1‑149 (MQ=255) cgcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGTCGCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTccc < 1:291978/116‑1 (MQ=255) cgcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTccc > 2:291978/1‑115 (MQ=255) gcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTc > 5:22988/1‑130 (MQ=255) gcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTc < 6:22988/130‑1 (MQ=255) gcCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTgc > 5:362036/1‑149 (MQ=255) ccATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTcc > 5:191891/1‑107 (MQ=255) ccATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTcc < 6:191891/107‑1 (MQ=255) aTGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg < 6:362036/149‑1 (MQ=255) aTGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCACGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCgg > 8:22092/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGt > 2:35438/1‑148 (MQ=255) tGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTcg > 7:16720/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCAGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGt < 1:35438/146‑1 (MQ=255) aCCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGaaa > 3:68960/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAAc < 2:233399/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACg > 6:2738/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTACGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACg > 2:376615/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGgc > 4:41389/1‑149 (MQ=255) gcgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGgcg > 8:248002/1‑148 (MQ=255) gcgTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGgcg > 8:194733/1‑148 (MQ=255) gATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGt > 3:389483/1‑149 (MQ=255) gATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGt > 1:171944/1‑149 (MQ=255) aTAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGtt > 6:287923/1‑149 (MQ=255) aTAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAACGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGt < 7:139371/148‑1 (MQ=255) aTGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTggg > 2:144304/1‑149 (MQ=255) 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aGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTgc < 7:357393/84‑1 (MQ=255) aGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTgc > 8:357393/1‑84 (MQ=255) gCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTg < 6:128396/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCACGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTg < 7:22092/149‑1 (MQ=255) cTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTgg < 2:171944/149‑1 (MQ=255) cGGCAATGCACTGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGACCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACa < 4:48775/149‑1 (MQ=255) aatgcaatgT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGc < 7:194733/149‑1 (MQ=255) aatgT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAAc < 3:41389/149‑1 (MQ=255) tgt‑gCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGGTGGACAAGGCGCAGCCg > 2:379028/1‑149 (MQ=255) t‑gCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCggt < 8:16720/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCggtgg < 1:144304/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCggtg < 6:361745/148‑1 (MQ=255) aTGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAAAGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCggtgg > 2:308189/1‑148 (MQ=255) ggCCTGGGCGCGCGCGACCTGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTg > 7:27898/1‑127 (MQ=255) ggCCTGGGCGCGCGCGACCTGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTg < 8:27898/127‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGca < 6:261840/62‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGca > 5:261840/1‑62 (MQ=255) aGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCGGTGGTATTGAc < 4:389483/149‑1 (MQ=255) | CAAAGTCCATGCGCTCGGGGTGGGCGCG‑GTAGCAGACAACGTCGGACTGGCTGCGCTCGCTGCGCCAGGCCATGTCCTTGAAGCTGACCGGGCGCGTGATAATGCGCCCGTCCAGCTCCGGCAATGCAATGT‑GCATGGCCAGGTCGCGCGCGCCCAGGCCCTGCTCGCTGGCTTCCCAGCCAGGCTGGTTGTCCTGCGCACAGATGGCCTGCAGCACCGGGATGTCGCGGCGAAACGGGCGCAGGTTGGGGCGCTCGGGGCTGGACAAGGCGAAACCGGTGGTATTGAC > NC_002947/3979556‑3979844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |