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atcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATcc < 4:151382/149‑1 (MQ=255) tcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCg < 3:111469/149‑1 (MQ=255) catcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGaa > 2:65357/1‑95 (MQ=255) catcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGaa < 1:65357/95‑1 (MQ=255) atcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACcctc < 5:172611/132‑1 (MQ=255) atcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACcctc > 6:172611/1‑132 (MQ=255) atcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGAt > 4:108879/1‑149 (MQ=255) tcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGAt > 5:263149/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGAc > 5:320122/1‑149 (MQ=255) cgcTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACg > 6:163926/1‑149 (MQ=255) cgcTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACg < 6:445254/149‑1 (MQ=255) tAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGc < 2:359597/149‑1 (MQ=255) cacgcT‑‑GGACGCCGC‑A‑GCGCT‑CGGCGTACAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCgag > 8:330379/5‑148 (MQ=255) gCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCg > 3:159980/1‑149 (MQ=255) cG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGc > 5:27923/1‑148 (MQ=255) | CCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGC‑CAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCT‑‑GTACGCCG‑‑A‑GCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGC > NC_002947/5601664‑5601957 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |