| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,242,794 | A→G | 5.7% | S15P (TCT→CCT) ‡ | PP_3719 ← | putrescine‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,242,794 | 0 | A | G | 5.7% | 205.2 / 2.3 | 71 | S15P (TCT→CCT) ‡ | PP_3719 | putrescine‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/30); new base G (2/2); total (38/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
CATCGAAGGTGTCGTAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGTTTTTTGGC > NC_002947/4242650‑4242941 | cATCGAAGGTGTCGTAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGc > 3:91284/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGTGTCGTAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGTCTGGCGCcag < 2:331494/149‑1 (MQ=255) tCGTAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGAcc > 6:225569/1‑149 (MQ=255) tAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGc > 3:135777/1‑148 (MQ=255) gACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCa > 7:364760/1‑149 (MQ=255) aCCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCa < 2:260930/148‑1 (MQ=255) cTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCcagca < 6:363988/131‑1 (MQ=255) cTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCcagca > 5:363988/1‑131 (MQ=255) gATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCtt < 4:135777/147‑1 (MQ=255) gCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTgc < 8:364760/148‑1 (MQ=255) ttCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTACCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCAt > 4:176910/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTgcg < 6:368414/142‑1 (MQ=255) cGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTgcg > 5:368414/1‑142 (MQ=255) ggCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTc < 1:142238/124‑1 (MQ=255) ggCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGACCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTc > 2:142238/1‑124 (MQ=255) gCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATC < 5:225569‑M1/149‑1 (MQ=255) tggtTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATg > 6:240772/1‑131 (MQ=255) gtTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCAcc < 4:324694/111‑1 (MQ=255) gtTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCAcc > 3:324694/1‑111 (MQ=255) tttCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACCACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGc > 7:45209/1‑149 (MQ=255) tttCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGc > 2:15099/1‑149 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTTGGCAAGGCTGGCGACAGACGCCAGCAGCAGACAGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGAATGGCAAATACATCGTGTGAGTGCTCCg > 2:379957/1‑149 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTAcc > 7:320200/1‑115 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTAcc < 8:320200/115‑1 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGgctcgatccggag > 3:200176‑M1/1‑136 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCg > 7:146601/1‑149 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCg > 6:340322/1‑149 (MQ=255) cGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGa < 4:91284/149‑1 (MQ=255) aGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGc > 2:75390/1‑149 (MQ=255) gTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCc < 3:169809‑M2/149‑2 (MQ=255) accaagttgTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCcgat > 5:343617‑M2/5‑144 (MQ=255) cAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATggg < 5:340322/148‑1 (MQ=255) aGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTgcg < 8:234544/103‑1 (MQ=255) aGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGtt > 1:266685/1‑149 (MQ=255) aGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGt > 2:322268/1‑148 (MQ=255) gTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGtt > 3:42206/1‑148 (MQ=255) ttGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCa < 8:146601/149‑1 (MQ=255) ttGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCa < 5:142390/149‑1 (MQ=255) aCAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTAt > 5:323620/1‑149 (MQ=255) cAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGgctcgatccggagcactcacacgatggagttgccat < 4:200176‑M1/148‑37 (MQ=255) aaCCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGgctcgatccggagcactcacacgatggagtt > 2:252917‑M1/1‑111 (MQ=255) aaCCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGgctcgatccggagcactcacacgatggagtt < 1:252917‑M1/142‑32 (MQ=255) cGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGt > 6:394072/1‑148 (MQ=255) cGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGt < 5:394072/148‑1 (MQ=255) cGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTc < 1:75390/149‑1 (MQ=255) gtTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGcc > 8:177492/1‑149 (MQ=255) aCCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCgtgt > 1:140303/1‑100 (MQ=255) aCCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCgtgt < 2:140303/100‑1 (MQ=255) aCCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAg > 3:270099/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAggg < 7:177492/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAggg > 1:397465/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAggg < 1:322268/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAggg > 4:200398/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCAGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAggg > 4:174283/1‑149 (MQ=255) cccACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGAc < 1:15099/149‑1 (MQ=255) cACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACa > 2:101887/1‑148 (MQ=255) tctGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATAccc > 2:303431/1‑149 (MQ=255) ctGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCg > 1:58713/1‑121 (MQ=255) ctGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCg < 2:58713/121‑1 (MQ=255) ccgccTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGTCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGaa < 5:396734/149‑1 (MQ=255) ggCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTgtgg < 3:200398/149‑1 (MQ=255) ctgCTGGCGTCTGGCGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTgtgggtgg > 5:390004/3‑149 (MQ=255) tgCTGGCGTCTGGCGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATAcc < 6:383788/131‑1 (MQ=255) tgCTGGCGTCTGGCGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATAcc > 5:383788/2‑132 (MQ=255) cTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCg < 4:42206/149‑1 (MQ=255) ggCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGtt > 3:162654/1‑149 (MQ=255) gcCAGTCGGCAGCAGCAGACCGCCTATGACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGttttt < 2:342135/149‑1 (MQ=255) gcCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGt > 8:5036/1‑90 (MQ=255) gcCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGt < 7:5036/90‑1 (MQ=255) ccAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGtttttt < 1:303431/149‑1 (MQ=255) gACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGTTTTTTGGc < 3:176910/149‑1 (MQ=255) | CATCGAAGGTGTCGTAGATGACCTTGATGCCGGTGGCCTTCTCGAAGTCGGCCAGGGTGGTTTCACCGATGTAGTCGGTCCAGTTGTACAACCGTAACGTGTTACCGCTGCCCACCTCTGCCGCCTGGGCAAGGCTGGCGCCAGACGCCAGCAGCAGACCGCCAATCACCTTCAGTACCTTGCGCATGGCAACTCCATCGTGTGAGTGCTCCGGATCGAGCCGATGGGTTCACTATCGGTGGATTCGCCCAGGGGTGACATACCCCGAATGTGTGGGTGGTCGTTTTTTGGC > NC_002947/4242650‑4242941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |