New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1968043 | 53 (0.740) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 5.2% | intergenic (‑54/+104) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1968102 | 61 (0.940) | intergenic (‑113/+45) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
GCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAG > NC_002947/1967895‑1968191 | gCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTT > 8:363009‑M1/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTT > 1:370604‑M1/1‑148 (MQ=255) gCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 3:7282/1‑149 (MQ=255) cgcgGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt < 1:19012/149‑1 (MQ=255) gCACCAATGCCACGGCCGGCAGCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCATCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGt < 3:375756/149‑1 (MQ=255) aCCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTcc > 3:133248/1‑149 (MQ=255) cAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGa > 4:194080/1‑149 (MQ=255) cAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGa > 8:268834/1‑149 (MQ=255) aTGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATc < 5:134313/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAg < 3:178647/148‑1 (MQ=255) cACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGgc < 8:14707/149‑1 (MQ=255) ccggcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAg < 3:158434/149‑1 (MQ=255) ccggcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCATTGCATCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACACGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAg > 2:359594/1‑149 (MQ=255) gcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGt > 6:120769/1‑149 (MQ=255) cAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTg < 4:7282/149‑1 (MQ=255) cAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTg < 2:76930/149‑1 (MQ=255) cAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTg > 1:76930/1‑149 (MQ=255) ggATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGgc < 4:174960/149‑1 (MQ=255) gATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGgcg > 1:201489/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTcg > 7:379003/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGCGTTTACCCGCCAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCAGGCCTGGCGCATTcg > 8:316501/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGGGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTcgcg < 3:260570/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgg < 7:265082‑M1/149‑57 (MQ=255) cTTGCCGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGt < 4:240297/149‑1 (MQ=255) gcagcgGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaa < 8:12869‑M2/149‑3 (MQ=255) gcagGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaaccc < 5:110948‑M1/149‑65 (MQ=255) ggTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacc > 8:264298‑M2/1‑141 (MQ=255) ggTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacc < 7:264298‑M2/145‑5 (MQ=255) gTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctc < 6:219843‑M2/149‑10 (MQ=255) ggggCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGAAGGAGCGGGTTAACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCTGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctccta > 1:301841‑M2/1‑137 (MQ=255) ggcgggcgGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctac < 5:154923‑M2/148‑14 (MQ=255) cgggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaaa < 3:194080/149‑1 (MQ=255) gggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaaaa < 3:197495/149‑1 (MQ=255) gcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgatagg < 6:269633‑M1/149‑79 (MQ=255) ggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGc < 7:363009/149‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGc < 6:154923/149‑1 (MQ=255) tgaagacGAACATGGTTATGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCgg < 7:285118/143‑1 (MQ=255) tCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGccc > 5:344836/1‑149 (MQ=255) tCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGATTGTCCGGGCTGGCGCCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGccc > 7:394055/1‑149 (MQ=255) aCATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTc < 2:119535/149‑1 (MQ=255) ggTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCg > 8:229060/1‑149 (MQ=255) gTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCg < 8:161420/148‑1 (MQ=255) tCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTgg < 2:370604/148‑1 (MQ=255) tCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCGGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTggg < 8:379003/149‑1 (MQ=255) tCCTTCGAGTGCGTGGGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTggg < 5:368168/149‑1 (MQ=255) ttCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGtt > 5:205022/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTc < 5:120769/147‑1 (MQ=255) cGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCa < 8:234044/148‑1 (MQ=255) gAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCGTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTGGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAg < 7:316501/148‑1 (MQ=255) cGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGc > 7:392991/1‑144 (MQ=255) cGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGc < 8:392991/144‑1 (MQ=255) gcggcCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAgcg > 4:395004/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCt < 4:133248/149‑1 (MQ=255) ggCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGt < 7:268834/147‑1 (MQ=255) ggCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTc > 4:371460/1‑148 (MQ=255) ggCATATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGTGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCg < 6:246294/149‑1 (MQ=255) ccTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGTGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGAt < 7:33688/149‑1 (MQ=255) ccTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgc < 6:269633‑M2/149‑72 (MQ=255) ccTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGAt > 5:274683/1‑149 (MQ=255) cTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGAt > 5:439826/1‑148 (MQ=255) tATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCa > 7:11046/1‑149 (MQ=255) tATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCa > 8:391513/1‑149 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgcc < 5:154923‑M1/148‑136 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaacccaggcgcctgatcggacgcattcgcgggttaacccgctccttcgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgcccc > 1:301841‑M1/1‑12 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTg > 3:268715/1‑149 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTg > 6:398492/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgac < 6:219843‑M1/149‑141 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTgcg > 1:68834/1‑148 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacctgc < 5:110948‑M2/149‑86 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGtt < 3:371460/149‑1 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGtt > 6:311810/1‑149 (MQ=255) ggTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacc > 8:264298‑M1/1‑4 (MQ=255) ggTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacc < 7:264298‑M1/145‑142 (MQ=255) gTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTc > 2:41856/1‑148 (MQ=255) ttcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacccgctgc < 8:12869‑M1/149‑148 (MQ=255) ttACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAACACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAg > 6:175078/1‑149 (MQ=255) | GCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAG > NC_002947/1967895‑1968191 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |