| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,825 | Δ1 bp | 7.4% | intergenic (+28/‑123) | PP_0414 → / → rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,825 | 0 | G | . | 7.4% | 293.8 / 17.1 | 95 | intergenic (+28/‑123) | PP_0414/rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/42); new base . (2/5); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.43e-01 | |||||||||||
CTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCC > NC_002947/503678‑503970 | cTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTcgc > 1:174270/1‑149 (MQ=255)cTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTcgc < 3:157702/149‑1 (MQ=255)cTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTcgc > 6:136274/1‑149 (MQ=255) aGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTcgcg < 1:166995/147‑1 (MQ=255) aGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCgg < 5:74244/148‑1 (MQ=255) aGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGc < 7:294899/149‑1 (MQ=255) cgcGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCtt > 5:47995/3‑148 (MQ=255) cccGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCt > 2:162452/1‑148 (MQ=255) cccGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCt > 6:44088/1‑148 (MQ=255) cccGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCt > 8:156975/1‑148 (MQ=255) cccGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCt > 6:428114/1‑148 (MQ=255) gcGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCttt < 6:47995/148‑3 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTTCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCgcgaa < 4:57581/148‑5 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACTGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCgcgaa < 2:266584/148‑5 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 2:265209/148‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 6:190526/148‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 5:97866/148‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 5:44088/148‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa > 5:116237/1‑147 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCgcgaag < 1:194728/148‑6 (MQ=255) gcggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAgg < 3:426630/149‑1 (MQ=255) gcggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAgg < 6:182268/149‑1 (MQ=255) cggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGGTGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAAGAGGc < 5:295440/149‑1 (MQ=38) ggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCgg > 2:320402/1‑148 (MQ=255) gACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGca > 3:326499/1‑147 (MQ=255) aCCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑g < 4:94467/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGt > 3:216113/1‑149 (MQ=255) tGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGt > 3:129272/1‑149 (MQ=255) aTTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGtt < 7:380741/148‑1 (MQ=255) aTTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTg < 4:398457/149‑1 (MQ=255) aTTGCGGTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGGGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGtt < 2:116801/148‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGAAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGa > 7:113611/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGac < 4:300546/149‑1 (MQ=255) ctcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGac < 1:320402/148‑1 (MQ=255) ggTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGGGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAATCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGaccacaa > 6:363309/1‑144 (MQ=255) ttgttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGa > 2:160248/1‑149 (MQ=255) tgttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTAGTCGACACCAATTGa < 4:216113/148‑1 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CGTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATa > 8:242404/1‑149 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAAtt > 5:48956/1‑145 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAAtt < 6:48956/145‑1 (MQ=255) tgctgcTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAc > 2:266456/1‑148 (MQ=255) ctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGa > 2:192742/1‑130 (MQ=255) ctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGa < 1:192742/130‑1 (MQ=255) aCCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGc < 2:379148/148‑1 (MQ=255) cccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCt < 1:212865/149‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCtt > 8:195863/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCtt > 2:226162/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCAG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGGTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCt > 8:190172/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTAGCGGCTAAAACCG‑GAAGAGGCCGGCAAA‑GGTTGCGTTGGTAGACACCAATTGATACCAATCAGGCt > 2:346600/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTCATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTAGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAAATGAAACCAATCAGCCt > 6:20811/1‑148 (MQ=255) tGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCa > 1:110273/1‑149 (MQ=255) gAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAg > 1:149734/1‑141 (MQ=255) gAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATc < 1:162452/149‑1 (MQ=255) gAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATc < 7:156975/149‑1 (MQ=255) aGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCg < 7:284190/149‑1 (MQ=255) ttGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTc > 8:393793/1‑149 (MQ=255) cGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCt < 6:370899/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 8:113611/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 7:327639/149‑1 (MQ=255) gCGTAGCGAGAAGGTGGGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGtt < 5:363309/149‑1 (MQ=255) cGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGtt > 3:84353/1‑148 (MQ=255) cGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTa < 1:226162/149‑1 (MQ=255) cGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTa < 1:346600/149‑1 (MQ=255) aGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACaa > 8:249364/1‑149 (MQ=255) 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> 3:255106/1‑106 (MQ=255) aCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCt < 4:255106/106‑1 (MQ=255) ccGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTAGCGGCTAAAGCCG‑GAAGATGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTTAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCaa < 2:124284/149‑1 (MQ=255) gCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAg > 2:307769/1‑149 (MQ=255) gatgGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcgc > 1:231922/1‑148 (MQ=255) atgGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGcc < 2:231922/148‑1 (MQ=255) 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caaccTGTGCCGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAg > 8:113824/4‑149 (MQ=37) gCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGcc > 3:422868/1‑149 (MQ=255) gCCTGTACCGG‑CCTATTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAg < 5:428114/147‑1 (MQ=255) cTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCt < 4:129272/149‑1 (MQ=255) tgtgCCGG‑CCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGccc > 1:90632/1‑148 (MQ=37) 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ctctTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGc < 7:195863/149‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGc < 7:190172/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGcc < 4:326499/147‑1 (MQ=255) cgcgGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGcccc < 4:108443/147‑1 (MQ=255) | CTGAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGG‑CCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACA‑GGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCC > NC_002947/503678‑503970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |