| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,084,406 | C→A | 5.1% | S183* (TCG→TAG) | PP_3594 → | amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,084,406 | 0 | C | A | 5.1% | 262.6 / 2.9 | 82 | S183* (TCG→TAG) | PP_3594 | amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/38); new base A (2/2); total (41/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
CTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTTCGCCTACATCGAACGGCGCAGCAACCG > NC_002947/4084261‑4084553 | cTGGAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt > 8:135750/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTgg > 5:232138/1‑148 (MQ=255) gAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTg < 3:326116/147‑1 (MQ=255) gAAGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGt < 6:232138/149‑1 (MQ=255) aaGCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTc > 5:342808/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAGCGAGATGGTCGa > 7:183431/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAGCGAGATGGTCGAc < 8:183431/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGa > 6:139986/1‑147 (MQ=255) cTGCTCGGCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGa < 5:139986/147‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGGCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATgc > 1:71186/1‑149 (MQ=255) ggCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAc > 2:32986/1‑148 (MQ=255) gCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAcc > 7:75929/1‑148 (MQ=255) gCTTAGCAAGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGAcc > 2:244684/1‑148 (MQ=255) aaGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGc > 8:284727/1‑149 (MQ=255) aGCGCACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCg < 7:135750/149‑1 (MQ=255) gcACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGCCCATCTCGCTGGTCGACATGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGt > 1:65355/1‑148 (MQ=255) gcACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCGTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGt > 1:113391/1‑148 (MQ=255) cACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGAt < 3:130848/126‑1 (MQ=255) cACCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGAt > 4:130848/1‑126 (MQ=255) aCCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCTCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCTCCAGACCACCCTGGCGGTCAg > 8:375382/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAg > 5:229487/1‑149 (MQ=255) gTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAGCGAGATGGTCGAcacca > 8:300039/1‑116 (MQ=255) gTTTCTTCAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCAGCGAGATGGTCGAcacca < 7:300039/120‑5 (MQ=255) gTTTCTTCAAGGTGATGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCGCTGCACGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTa < 2:65355/149‑1 (MQ=255) tcttcAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAAc < 8:75929/148‑1 (MQ=255) tcttcAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGAAGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAAc < 1:32986/148‑1 (MQ=255) cAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCa < 6:172974/137‑1 (MQ=255) cAAGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCa > 5:172974/1‑137 (MQ=255) aGGTGCTGCTGCCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTAGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGaa > 2:214493/1‑149 (MQ=255) ctgctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGa < 4:243546/148‑1 (MQ=255) ctgctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGAt < 2:276485/149‑1 (MQ=255) ctgctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGAt < 1:214493/149‑1 (MQ=255) tgctgcCACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATg > 3:265181/1‑149 (MQ=255) ccACAACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttc < 2:71186/147‑1 (MQ=255) acaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt < 7:145014/87‑1 (MQ=255) acaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt > 8:145014/1‑87 (MQ=255) acaACTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGttcttc > 4:158302/1‑148 (MQ=255) cTGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACgg > 1:134025/1‑149 (MQ=255) tGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGc > 8:188996/1‑81 (MQ=255) tGACCCGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGc < 7:188996/81‑1 (MQ=255) ccGCATCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCg > 6:116789/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctgc < 3:158302/149‑1 (MQ=255) cccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt < 8:383514/70‑1 (MQ=255) cccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCt > 7:383514/1‑70 (MQ=255) cccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGcctgcctg > 3:403885/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTgg < 5:116789/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTggg < 1:244684/149‑1 (MQ=255) tGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctgc > 7:92415/1‑143 (MQ=255) tGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctgc < 8:92415/143‑1 (MQ=255) tGCCCGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCACACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTATACGGCGTCGCCTTCATGGGc > 6:133615/1‑149 (MQ=255) cccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctgcc < 3:161599/142‑1 (MQ=255) cccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCgcctgcc > 4:161599/1‑142 (MQ=255) ccGGCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTAc < 5:133615/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACctg < 2:355524/149‑1 (MQ=255) gTCCAACAACTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGt > 7:211594/1‑149 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCCAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGGCGACCTGATGCGCCAGCCCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAgg < 5:90198/101‑1 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTaa > 5:160389/1‑95 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTaa < 6:160389/95‑1 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTGTTCTACGGCGTCGcctgcctg < 8:284473/133‑1 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACg < 4:5074/119‑1 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACg > 3:5074/1‑119 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTcg > 7:100121/1‑149 (MQ=255) caacaaCTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTATTCTACGGCGTCGcctgcctg > 7:284473/1‑133 (MQ=255) acaacTGGCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTcgcg < 6:229487/149‑1 (MQ=255) ggCTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTg > 7:164390/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTc < 2:134025/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTGGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGt < 2:173222/146‑1 (MQ=255) gTCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTGGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGt > 1:173222/1‑146 (MQ=255) tCGCTGCTCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCgg > 2:350307/1‑149 (MQ=255) ctCAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGgcgc < 8:211594/147‑1 (MQ=255) cAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACctgct < 8:334047/123‑1 (MQ=255) cAAGGACACCTCGCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACctgct > 7:334047/1‑123 (MQ=255) 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(MQ=255) gCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTTCGCCTACAt < 1:350307/147‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTTCGCCTACATCg < 6:265408/149‑1 (MQ=255) tGGTGTCGACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTTCGCCTACATCGaa < 8:100121/149‑1 (MQ=255) gACCATCTCGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGGCGCGTGTTCGCCTACATCGAACGGCgca < 6:342808/149‑1 (MQ=255) tctcGCTGGTCGACCTGATGCGCCAGACCAACCTGGCGGTCAGCGTAACCAAGGAACCGATGTTCTTCTACGGCGTCGCCTGCCTGGGCTACCTGCTGTTCGCGGCACTGTCCGGgcgc < 5:267702/119‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |