| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,417,328 | Δ1 bp | 8.1% | coding (576/759 nt) | PP_1239 → | metallo‑beta‑lactamase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,417,328 | 0 | T | . | 8.1% | 222.2 / 14.4 | 74 | coding (576/759 nt) | PP_1239 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/35); new base . (2/4); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
GCGCTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAAT > NC_002947/1417182‑1417475 | gcgcTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTgc > 2:134692/1‑149 (MQ=255) gcTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTgcgc < 6:263254/149‑1 (MQ=255) tGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATGGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTg > 7:193818/1‑149 (MQ=255) gCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTg < 1:134692/148‑1 (MQ=255) gCTGGAGCGGTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTg < 4:135983/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTg > 7:379653/1‑149 (MQ=255) tGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTg > 1:95310/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTACCTGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCGGAGGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAT‑GGGCATTTCAACAACCACCAGGCGGGGC‑GGCTGGTGCa > 8:296691/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTg < 1:11408/147‑1 (MQ=255) gAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGC‑GCGCAGCCTGGTg < 2:334497/147‑1 (MQ=255) gAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGC‑GCGCAGCCTGGTg < 7:51466/147‑1 (MQ=255) aGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCAc < 2:295246/149‑1 (MQ=255) aGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGC‑GCGCAGCCTGGTggtt < 5:110975/149‑4 (MQ=255) ttACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGt > 5:420098/1‑149 (MQ=255) ttACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGt < 8:116337/149‑1 (MQ=255) ttACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGt < 8:122480/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGa > 4:424351/1‑144 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGa < 3:424351/144‑1 (MQ=255) cAGTGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACTACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTggg < 5:292915/149‑1 (MQ=255) gggCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCt < 4:221834/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGGTGGCAGGTGGTCACTACGCGGCGTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACTACGACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTg < 7:168610/149‑1 (MQ=255) cTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGaa > 2:317656/1‑149 (MQ=255) gATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAACGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGaa < 1:114797/147‑1 (MQ=255) gATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGaacaa < 2:95310/149‑1 (MQ=255) aTGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGaacaac < 5:245521/149‑1 (MQ=255) tGCACTGCTGATCGAGGCTAATCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAAcc > 7:76066/1‑149 (MQ=255) cACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTg < 3:120682/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTg < 8:345635/148‑1 (MQ=255) aCTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTg > 7:345635/1‑148 (MQ=255) gATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACAcc > 2:327506/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCt > 5:292695/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTg > 2:319417/1‑149 (MQ=255) cGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTg < 8:379653/148‑1 (MQ=255) aCCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGcc > 8:39125/1‑149 (MQ=255) aCCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGC‑GCGCAGCCTGGTggt < 3:422666/109‑3 (MQ=255) aCCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGC‑GCGCAGCCTGGTggt > 4:422666/1‑107 (MQ=255) cACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCa > 2:55110/1‑149 (MQ=255) aCTGTCGCGACCTGCTGGCAAGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGTGTGGCATGCAA‑TGGCATTTTAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGAACGAGTTTGGCTGTAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCAc < 6:439906/149‑1 (MQ=255) tCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCaa < 7:75715/127‑1 (MQ=255) tCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCaa > 8:75715/1‑127 (MQ=255) gcgACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTcag > 3:155354/1‑148 (MQ=255) cgACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCt < 5:49725/135‑1 (MQ=255) cgACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCt > 6:49725/1‑135 (MQ=255) ccTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAgcagca < 6:420098/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCATCAGGCTGCGC‑GCCTGGt > 4:389032/1‑92 (MQ=255) ctgctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCATCAGGCTGCGC‑GCCTGGt < 3:389032/92‑1 (MQ=255) ctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAg < 3:50552/147‑1 (MQ=255) ctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaa < 5:135211/149‑1 (MQ=255) gCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaacaa > 1:262342/1‑149 (MQ=255) gCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaac < 1:319417/147‑1 (MQ=255) gTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGTCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCca > 3:187015/1‑149 (MQ=255) cACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCcaca > 1:5310/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTg > 1:410622/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGc > 1:87643/1‑149 (MQ=255) gCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCg > 6:384493/1‑149 (MQ=255) cTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGc < 6:292695/149‑1 (MQ=255) agcagcGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCttt < 1:55110/149‑1 (MQ=255) agcGTGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCAGCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCGCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTc < 8:81918/149‑1 (MQ=255) gggtgggtGTCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGATCAACCTGCTACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCTAGAACAACCTGCCAGACTTGGCGCGCCAGTGCTTTGTCGac < 8:193818/149‑1 (MQ=255) gtggCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTc < 2:5310/149‑1 (MQ=255) gCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCgg < 3:131730/148‑1 (MQ=255) aa‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGAc > 6:388493/1‑149 (MQ=255) aa‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGAc < 1:401887/149‑1 (MQ=255) aTTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGAc > 1:403168/1‑149 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGTACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGACCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACt > 1:95858/1‑149 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACt > 7:326565/1‑149 (MQ=255) acaacCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCt > 5:422259/1‑91 (MQ=255) acaacCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCt < 6:422259/91‑1 (MQ=255) caacCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTc > 3:104923/1‑148 (MQ=255) tgcaccaGGC‑GCGCAGCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAg > 1:213/3‑149 (MQ=255) ccaccaGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAgg > 6:114788/1‑149 (MQ=255) caccaGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGt > 5:189421/1‑149 (MQ=255) caGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGc < 4:155354/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGa < 7:64178/149‑1 (MQ=255) tGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAAt > 7:319708/1‑148 (MQ=255) | GCGCTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAA‑GGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTGCACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAAT > NC_002947/1417182‑1417475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |