| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,905,407:1 | +C | 6.6% | coding (1662/2553 nt) | nirB → | nitrite reductase large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,905,407 | 1 | . | C | 6.6% | 393.1 / 19.4 | 100 | coding (1662/2553 nt) | nirB | nitrite reductase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (50/43); new base C (3/3); total (53/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGGTGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACACCAAGATCACC > NC_002947/1905259‑1905554 | gggTGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAg < 5:198694/149‑1 (MQ=255)gggTGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAg < 8:380025/149‑1 (MQ=255) tGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑Gac < 5:442034/149‑1 (MQ=255) tGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑Ga > 5:113280/1‑148 (MQ=255) acggTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGTGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACAcc < 6:238277/147‑1 (MQ=255) gTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGTC‑CTGCAGCGGCACCAAc < 5:418698/149‑1 (MQ=255) tCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGTC‑CTGCAGCGGCACCAACgc < 5:156775/148‑2 (MQ=255) ccGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACCacc > 7:354397/1‑148 (MQ=255) ccGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCT‑GGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGacac > 2:238501/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCa > 8:68735/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCa > 2:155362/1‑149 (MQ=255) cGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCAt < 7:187235/144‑1 (MQ=255) cGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCAt > 8:187235/1‑144 (MQ=255) cGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGcc > 3:337548/1‑148 (MQ=255) aCTGCTCGAGCGCCATTGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTTCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCAGATCATCGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACa > 2:120415/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACa > 4:240500/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACa > 4:198678/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACa > 3:403852/1‑149 (MQ=255) tGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTACAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATg > 5:227670/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATg > 1:411440/1‑147 (MQ=255) cTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCa < 2:411440/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCCACATTCTCGCCTCGTGCTGGAGCCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATg > 5:300245/1‑146 (MQ=255) gAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGa > 1:60399/1‑148 (MQ=255) ggCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCAc > 4:16843/1‑149 (MQ=255) gCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCAc < 6:113280/148‑1 (MQ=255) gCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCAc < 3:200829/148‑1 (MQ=255) gCAAGGGCCATCTGGGGGGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCAcc < 8:233123/149‑1 (MQ=255) aaGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTa > 4:56768/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTCCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTa > 6:332875/1‑149 (MQ=255) gggTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAGAGACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCggtggt < 1:120415/147‑1 (MQ=255) gggTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACg < 7:161048/100‑1 (MQ=255) gggTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACg > 8:161048/1‑100 (MQ=255) gggTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGcc > 1:420436/1‑149 (MQ=255) ggTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCcg > 2:282592/1‑149 (MQ=255) 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ggCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAACCGGCCCCTATTCGTTGGTGCCGCGCATTCCCGTTGGTAAAATAAcccc > 4:243254/1‑149 (MQ=255) ggCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAAcccc > 2:254251/1‑149 (MQ=255) cAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCg > 2:244268/1‑131 (MQ=255) cAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCg < 1:244268/131‑1 (MQ=255) aCATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGAc < 1:238501/149‑1 (MQ=255) aCATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCACTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGa > 1:405456/1‑148 (MQ=255) ccTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCtcatc > 4:18376/1‑149 (MQ=255) ccTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCtcatc < 6:25345/149‑1 (MQ=255) tGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCtcatcg‑tcat > 2:399750/1‑149 (MQ=255) tGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCgg > 6:216618/1‑149 (MQ=255) tGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCgg > 1:333983/1‑149 (MQ=255) 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tCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAg < 5:332875/149‑1 (MQ=255) aTGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGa < 8:350506/148‑1 (MQ=255) tGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGaaa < 5:216618/149‑1 (MQ=255) gACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAAt < 4:19836/148‑1 (MQ=255) aCCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGCCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATAc < 6:441797/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGa > 1:302154/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGAc < 3:56768/149‑1 (MQ=255) gtcGTTGGTGTC‑CTGCAGCGGCACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGAcc > 2:326423/3‑149 (MQ=255) ggCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACTGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGAcc < 6:227670/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCGCTCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGAc < 1:254251/149‑1 (MQ=255) tcGTTGGTGTC‑CTGCAGCGGCACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAACCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGAc > 8:209202/2‑147 (MQ=255) cGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTg < 2:435250/149‑1 (MQ=255) gTTGGTGTC‑CTGCAGCGGCACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAATAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCCGGTGGCCAAGAAATa < 7:78713/141‑1 (MQ=255) gTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTg > 2:212890/1‑148 (MQ=255) ttGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATaa > 3:10280/1‑97 (MQ=255) ttGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATaa < 4:10280/97‑1 (MQ=255) ttGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTa < 1:282592/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTaca < 3:16843/148‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACAcc < 2:302154/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACAcc < 3:240500/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACAcc > 6:377701/1‑148 (MQ=255) gCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACAcc > 6:219148/1‑148 (MQ=255) cTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACAcc > 3:198747/1‑144 (MQ=255) cTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACACCAAGan < 2:405456/149‑2 (MQ=255) aG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACACCAAGATCAcc < 2:60399/149‑1 (MQ=255) | GGGTGGAGGGTATCCGCACTTTCAGCGAACTGCTCGAGCGCCATGGCAAGGGCCATCTGGGGTGTGACATCTGCAAGCCGGCGGTGGGCAACATTCTCGCCTCGTGCTGGAACCAGCCGATCATGGACCCGGCGTTGGTGCCGCTGCAG‑GACACCAACGACACCTTCATGGCCAACATGCAGAAAAACGGCACCTATTCGGTGGTGCCGCGCATTCCCGGTGGTGAAATAACCCCCGACAAGCTCATCG‑TCATCGGCCAGGTGGCCAAGAAATACGACCTGTACACCAAGATCACC > NC_002947/1905259‑1905554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |