New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 192532 | 83 (1.160) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 5.2% | coding (986/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 192610 | 68 (1.020) | coding (908/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
TCAGGGTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAGGTGCCCGCCAATGATGGCGATGACGATCAAAATCAGGATGGTAAAGGGCAGGTCGATCAGGCTGGTCAGGGTCAGCGAGGC > NC_002947/192386‑192680 | tCAGGGTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGt < 6:226394/149‑1 (MQ=255) aGGGTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTgg < 5:150168/149‑1 (MQ=255) aGGGTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTgg < 5:428550/149‑1 (MQ=255) gggTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGc > 4:185348/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGCGGGTTTGCTCCCACATATTCTGGCGTTCGGTTTCGGCGTTGTTGACGTTTACCGCATCCTGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAATGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCGATGAGTGGc < 2:191307/148‑1 (MQ=255) ggTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGcc > 6:530/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCg > 6:36189/1‑149 (MQ=255) aGGGTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAg < 8:213535/149‑1 (MQ=255) gggTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAgg < 1:422875/149‑1 (MQ=255) gggTTTGCTACCTCATATAATTGCGTTCGCTTTCTTCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCAATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCGATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAg < 4:85527/148‑1 (MQ=255) ggTTTGCTCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAggg > 6:188608/1‑149 (MQ=255) tCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGcc > 3:82465/1‑149 (MQ=255) tCCCACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGcc > 8:226547/1‑149 (MQ=255) ccACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGa > 7:9809/1‑149 (MQ=255) ccACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGa > 8:387154/1‑149 (MQ=255) ccACATATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGa > 8:359400/1‑149 (MQ=255) cacaTATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGAt < 1:323983/149‑1 (MQ=255) cacaTATACTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGAt > 8:356318/1‑149 (MQ=255) tataCTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGccc < 8:337492/149‑1 (MQ=255) ataCTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACGCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGcc > 1:95800/1‑147 (MQ=255) aCTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCa > 3:253485/1‑147 (MQ=255) cTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCaga < 8:28980/148‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCaga < 8:35436/148‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCaga < 6:227998/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGc > 2:178537/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGCTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGc > 1:282688/1‑147 (MQ=255) cTTTCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCggg > 8:62558/1‑147 (MQ=255) tttCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAg > 2:387532/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAgg > 7:229921/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAg < 3:185348/147‑1 (MQ=255) cGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGc < 5:188608/148‑1 (MQ=255) cGGCGTTGTTGACCTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGc > 3:363368/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGTTGCCCTTTCCCGCCTCCCGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGCTGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGGCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCga < 2:338198/149‑1 (MQ=255) 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cTTTACCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATc > 6:281533/1‑148 (MQ=255) aCCGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCacac > 1:122154/1‑149 (MQ=255) cGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCacac > 8:142599/1‑147 (MQ=255) cGCATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCacac > 3:153434/1‑147 (MQ=255) cATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAgg > 2:11509/1‑149 (MQ=255) cATCCAGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAgg > 5:171553/1‑149 (MQ=255) aGACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCATTGGCCGCTGCAGGGGGTAGCCGATGCACAGAGACAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAGCTGcac > 4:78/1‑147 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGATAAATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCTATGATCCGTATCCACACCAGGTGCCCg > 2:387974/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAGGTGCCCGc < 5:439428/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGGGTTTCGATCAGGCTGGACTGGCGCTCTGATGCCAAAGCCATGGTCCGCTCCATGGTCGCCATCAGTGGCCGCTGCAGGGCGTAGCCGATGCCCAGAGCCAGCGGGAAGGCGATGATCGGTATCCACACCAGGTGCCCGc < 4:253485/149‑1 (MQ=255) 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> NC_002947/192386‑192680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |