| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1128396 = | 102 (1.420) | 10 (0.150) | 8/246 | NT | 9.4% | coding (1155/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 1128436 = | 99 (1.510) | coding (1115/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
AGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCA > NC_002947/1128250‑1128544 | ccgcgaaaaggccaccagcaacatctgcaccgcccaggtgctgctggccaacatcgccagcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggcctg < 7:190402‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcgaaaaggccaccagcaacatctgcaccgcccaggtgctgctgtccaacatcgccagcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggcctGaa > 6:385769‑M1/147‑149 (MQ=255) gACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGgc < 1:178065/149‑1 (MQ=255) cTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGgcgc > 7:173360/1‑149 (MQ=255) ggccaccagcaacatctgcaccgcccaggtgctgctggccaacatcgccagcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggcctGAAGGCGCTgg > 2:388564‑M1/139‑149 (MQ=255) gTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGgcgc > 3:149195/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGcc < 1:408802/149‑1 (MQ=255) gCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCccac > 4:46802/1‑149 (MQ=255) ccTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCccac > 5:239194/1‑148 (MQ=255) cTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCccacca < 8:173360/149‑1 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACt > 8:312985/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 8:365460/149‑1 (MQ=255) aGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 8:160390/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATACAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTa > 8:316053/1‑149 (MQ=255) gTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACg < 3:46802/147‑1 (MQ=255) cGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATACAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAg < 7:316053/148‑1 (MQ=255) cccaggtgctgctggccaacatcgccagcatgttcgctgtgtaccacggcccttccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggcctGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAgc < 4:170706‑M1/34‑1 (MQ=255) cccaggtgctgctggccaacatcgccagcatgttcgccgtgtaccacggccctgccggtctcaagcgcattgccgagcgcacccacgccctgaccgcgatcctcgccgccggcctGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAgc > 5:117143‑M1/116‑149 (MQ=255) 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gcgcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGt > 2:101828/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACCTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAg < 7:82057/144‑1 (MQ=255) gcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTgg > 1:434775/1‑149 (MQ=255) gcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTgg > 6:168640/1‑149 (MQ=255) gcAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTgg > 3:427198/1‑149 (MQ=255) 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cTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGAc > 8:246550/1‑149 (MQ=255) gTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCg > 1:19013/1‑149 (MQ=255) gTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCg < 2:19013/148‑1 (MQ=255) gTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCg < 1:13824/148‑1 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAATGCGCTTGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGAGACTTCAGGCCGGCGGCGAGCATCGCTGTCAGGTAGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCGTGAGAcctg > 8:301763/1‑146 (MQ=255) aTGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCa < 3:1932/148‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAggg > 1:383070/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGc > 2:136548/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGt > 3:310631/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTg < 5:253268/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTg < 6:203394/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACg < 2:9930/149‑1 (MQ=255) cAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGc > 2:121967/1‑148 (MQ=255) tGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCg < 3:113964/146‑1 (MQ=255) tGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCg > 4:113964/1‑146 (MQ=255) tGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAAc < 4:349614/149‑1 (MQ=255) cc‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGTGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACAt < 1:306001/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTg < 4:149195/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTgg < 6:74577/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTgg < 5:359289/148‑1 (MQ=255) cagggtcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGa > 8:159054/1‑149 (MQ=255) agggtcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAAAGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGAt < 1:101828/149‑1 (MQ=255) ggtcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGAACGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGCACATGATGGCGATGt > 7:378963/1‑149 (MQ=255) tcagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTg > 5:30666/1‑149 (MQ=255) cagggtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCAGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGtt > 1:129517/1‑147 (MQ=255) gtATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCcag < 7:246550/149‑1 (MQ=255) tATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCcagc < 2:383070/149‑1 (MQ=255) tATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCcag > 5:298328/1‑148 (MQ=255) GAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAgcagca < 7:5956‑M1/149‑1 (MQ=255) GAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAgcagca < 2:161080‑M1/149‑1 (MQ=255) GAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAgcagca > 7:344607‑M1/1‑149 (MQ=255) | AGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCC‑GGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGTCAGGGCGTGGGTGCGCTCGGCAATGCGCTTGAGACCGGCAGGGCCGTGGTACACGGCGAACATGCTGGCGATGTTGGCCAGCAGCA > NC_002947/1128250‑1128544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |