New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 755731 = | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 3/254 | NT | 5.4% | coding (327/1401 nt) | PP_0646 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 755793 = | 68 (1.000) | coding (389/1401 nt) | PP_0646 | hypothetical protein |
TGTGGCACTTCATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCATGAT > NC_002947/755583‑755878 | tgttGCACTTCATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGTATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTcaca < 1:262040/149‑1 (MQ=255) tgGCACTTCATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACAcc > 5:153958/1‑149 (MQ=255) gaacccctgctcgaaagtcgggttaaggcgttgcaggtacgaaatgggcaaggtcgaatcatggctagccagctccaacagaatctgcgggaacgacatgctccggggcaccacatagaatcccggctgcatctgcccaggcaAccc > 5:373706‑M1/144‑147 (MQ=255) aCTTCATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACccgcc > 1:280852/1‑149 (MQ=255) cATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCgg < 1:323721/147‑1 (MQ=255) tcGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACccgc < 4:197856/140‑1 (MQ=255) tcGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACccgc > 3:197856/1‑140 (MQ=255) ggATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCATCCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGACGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGGACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTgg > 3:289116/1‑147 (MQ=255) ggATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCt < 7:34488/145‑1 (MQ=255) ggATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTggg < 6:395739/148‑1 (MQ=255) ggATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTgg < 3:262327/147‑1 (MQ=255) ggATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTgg < 2:90507/147‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAg > 7:336229/1‑149 (MQ=255) 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ttGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATg > 6:95251/1‑149 (MQ=255) gATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCACGCTATgga > 8:348787/1‑148 (MQ=255) ttGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTcgcccgc > 1:411036/1‑141 (MQ=255) ttGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTcgcccgc < 2:411036/141‑1 (MQ=255) cGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGc < 5:87554/148‑1 (MQ=255) 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gCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCttt > 5:265347/1‑50 (MQ=255) gCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGt < 5:73320/148‑1 (MQ=255) ccGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTACCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGtt < 3:69293/148‑1 (MQ=255) cGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGc < 1:137587/148‑1 (MQ=255) cGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCt > 3:16196/1‑149 (MQ=255) gCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTg < 6:247023/149‑1 (MQ=255) acaaGCCTCACACCCGCCCGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GCGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTGTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGc > 4:323035/4‑149 (MQ=255) tAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTACGGCTTTGGCC‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTAGGCGGGGTGCCTGGGCAGAAGCAGCCGGGATACTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTa < 8:401084/149‑1 (MQ=255) gCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGc > 3:182450/1‑149 (MQ=255) tCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCAt > 7:125221/1‑149 (MQ=255) tCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCAt > 2:383567/1‑149 (MQ=255) tCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCAt > 2:116304/1‑149 (MQ=255) cacaCCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGc > 1:174305/1‑145 (MQ=255) cacCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCATGAt < 2:280852/149‑1 (MQ=255) | TGTGGCACTTCATCTCGGATGGCCAGCCAGTCGCGATGGATGGCGCGTTAGTTGATTGCGGTTGCCCAGAGGGTAGCAACCGGGTGGTGGCGCCTTTAGGGGAAATGC‑CCCCGCCGCGGCTGCCGGTTGCCGTACGCACTAGCCTCACACCCGCCGGCCCTGGGAGCTCTAGCGCTTTGGCA‑GGGGCTTCGCCCGCCATGGTTGGCGGGTTGCCTGGGCAGATGCAGCCGGGATTCTATGTGGTGCCCCGGAGCATGTCGTTCCCGCAGATTCTGTTGGAGCTGGCTAGCCATGAT > NC_002947/755583‑755878 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |